seq1 = pF1KB6351.tfa, 798 bp
seq2 = pF1KB6351/gi568815588f_52214435.tfa (gi568815588f:52214435_52416804), 202370 bp

>pF1KB6351 798
>gi568815588f:52214435_52416804 (Chr10)

1-243  (100001-100243)   100% ->
244-406  (100489-100651)   100% ->
407-547  (101861-102001)   100% ->
548-798  (102120-102370)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCTCTGGGCGCAGCGGGAGCTACCCGGGTCTTTGTCGCGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCTCTGGGCGCAGCGGGAGCTACCCGGGTCTTTGTCGCGATGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCGGCGGCTCTCGGCGGCCACCCTCTGCTGGGAGTGAGCGCCACCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCGGCGGCTCTCGGCGGCCACCCTCTGCTGGGAGTGAGCGCCACCTTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCGGTTCTCAATTCCAACGCTATCAAGAACCTGCCCCCACCGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCGGTTCTCAATTCCAACGCTATCAAGAACCTGCCCCCACCGCTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGCTGCGGGGCACCCAGGCTCTGCAGTCAGCGCCGCGCCGGGAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCGCTGCGGGGCACCCAGGCTCTGCAGTCAGCGCCGCGCCGGGAATCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTACCCGGGCGGGAATAAGTACCAGACCATTGACAACTACCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100201 GTACCCGGGCGGGAATAAGTACCAGACCATTGACAACTACCAGGTG...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244   CCGTACCCGTGCGCAGAGGACGAGGAGTGCGGCACTGATGAGTACTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100487 AGCCGTACCCGTGCGCAGAGGACGAGGAGTGCGGCACTGATGAGTACTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTAGTCCCACCCGCGGAGGGGACGCAGGCGTGCAAATCTGTCTCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100537 GCTAGTCCCACCCGCGGAGGGGACGCAGGCGTGCAAATCTGTCTCGCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGGAAGCGCCGAAAACGCTGCATGCGTCACGCTATGTGCTGCCCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100587 CAGGAAGCGCCGAAAACGCTGCATGCGTCACGCTATGTGCTGCCCCGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATTACTGCAAAAATG         GAATATGTGTGTCTTCTGATCAAAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100637 ATTACTGCAAAAATGGTG...TAGGAATATGTGTGTCTTCTGATCAAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CATTTCCGAGGAGAAATTGAGGAAACCATCACTGAAAGCTTTGGTAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101887 CATTTCCGAGGAGAAATTGAGGAAACCATCACTGAAAGCTTTGGTAATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCATAGCACCTTGGATGGGTATTCCAGAAGAACCACCTTGTCTTCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101937 TCATAGCACCTTGGATGGGTATTCCAGAAGAACCACCTTGTCTTCAAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGTATCACACCAAAG         GACAAGAAGGTTCTGTTTGTCTCCGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101987 TGTATCACACCAAAGGTA...TAGGACAAGAAGGTTCTGTTTGTCTCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCATCAGACTGTGCCTCAGGATTGTGTTGTGCTAGACACTTCTGGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102146 TCATCAGACTGTGCCTCAGGATTGTGTTGTGCTAGACACTTCTGGTCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GATCTGTAAACCTGTCCTGAAAGAAGGTCAAGTGTGTACCAAGCATAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102196 GATCTGTAAACCTGTCCTGAAAGAAGGTCAAGTGTGTACCAAGCATAGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GAAAAGGCTCTCATGGACTAGAAATATTCCAGCGTTGTTACTGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102246 GAAAAGGCTCTCATGGACTAGAAATATTCCAGCGTTGTTACTGTGGAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGTCTGTCTTGCCGGATACAGAAAGATCACCATCAAGCCAGTAATTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102296 GGTCTGTCTTGCCGGATACAGAAAGATCACCATCAAGCCAGTAATTCTTC

    800     .    :    .    :    .
    774 TAGGCTTCACACTTGTCAGAGACAC
        |||||||||||||||||||||||||
 102346 TAGGCTTCACACTTGTCAGAGACAC