seq1 = pF1KB6318.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KB6318/gi568815597r_212638411.tfa (gi568815597r:212638411_212891763), 253353 bp

>pF1KB6318 843
>gi568815597r:212638411_212891763 (Chr1)

(complement)

1-234  (100001-100234)   99% ->
235-313  (104127-104205)   100% ->
314-444  (107271-107401)   100% ->
445-499  (109338-109392)   100% ->
500-567  (152163-152230)   100% ->
568-843  (153078-153353)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGGTTTCCTGAGTTGGTGGTCCTTGACCCTCCATGGGACAAGGA
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGGTCTCCTGAGTTGGTGGTCCTTGACCCTCCATGGGACAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCGCGGCTGGCACAGAGAGCCAGGCCTTGGTCTCCGCCACTCCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCGCGGCTGGCACAGAGAGCCAGGCCTTGGTCTCCGCCACTCCCCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGACTTTCGGGTGCGCTGCACCTCGAAGCGGGCTGTGACCGAAATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGACTTTCGGGTGCGCTGCACCTCGAAGCGGGCTGTGACCGAAATGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAACTGTGCGGCCGCTTCGTGCAAAAGCTCGGGGACGCTCTGCCGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAACTGTGCGGCCGCTTCGTGCAAAAGCTCGGGGACGCTCTGCCGGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATTCGGGAGCCCGCTCTGCGAGATGCGCAGTGG         ACTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100201 GATTCGGGAGCCCGCTCTGCGAGATGCGCAGTGGGTA...CAGACTTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATCAGCTGTGCAAGAGAATATCAGCATTAATGGGCAAGCATGGCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104134 AATCAGCTGTGCAAGAGAATATCAGCATTAATGGGCAAGCATGGCAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTTCAGATAATTGTTTTATGG         ATTCTGACATCAAAGTACT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 104184 GCTTCAGATAATTGTTTTATGGGTA...TAGATTCTGACATCAAAGTACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAAGATCAGTTTGATGAAATCATAGTAGATATAGCCACAAAACGTAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107290 TGAAGATCAGTTTGATGAAATCATAGTAGATATAGCCACAAAACGTAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTATCCCAGAAAGATCCTGGAATGTGTCATCAAAACCATAAAAGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107340 AGTATCCCAGAAAGATCCTGGAATGTGTCATCAAAACCATAAAAGCAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAAGAAATTCTG         AAGCAGTACCACCCTGTTGTACATCCACT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107390 CAAGAAATTCTGGTA...TAGAAGCAGTACCACCCTGTTGTACATCCACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGACCTAAAATATGACCCTGATCCAG         CCCCTCATATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 109367 GGACCTAAAATATGACCCTGATCCAGGTG...CAGCCCCTCATATGGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATTTGAAATGCAGAGGGGAAACAGTAGCAAAGGAGATCAGTGAAGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152178 ATTTGAAATGCAGAGGGGAAACAGTAGCAAAGGAGATCAGTGAAGCCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAG         TCCTTGCCTGCATTAATTGAACAAGGAGAGGGATTTTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152228 AAGGTA...AAGTCCTTGCCTGCATTAATTGAACAAGGAGAGGGATTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAAGTTCTCAGGATGCAGCCTGTTATCCACCTCCAGAGGATTCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153116 CCAAGTTCTCAGGATGCAGCCTGTTATCCACCTCCAGAGGATTCACCAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGTCTTTTCCAGTTGTCATAGGAAACCAGATGCTAAACCTGAGAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153166 AAGTCTTTTCCAGTTGTCATAGGAAACCAGATGCTAAACCTGAGAACTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATAACACAGATAGAAACCACACCAACAGAGACTGCTTCCAGGAAAACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153216 ATAACACAGATAGAAACCACACCAACAGAGACTGCTTCCAGGAAAACCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGACGTGGTACTGAAAAGAAAGCAAACTAAAGACTGCCCCCAGAGAAAAT
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153266 TGACATGGTACTGAAAAGAAAGCAAACTAAAGACTGCCCCCAGAGAAAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .
    806 GGTATCCATTGCGGCCAAAGAAAATTAATCTTGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153316 GGTATCCATTGCGGCCAAAGAAAATTAATCTTGATACA