seq1 = pF1KB6348.tfa, 879 bp
seq2 = pF1KB6348/gi568815593f_24070371.tfa (gi568815593f:24070371_24271245), 200875 bp

>pF1KB6348 879
>gi568815593f:24070371_24271245 (Chr5)

1-879  (100001-100875)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCTTTCTGGAGCATGTCTACAAGCTCTGTACGCAAACGATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100001 ATGAACCCTTTCTGGAGCATGTCTACAAGCTCTGTACACAAACGATCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGTGAAGAGAAGACATTAACAGGGGACGTGAAAACCAGTCCTCCACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGTGAAGAGAAGACATTAACAGGGGACGTGAAAACCAGTCCTCCACGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCACCAAAGAAACAGCTGCCTTCTATTCCCAAAAATGCTTTGCCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGCACCAAAGAAACAGCTGCCTTCTATTCCCAAAAATGCTTTGCCCATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTAAGCCTACATCTCCTGCCCCAGCAGCACAGTCAACAAATGGCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTAAGCCTACATCTCCTGCCCCAGCAGCACAGTCAACAAATGGCACGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCGTCCTATGGACCCTTCTACCTGGAATACTCTCTTCTTGCAGAATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCGTCCTATGGACCCTTCTACCTGGAATACTCTCTTCTTGCAGAATTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTTGGTTGTGAAGCAGAAGCTACCAGGCGTCTATGTGCAGCCATCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTTGGTTGTGAAGCAGAAGCTACCAGGCGTCTATGTGCAGCCATCTTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCTCTGCATTAATGTGGTTTGGAGTAATATTCATACGGCATGGACTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100301 CGCTCTGCATTAATGTGGTTTGGAGTAATATTCATACAGCATGGACTTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAAGATGGCGTATTTAAGTTTACAGTTTACATCCCTGATAACTATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAAGATGGCGTATTTAAGTTTACAGTTTACATCCCTGATAACTATCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGGTGACTGTCCACGCTTGGTGTTCGATATTCCTGTCTTTCACCCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGGTGACTGTCCACGCTTGGTGTTCGATATTCCTGTCTTTCACCCGCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTTGATCCCACCTCAGGTGAGCTGGATGTGAAGAGAGCATTTGCAAAATG
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100451 GTTGATCCCACCTCAGGTGAGCTGGACGTGAAGAGAGCATTTGCAAAATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGGCGGAACCATAATCATATTTGGCAGGTATTAATGTATGCAAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGGCGGAACCATAATCATATTTGGTAGGTATTAATGTATGCAAGGAGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTTTCTACAAGATTGATACAGCAAGCCCCCTGAACCCAGAGGCTGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTTTCTACAAGATTGATACAGCAAGCCCCCTGAACCCAGAGGCTGCAGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGTATGAAAAAGATATTCAGCTTTTTAAAAGTAAAGTTGTTGACAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGTATGAAAAAGATATTCAGCTTTTTAAAAGTAAAGTTGTTGACAGTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TAAGGTGTGCACTGCTCGTTTGTTTGACCAACCTAAAATAGAAGACCCCT
        ||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||| ||
 100651 TAAGGTGTGCACTGCTCGTTTG    ACCAACCTAAAATAGAAGACCTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGCAATTAGCTTTTCTCCATGGAATCCTTCTGTACATGATGAAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100697 ATGCAATTAGCTTTTCTCCATGGAATCCTTCTGTACATGATGAAGCCAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 G AAAAGATGCTGACTCAGAAAAAGAAGCCTGAAGAACAGCACAATAAAA
        |-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100747 GTAAAA ATGCTGACTCAGAAAAAGAAGCCTGAAGAACAACACAATAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    800 GTGTTCATGTTGCTGGCCTGTCATGGGTAAAGCCTGGCTCAGTACAGCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
 100796 GTGTTCATGTTGCTGGCCTGTCATGGGTAAAGTCTGGCTCAGTATAGCCT

    850     .    :    .    :    .    :
    850 TTCAGTAAAGAAGAGAAAACAGTGGCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100846 TTCAGTAAAGAAGAGAAAACAGTGGCGACT