seq1 = pF1KB6292.tfa, 2367 bp
seq2 = pF1KB6292/gi568815592f_105988267.tfa (gi568815592f:105988267_106207483), 219217 bp

>pF1KB6292 2367
>gi568815592f:105988267_106207483 (Chr6)

1-183  (100001-100183)   100% ->
184-303  (107349-107468)   100% ->
304-556  (111034-111286)   99% ->
557-1665  (116559-117667)   100% ->
1666-1794  (118105-118233)   100% ->
1795-2367  (118645-119217)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAATGGACATGGAGGATGCGGATATGACTCTGTGGACAGAGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAATGGACATGGAGGATGCGGATATGACTCTGTGGACAGAGGCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTTGAAGAGAAGTGTACATACATTGTGAACGACCACCCCTGGGATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTTGAAGAGAAGTGTACATACATTGTGAACGACCACCCCTGGGATTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGCTGATGGCGGTACTTCGGTTCAGGCGGAGGCATCCTTACCAAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGCTGATGGCGGTACTTCGGTTCAGGCGGAGGCATCCTTACCAAGGAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTTTTCAAGTATGCCACCAACAGTGAAGAG         GTTATTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100151 CTGCTTTTCAAGTATGCCACCAACAGTGAAGAGGTA...TAGGTTATTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGATGAGTAAAGAATACATACCAAAGGGCACACGTTTTGGACCCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107357 AGTGATGAGTAAAGAATACATACCAAAGGGCACACGTTTTGGACCCCTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAGGTGAAATCTACACCAATGACACAGTTCCTAAGAACGCCAACAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107407 TAGGTGAAATCTACACCAATGACACAGTTCCTAAGAACGCCAACAGGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TATTTTTGGAGG         ATCTATTCCAGAGGGGAGCTTCACCACTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107457 TATTTTTGGAGGGTA...CAGATCTATTCCAGAGGGGAGCTTCACCACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATTGACGGCTTTAATGAAGAGAAAAGCAACTGGATGCGCTATGTGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111063 CATTGACGGCTTTAATGAAGAGAAAAGCAACTGGATGCGCTATGTGAATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAGCACACTCTCCCCGGGAGCAAAACCTGGCTGCGTGTCAGAACGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111113 CAGCACACTCTCCCCGGGAGCAAAACCTGGCTGCGTGTCAGAACGGGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AACATCTACTTCTACACCATTAAGCCCATCCCTGCCAACCAGGAACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111163 AACATCTACTTCTACACCATTAAGCCCATCCCTGCCAACCAGGAACTTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGTGTGGTATTGTCGGGAGTTTGCAGAAAGGCTTCACTACCCTTATCCCG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 111213 TGTGTGGTATTGTCGGGACTTTGCAGAAAGGCTTCACTACCCTTATCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAGAGCTGACAATGATGAATCTCA         CACAAACACAGAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 111263 GAGAGCTGACAATGATGAATCTCAGTA...CAGCACAAACACAGAGCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTAAAGCAACCGAGCACTGAGAAAAATGAACTCTGCCCAAAGAATGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116576 CTAAAGCAACCGAGCACTGAGAAAAATGAACTCTGCCCAAAGAATGTCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAAGAGAGAGTACAGCGTGAAAGAAATCCTAAAATTGGACTCCAACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116626 AAAGAGAGAGTACAGCGTGAAAGAAATCCTAAAATTGGACTCCAACCCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCAAAGGAAAGGACCTCTACCGTTCTAACATTTCACCCCTCACATCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116676 CCAAAGGAAAGGACCTCTACCGTTCTAACATTTCACCCCTCACATCAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAGGACCTCGATGACTTTAGAAGACGTGGGAGCCCCGAAATGCCCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116726 AAGGACCTCGATGACTTTAGAAGACGTGGGAGCCCCGAAATGCCCTTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCCTCGGGTCGTTTACCCCATCCGGGCCCCTCTGCCAGAAGACTTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116776 CCCTCGGGTCGTTTACCCCATCCGGGCCCCTCTGCCAGAAGACTTTTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AAGCTTCCCTGGCCTACGGGATCGAGAGACCCACGTACATCACTCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116826 AAGCTTCCCTGGCCTACGGGATCGAGAGACCCACGTACATCACTCGCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CCCATTCCATCCTCCACCACTCCAAGCCCCTCTGCAAGAAGCAGCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116876 CCCATTCCATCCTCCACCACTCCAAGCCCCTCTGCAAGAAGCAGCCCCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCAAAGCCTCAAGAGCTCCAGCCCTCACAGCAGCCCTGGGAATACGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116926 CCAAAGCCTCAAGAGCTCCAGCCCTCACAGCAGCCCTGGGAATACGGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCCCTGTGGGCCCCGGCTCTCAAGAGCACCGGGACTCCTACGCTTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116976 CCCCTGTGGGCCCCGGCTCTCAAGAGCACCGGGACTCCTACGCTTACTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AACGCGTCCTACGGCACGGAAGGTTTGGGCTCCTACCCTGGCTACGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117026 AACGCGTCCTACGGCACGGAAGGTTTGGGCTCCTACCCTGGCTACGCACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCTGCCCCACCTCCCGCCAGCTTTCATCCCCTCGTACAACGCTCACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117076 CCTGCCCCACCTCCCGCCAGCTTTCATCCCCTCGTACAACGCTCACTACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CCAAGTTCCTCTTGCCCCCCTACGGCATGAATTGTAATGGCCTGAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117126 CCAAGTTCCTCTTGCCCCCCTACGGCATGAATTGTAATGGCCTGAGCGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GTGAGCAGCATGAATGGCATCAACAACTTTGGCCTCTTCCCGAGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117176 GTGAGCAGCATGAATGGCATCAACAACTTTGGCCTCTTCCCGAGGCTGTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CCCTGTCTACAGCAATCTCCTCGGTGGGGGCAGCCTGCCCCACCCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117226 CCCTGTCTACAGCAATCTCCTCGGTGGGGGCAGCCTGCCCCACCCCATGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCAACCCCACTTCTCTCCCGAGCTCGCTGCCCTCAGATGGAGCCCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117276 TCAACCCCACTTCTCTCCCGAGCTCGCTGCCCTCAGATGGAGCCCGGAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TTGCTCCAGCCGGAGCATCCCAGGGAGGTGCTTGTCCCGGCGCCCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117326 TTGCTCCAGCCGGAGCATCCCAGGGAGGTGCTTGTCCCGGCGCCCCACAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TGCCTTCTCCTTTACCGGGGCCGCCGCCAGCATGAAGGACAAGGCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117376 TGCCTTCTCCTTTACCGGGGCCGCCGCCAGCATGAAGGACAAGGCCTGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GCCCCACAAGCGGGTCTCCCACGGCGGGAACAGCCGCCACGGCAGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117426 GCCCCACAAGCGGGTCTCCCACGGCGGGAACAGCCGCCACGGCAGAACAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GTGGTGCAGCCCAAAGCTACCTCAGCAGCGATGGCAGCCCCCAGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117476 GTGGTGCAGCCCAAAGCTACCTCAGCAGCGATGGCAGCCCCCAGCAGCGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CGAAGCCATGAATCTCATTAAAAACAAAAGAAACATGACCGGCTACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117526 CGAAGCCATGAATCTCATTAAAAACAAAAGAAACATGACCGGCTACAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 CCCTTCCCTACCCGCTGAAGAAGCAGAACGGCAAGATCAAGTACGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117576 CCCTTCCCTACCCGCTGAAGAAGCAGAACGGCAAGATCAAGTACGAATGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 AACGTTTGCGCCAAGACTTTCGGCCAGCTCTCCAATCTGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 117626 AACGTTTGCGCCAAGACTTTCGGCCAGCTCTCCAATCTGAAGGTA...CA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666  GTCCACCTGAGAGTGCACAGTGGAGAACGGCCTTTCAAATGTCAGACTT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118104 GGTCCACCTGAGAGTGCACAGTGGAGAACGGCCTTTCAAATGTCAGACTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 GCAACAAGGGCTTTACTCAGCTCGCCCACCTGCAGAAACACTACCTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118154 GCAACAAGGGCTTTACTCAGCTCGCCCACCTGCAGAAACACTACCTGGTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 CACACGGGAGAAAAGCCACATGAATGCCAG         GTCTGCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 118204 CACACGGGAGAAAAGCCACATGAATGCCAGGTG...TAGGTCTGCCACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GAGATTTAGCAGCACCAGCAATCTCAAGACCCACCTGCGACTCCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118656 GAGATTTAGCAGCACCAGCAATCTCAAGACCCACCTGCGACTCCATTCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 GAGAGAAACCATACCAATGCAAGGTGTGCCCTGCCAAGTTCACCCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118706 GAGAGAAACCATACCAATGCAAGGTGTGCCCTGCCAAGTTCACCCAGTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 GTGCACCTGAAACTGCACAAGCGTCTGCACACCCGGGAGCGGCCCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118756 GTGCACCTGAAACTGCACAAGCGTCTGCACACCCGGGAGCGGCCCCACAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 GTGCTCCCAGTGCCACAAGAACTACATCCATCTCTGTAGCCTCAAGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118806 GTGCTCCCAGTGCCACAAGAACTACATCCATCTCTGTAGCCTCAAGGTTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 ACCTGAAAGGGAACTGCGCTGCGGCCCCGGCGCCTGGGCTGCCCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118856 ACCTGAAAGGGAACTGCGCTGCGGCCCCGGCGCCTGGGCTGCCCTTGGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 GATCTGACCCGAATCAATGAAGAAATCGAGAAGTTTGACATCAGTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118906 GATCTGACCCGAATCAATGAAGAAATCGAGAAGTTTGACATCAGTGACAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 TGCTGACCGGCTCGAGGACGTGGAGGATGACATCAGTGTGATCTCTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118956 TGCTGACCGGCTCGAGGACGTGGAGGATGACATCAGTGTGATCTCTGTAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 TGGAGAAGGAAATTCTGGCCGTGGTCAGAAAAGAGAAAGAAGAAACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119006 TGGAGAAGGAAATTCTGGCCGTGGTCAGAAAAGAGAAAGAAGAAACTGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 CTGAAAGTGTCTTTGCAAAGAAACATGGGGAATGGACTCCTCTCCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119056 CTGAAAGTGTCTTTGCAAAGAAACATGGGGAATGGACTCCTCTCCTCAGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 GTGCAGCCTTTATGAGTCATCAGATCTACCCCTCATGAAGTTGCCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119106 GTGCAGCCTTTATGAGTCATCAGATCTACCCCTCATGAAGTTGCCTCCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 GCAACCCACTACCTCTGGTACCTGTAAAGGTCAAACAAGAAACAGTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119156 GCAACCCACTACCTCTGGTACCTGTAAAGGTCAAACAAGAAACAGTTGAA

   2400     .    :
   2356 CCAATGGATCCT
        ||||||||||||
 119206 CCAATGGATCCT