seq1 = pF1KB6285.tfa, 2586 bp
seq2 = pF1KB6285/gi568815580f_26126934.tfa (gi568815580f:26126934_26490009), 363076 bp

>pF1KB6285 2586
>gi568815580f:26126934_26490009 (Chr18)

1-343  (100001-100343)   100% ->
344-489  (138237-138382)   100% ->
490-597  (140583-140690)   100% ->
598-759  (147730-147891)   100% ->
760-882  (147998-148120)   100% ->
883-972  (155038-155127)   100% ->
973-1590  (158949-159566)   100% ->
1591-1726  (165313-165448)   100% ->
1727-1832  (166493-166598)   99% ->
1833-2002  (188296-188465)   100% ->
2003-2133  (194137-194267)   100% ->
2134-2259  (200082-200207)   100% ->
2260-2316  (208242-208298)   100% ->
2317-2421  (230757-230861)   100% ->
2422-2586  (262912-263076)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCCGGCCTCACCGAACCCGCCGGCGCCGCTCCCCCGGCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGCCGGCCTCACCGAACCCGCCGGCGCCGCTCCCCCGGCTGCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCGCCTCGGGGACCGTGACCATGGCCCCGGCCGGGGCGCTGCCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCGCCTCGGGGACCGTGACCATGGCCCCGGCCGGGGCGCTGCCGGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGTGGAGAGCACTCCGGTGGCCCTGGGCGCCGTGACTAAGGCTCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTGGAGAGCACTCCGGTGGCCCTGGGCGCCGTGACTAAGGCTCCTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCGTCTGCGTGGAGCCCACGGCGTCCCAGCCCCTGCGGTCCCCCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCGTCTGCGTGGAGCCCACGGCGTCCCAGCCCCTGCGGTCCCCCGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACCCTGGTGACCAAAGTGGCTCCGGTCAGCGCCCCTCCTAAAGTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACCCTGGTGACCAAAGTGGCTCCGGTCAGCGCCCCTCCTAAAGTCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGGCCCTAGGCTGCCTGCTCCTCAGATAGTCGCCGTGAAAGCCCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGGCCCTAGGCTGCCTGCTCCTCAGATAGTCGCCGTGAAAGCCCCCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCACGACAATCCAGTTTCCTGCTAATTTGCAGCTTCCTCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100301 ACCACGACAATCCAGTTTCCTGCTAATTTGCAGCTTCCTCCAGGTA...T

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    344   GAACCGTTTTGATTAAAAGTAACAGTGGTCCGTTGATGTTGGTATCTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138235 AGGAACCGTTTTGATTAAAAGTAACAGTGGTCCGTTGATGTTGGTATCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTCAGCAAACTGTAACAAGAGCCGAGACCACAAGTAACATAACCTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138285 CTCAGCAAACTGTAACAAGAGCCGAGACCACAAGTAACATAACCTCAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCAGCAGTACCAGCGAATCCTCAAACAGTCAAAATCTGTACAGTGCCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 138335 CCAGCAGTACCAGCGAATCCTCAAACAGTCAAAATCTGTACAGTGCCGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    490        AACTCTAGCTCACAATTAATCAAGAAAGTGGCAGTGACACCTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138385 A...AAGAACTCTAGCTCACAATTAATCAAGAAAGTGGCAGTGACACCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTAAAAAATTGGCACAAATAGGAACTACTGTGGTAACCACTGTTCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140626 TTAAAAAATTGGCACAAATAGGAACTACTGTGGTAACCACTGTTCCGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCTTCCTCAGTACAA         TCTGTGGCTGTGCCAACCAGTGTCGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 140676 CCTTCCTCAGTACAAGTA...CAGTCTGTGGCTGTGCCAACCAGTGTCGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACAGTTACTCCTGGAAAGCCATTGAATACTGTAACTACCCTGAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147756 CACAGTTACTCCTGGAAAGCCATTGAATACTGTAACTACCCTGAAGCCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAAGTTTGGGAGCATCATCCACTCCTTCAAATGAGCCCAATCTTAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147806 CAAGTTTGGGAGCATCATCCACTCCTTCAAATGAGCCCAATCTTAAAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAGAACTCAGCAGCTGTTCAGATTAATCTTTCTCCG         ACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 147856 GAGAACTCAGCAGCTGTTCAGATTAATCTTTCTCCGGTA...TAGACAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCTAGAAAATGTGAAGAAATGCAAGAACTTCCTTGCAATGTTAATAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148003 GCTAGAAAATGTGAAGAAATGCAAGAACTTCCTTGCAATGTTAATAAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TAGCATGTAGTGGATCACAGTCCCCAGAAATGGGGCAAAATGTGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148053 TAGCATGTAGTGGATCACAGTCCCCAGAAATGGGGCAAAATGTGAAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTGGTGGAACAACTTTTG         GATGCAAAAATCGAAGCAGAAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 148103 CTGGTGGAACAACTTTTGGTA...CAGGATGCAAAAATCGAAGCAGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ATTTACTAGGAAACTGTATGTTGAACTCAAGTCTTCACCTCAGCCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155061 ATTTACTAGGAAACTGTATGTTGAACTCAAGTCTTCACCTCAGCCTCACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGTTCCTTTTCTTAAG         AAAAGCGTGGTTGCCTTACGACAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 155111 TGGTTCCTTTTCTTAAGGTA...CAGAAAAGCGTGGTTGCCTTACGACAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTTCTGCCTAACTCCCAGAGCTTCATCCAGCAATGTGTTCAGCAGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158973 CTTCTGCCTAACTCCCAGAGCTTCATCCAGCAATGTGTTCAGCAGACTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TAGTGACATGGTCATTGCTACCTGTACTACAACAGTAACAACTTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159023 TAGTGACATGGTCATTGCTACCTGTACTACAACAGTAACAACTTCTCCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGTGACAACTACAGTGTCCTCAAGCCAGTCTGAAAAGTCAATTATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159073 TGGTGACAACTACAGTGTCCTCAAGCCAGTCTGAAAAGTCAATTATTGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TCTGGAGCAACAGCACCCAGAACTGTGTCAGTGCAAACTTTGAACCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159123 TCTGGAGCAACAGCACCCAGAACTGTGTCAGTGCAAACTTTGAACCCACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGCTGGTCCAGTGGGAGCAAAAGCTGGAGTTGTGACACTTCATTCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159173 TGCTGGTCCAGTGGGAGCAAAAGCTGGAGTTGTGACACTTCATTCTGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GCCCAACTGCTGCAACAGGAGGAACAACAGCTGGAACTGGTTTGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159223 GCCCAACTGCTGCAACAGGAGGAACAACAGCTGGAACTGGTTTGCTTCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ACTTCAAAACCACTTGTGACATCTGTGGCAAACACAGTGACCACGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159273 ACTTCAAAACCACTTGTGACATCTGTGGCAAACACAGTGACCACGGTCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 ACTGCAACCTGAAAAGCCAGTTGTCTCTGGAACAGCAGTAACACTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159323 ACTGCAACCTGAAAAGCCAGTTGTCTCTGGAACAGCAGTAACACTGTCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TTCCAGCAGTAACTTTTGGAGAAACTTCAGGTGCAGCTATTTGTCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159373 TTCCAGCAGTAACTTTTGGAGAAACTTCAGGTGCAGCTATTTGTCTTCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 TCTGTGAAACCTGTTGTTTCTTCTGCTGGGACCACATCTGACAAGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159423 TCTGTGAAACCTGTTGTTTCTTCTGCTGGGACCACATCTGACAAGCCTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 TATTGGGACTCCAGTTCAAATCAAACTTGCCCAGCCGGGCCCTGTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159473 TATTGGGACTCCAGTTCAAATCAAACTTGCCCAGCCGGGCCCTGTCCTTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CACAACCAGCTGGGATTCCACAGGCAGTTCAAGTCAAGCAACTA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 159523 CACAACCAGCTGGGATTCCACAGGCAGTTCAAGTCAAGCAACTAGTG...

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1591    GTAGTTCAGCAGCCTTCAGGAGGCAATGAAAAACAAGTGACCACAAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165310 CAGGTAGTTCAGCAGCCTTCAGGAGGCAATGAAAAACAAGTGACCACAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 TTCACATTCCTCAACATTGACCATTCAGAAATGTGGACAGAAGACGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165360 TTCACATTCCTCAACATTGACCATTCAGAAATGTGGACAGAAGACGATGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CAGTGAACACCATAATACCTACTAGTCAGTTTCCTCCAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 165410 CAGTGAACACCATAATACCTACTAGTCAGTTTCCTCCAGGTA...TAGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TCCATTCTAAAGCAAATTACTCTGCCTGGAAATAAAATTCTGTCACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166495 TCCATTCTAAAGCAAATTACTCTGCCTGGAAATAAAATTCTGTCACTTCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 AGCATCTCCTACTCAGAAAAACAGAATAAAAGAGAATGTAACATCATGCT
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 166545 AGCATCTCCTACTCAGAAAAATAGAATAAAAGAGAATGTAACATCATGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 TCCG         AGATGAGGATGACATCAATGATGTGACTTCTATGGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166595 TCCGGTA...TAGAGATGAGGATGACATCAATGATGTGACTTCTATGGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GGGGTCAACCTTAATGAAGAAAATGCCTGCATCTTAGCAACAAACTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188333 GGGGTCAACCTTAATGAAGAAAATGCCTGCATCTTAGCAACAAACTCTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 ATTGGTTGGCACACTCATTCAGTCATGTAAAGATGAACCATTTCTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188383 ATTGGTTGGCACACTCATTCAGTCATGTAAAGATGAACCATTTCTTTTTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 TTGGAGCTCTACAAAAGAGAATTTTAGACATTG         GTAAAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 188433 TTGGAGCTCTACAAAAGAGAATTTTAGACATTGGTA...CAGGTAAAAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 CATGACATTACAGAACTTAACTCTGATGCTGTGAACTTGATCTCCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194145 CATGACATTACAGAACTTAACTCTGATGCTGTGAACTTGATCTCCCAAGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 AACACAGGAACGACTACGAGGCCTTCTAGAAAAACTGACTGCAATTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194195 AACACAGGAACGACTACGAGGCCTTCTAGAAAAACTGACTGCAATTGCTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 AGCATCGAATGACTACTTACAAG         GCAAGTGAAAATTACATC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 194245 AGCATCGAATGACTACTTACAAGGTA...CAGGCAAGTGAAAATTACATC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 CTGTGTAGTGATACCAGGTCACAGCTCAAATTTCTTGAAAAGCTGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200100 CTGTGTAGTGATACCAGGTCACAGCTCAAATTTCTTGAAAAGCTGGATCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 ATTGGAGAAGCAGAGAAAGGATTTGGAAGAAAGAGAAATGTTACTTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200150 ATTGGAGAAGCAGAGAAAGGATTTGGAAGAAAGAGAAATGTTACTTAAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 CAGCCAAG         AGTCGTTCTAATAAAGAAGATCCAGAACAGCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 200200 CAGCCAAGGTA...TAGAGTCGTTCTAATAAAGAAGATCCAGAACAGCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 AGATTAAAGCAGAAAGCCAAAGAG         TTACAGCAATTGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 208275 AGATTAAAGCAGAAAGCCAAAGAGGTA...TAGTTACAGCAATTGGAACT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 TGCACAGATACAGCATAGAGACGCTAATCTCACAGCTCTTGCAGCTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230774 TGCACAGATACAGCATAGAGACGCTAATCTCACAGCTCTTGCAGCTATTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 GACCAAGGAAGAAGAGACCACTAGAATCTGGAATTGAG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 230824 GACCAAGGAAGAAGAGACCACTAGAATCTGGAATTGAGGTA...TAGGGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 TTAAAAGACAACCTTCTTGCTTCTGGGACATCCAGCCTGACAGCCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 262915 TTAAAAGACAACCTTCTTGCTTCTGGGACATCCAGCCTGACAGCCACCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 ACAGTTGCATCGTCCAAGAATCACGAGAATCTGCCTCAGGGACTTGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 262965 ACAGTTGCATCGTCCAAGAATCACGAGAATCTGCCTCAGGGACTTGATAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 TTTGTATGGAACAGGAACGGGAGATGAAGTATTCTCGAGCTCTATACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263015 TTTGTATGGAACAGGAACGGGAGATGAAGTATTCTCGAGCTCTATACCTG

   2700     .    :
   2575 GCCCTTCTGAAG
        ||||||||||||
 263065 GCCCTTCTGAAG