seq1 = pF1KB6272.tfa, 2319 bp
seq2 = pF1KB6272/gi568815580r_55128228.tfa (gi568815580r:55128228_55735897), 607670 bp

>pF1KB6272 2319
>gi568815580r:55128228_55735897 (Chr18)

(complement)

1-195  (100001-100195)   100% ->
196-286  (104510-104600)   100% ->
287-378  (148762-148853)   100% ->
379-451  (150546-150618)   100% ->
452-513  (271761-271822)   100% ->
514-610  (274783-274879)   100% ->
611-675  (332380-332444)   100% ->
676-805  (384895-385024)   100% ->
806-855  (385490-385539)   100% ->
856-961  (456242-456347)   100% ->
962-1095  (460146-460279)   100% ->
1096-1228  (465935-466067)   100% ->
1229-1296  (474365-474432)   100% ->
1297-1375  (475871-475949)   100% ->
1376-1452  (478507-478583)   100% ->
1453-1656  (481198-481401)   100% ->
1657-1792  (501215-501350)   100% ->
1793-1955  (503227-503389)   100% ->
1956-2185  (506822-507051)   100% ->
2186-2319  (507537-507670)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTCTAAAAGGCTGGAGAAAATACCACAGGTGCCTCTCCTCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTTCTAAAAGGCTGGAGAAAATACCACAGGTGCCTCTCCTCTTTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCATCTTCATCATTTTGACAAATTACTCAAAGATGGAGGGTGCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCATCTTCATCATTTTGACAAATTACTCAAAGATGGAGGGTGCAGTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAGCCAGCCATCATTTTTTAAAACTTCTCAGGACATTGTAACATGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAGCCAGCCATCATTTTTTAAAACTTCTCAGGACATTGTAACATGCACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGGTTGAGAACTGCTACTCGAGCTTCTCCAGGAGGCCCTTGGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100151 TGGGTTGAGAACTGCTACTCGAGCTTCTCCAGGAGGCCCTTGGAGGTA..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196     CAAATGTTTTGTAAACACCAATCTAAGAACATTATCTCTTGGACGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 .CAGCAAATGTTTTGTAAACACCAATCTAAGAACATTATCTCTTGGACGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104556 GCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     GTTTGTGTGATTTTGCTAAAATGCATCACCAACAGCGAATGGCTGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104606 .TAGGTTTGTGTGATTTTGCTAAAATGCATCACCAACAGCGAATGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTAGGGACGGACAAAGAGCTGAGTGATTTACTGGATTTCAGTGCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 148808 CTTAGGGACGGACAAAGAGCTGAGTGATTTACTGGATTTCAGTGCGGTA.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379      ATGTTTTCACCTCCTGTGAGCAGTGGGAAAAATGGACCAACTTCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148858 ..TAGATGTTTTCACCTCCTGTGAGCAGTGGGAAAAATGGACCAACTTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTGGCAAGTGGACATTTTACTGGCTCAA         ATGTAGAAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 150591 TTGGCAAGTGGACATTTTACTGGCTCAAGTA...TAGATGTAGAAGACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAGTAGCTCAGGGTCCTGGGGGAATGGAGGACATCCAAGCCCGTCCAGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 271774 AAGTAGCTCAGGGTCCTGGGGGAATGGAGGACATCCAAGCCCGTCCAGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514         AACTATGGAGATGGGACTCCCTATGACCACATGACCAGCAGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271824 TA...CAGAACTATGGAGATGGGACTCCCTATGACCACATGACCAGCAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACCTTGGGTCACATGACAATCTCTCTCCACCTTTTGTCAATTCCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 274825 GACCTTGGGTCACATGACAATCTCTCTCCACCTTTTGTCAATTCCAGAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACAAA         GTAAAACAGAAAGGGGCTCATACTCATCTTATGGGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 274875 ACAAAGTA...CAGGTAAAACAGAAAGGGGCTCATACTCATCTTATGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GAGAATCAAACTTACAGGGTTGCCACCAG         CAGAGTCTCCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 332416 GAGAATCAAACTTACAGGGTTGCCACCAGGTA...TAGCAGAGTCTCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GGAGGTGACATGGATATGGGCAACCCAGGAACCCTTTCGCCCACCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 384907 GGAGGTGACATGGATATGGGCAACCCAGGAACCCTTTCGCCCACCAAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGGTTCCCAGTACTATCAGTATTCTAGCAATAATCCCCGAAGGAGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 384957 TGGTTCCCAGTACTATCAGTATTCTAGCAATAATCCCCGAAGGAGGCCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTCACAGTAGTGCCATGG         AGGTACAGACAAAGAAAGTTCGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 385007 TTCACAGTAGTGCCATGGGTA...CAGAGGTACAGACAAAGAAAGTTCGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAAGTTCCTCCAGGTTTGCCATCTTCA         GTCTATGCTCCATC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 385513 AAAGTTCCTCCAGGTTTGCCATCTTCAGTA...CAGGTCTATGCTCCATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 AGCAAGCACTGCCGACTACAATAGGGACTCGCCAGGCTATCCTTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 456256 AGCAAGCACTGCCGACTACAATAGGGACTCGCCAGGCTATCCTTCCTCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AACCAGCAACCAGCACTTTCCCTAGCTCCTTCTTCATGCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 456306 AACCAGCAACCAGCACTTTCCCTAGCTCCTTCTTCATGCAAGGTA...CA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    962  ATGGCCATCACAGCAGTGACCCTTGGAGCTCCTCCAGTGGGATGAATCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460145 GATGGCCATCACAGCAGTGACCCTTGGAGCTCCTCCAGTGGGATGAATCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GCCTGGCTATGCAGGAATGTTGGGCAACTCTTCTCATATTCCACAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460195 GCCTGGCTATGCAGGAATGTTGGGCAACTCTTCTCATATTCCACAGTCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GCAGCTACTGTAGCCTGCATCCACATGAACGTTTG         AGCTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 460245 GCAGCTACTGTAGCCTGCATCCACATGAACGTTTGGTA...TAGAGCTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CCATCACACTCCTCAGCAGACATCAATTCCAGTCTTCCTCCGATGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 465941 CCATCACACTCCTCAGCAGACATCAATTCCAGTCTTCCTCCGATGTCCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TTTCCATCGTAGTGGTACAAACCATTACAGCACCTCTTCCTGTACGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 465991 TTTCCATCGTAGTGGTACAAACCATTACAGCACCTCTTCCTGTACGCCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CTGCCAACGGGACAGACAGTATAATGG         CAAATAGAGGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 466041 CTGCCAACGGGACAGACAGTATAATGGGTG...CAGCAAATAGAGGAAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GGGGCAGCCGGCAGCTCCCAGACTGGAGATGCTCTGGGGAAAGCACTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 474379 GGGGCAGCCGGCAGCTCCCAGACTGGAGATGCTCTGGGGAAAGCACTTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TTCG         ATCTATTCTCCAGATCACACTAACAACAGCTTTTCAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 474429 TTCGGTG...AAGATCTATTCTCCAGATCACACTAACAACAGCTTTTCAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 CAAACCCTTCAACTCCTGTTGGCTCTCCTCCATCTCTCTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 475908 CAAACCCTTCAACTCCTGTTGGCTCTCCTCCATCTCTCTCAGGTA...CA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1376  CAGGCACAGCTGTTTGGTCTAGAAATGGAGGACAGGCCTCATCGTCTCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 478506 GCAGGCACAGCTGTTTGGTCTAGAAATGGAGGACAGGCCTCATCGTCTCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 TAATTATGAAGGACCCTTACACTCTTTG         CAAAGCCGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 478556 TAATTATGAAGGACCCTTACACTCTTTGGTA...CAGCAAAGCCGAATTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 AAGATCGTTTAGAAAGACTGGATGATGCTATTCATGTTCTCCGGAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 481211 AAGATCGTTTAGAAAGACTGGATGATGCTATTCATGTTCTCCGGAACCAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 GCAGTGGGCCCATCCACAGCTATGCCTGGTGGTCATGGGGACATGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 481261 GCAGTGGGCCCATCCACAGCTATGCCTGGTGGTCATGGGGACATGCATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 AATCATTGGACCTTCTCATAATGGAGCCATGGGTGGTCTGGGCTCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 481311 AATCATTGGACCTTCTCATAATGGAGCCATGGGTGGTCTGGGCTCAGGGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 ATGGAACCGGCCTTCTTTCAGCCAACAGACATTCACTCATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 481361 ATGGAACCGGCCTTCTTTCAGCCAACAGACATTCACTCATGGTA...CAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GTGGGGACCCATCGTGAAGATGGCGTGGCCCTGAGAGGCAGCCATTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 501215 GTGGGGACCCATCGTGAAGATGGCGTGGCCCTGAGAGGCAGCCATTCTCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 TCTGCCAAACCAGGTTCCGGTTCCACAGCTTCCTGTCCAGTCTGCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 501265 TCTGCCAAACCAGGTTCCGGTTCCACAGCTTCCTGTCCAGTCTGCGACTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 CCCCTGACCTGAACCCACCCCAGGACCCTTACAGAG         GCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 501315 CCCCTGACCTGAACCCACCCCAGGACCCTTACAGAGGTA...CAGGCATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 CCACCAGGACTACAGGGGCAGAGTGTCTCCTCTGGCAGCTCTGAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 503232 CCACCAGGACTACAGGGGCAGAGTGTCTCCTCTGGCAGCTCTGAGATCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 ATCCGATGACGAGGGTGATGAGAACCTGCAAGACACGAAATCTTCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 503282 ATCCGATGACGAGGGTGATGAGAACCTGCAAGACACGAAATCTTCGGAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 ACAAGAAATTAGATGACGACAAGAAGGATATCAAATCAATTACTAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 503332 ACAAGAAATTAGATGACGACAAGAAGGATATCAAATCAATTACTAGGTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 AGATCTAG         CAATAATGACGATGAGGACCTGACACCAGAGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 503382 AGATCTAGGTA...CAGCAATAATGACGATGAGGACCTGACACCAGAGCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 GAAGGCAGAGCGTGAGAAGGAGCGGAGGATGGCCAACAATGCCCGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506855 GAAGGCAGAGCGTGAGAAGGAGCGGAGGATGGCCAACAATGCCCGAGAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 GTCTGCGGGTCCGTGACATCAACGAGGCTTTCAAAGAGCTCGGCCGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506905 GTCTGCGGGTCCGTGACATCAACGAGGCTTTCAAAGAGCTCGGCCGCATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GTGCAGCTCCACCTCAAGAGTGACAAGCCCCAGACCAAGCTCCTGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506955 GTGCAGCTCCACCTCAAGAGTGACAAGCCCCAGACCAAGCTCCTGATCCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CCACCAGGCGGTGGCCGTCATCCTCAGTCTGGAGCAGCAAGTCCGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 507005 CCACCAGGCGGTGGCCGTCATCCTCAGTCTGGAGCAGCAAGTCCGAGGTC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2186       AAAGGAATCTGAATCCGAAAGCTGCGTGTCTGAAAAGAAGGGAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 507055 ...CAGAAAGGAATCTGAATCCGAAAGCTGCGTGTCTGAAAAGAAGGGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 GAAGAGAAGGTGTCCTCGGAGCCTCCCCCTCTCTCCTTGGCCGGCCCACA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 507581 GAAGAGAAGGTGTCCTCAGAGCCTCCCCCTCTCTCCTTGGCCGGCCCACA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CCCTGGAATGGGAGACGCATCGAATCACATGGGACAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 507631 CCCTGGAATGGGAGACGCATCGAATCACATGGGACAGATG