seq1 = pF1KB6257.tfa, 2289 bp
seq2 = pF1KB6257/gi568815586r_23434222.tfa (gi568815586r:23434222_24049601), 615380 bp

>pF1KB6257 2289
>gi568815586r:23434222_24049601 (Chr12)

(complement)

1-38  (100001-100038)   100% ->
39-270  (153578-153809)   100% ->
271-481  (203409-203619)   100% ->
482-568  (293878-293964)   100% ->
569-741  (308563-308735)   100% ->
742-810  (314850-314918)   100% ->
811-931  (384038-384158)   100% ->
932-1017  (408705-408790)   100% ->
1018-1164  (445069-445215)   100% ->
1165-1342  (473764-473941)   100% ->
1343-1488  (486199-486344)   100% ->
1489-1597  (503178-503286)   100% ->
1598-1771  (506218-506391)   100% ->
1772-1988  (512933-513149)   100% ->
1989-2289  (515080-515380)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100001 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGTG...CAGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153581 GTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153631 CCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153681 CCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153731 TGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATG         GAAGTTGATGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 153781 GGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGTA...CAGGAAGTTGATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203421 AATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203471 GAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203521 CCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 203571 ACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482         AAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203621 TA...TAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 293920 ACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    569     GGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293970 .TAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 308609 GATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 308659 AGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAA         ATTGCAAGACAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 308709 GAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAAGTG...CAGATTGCAAGACAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 314864 GCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCAG         GTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 314914 TCCAGGTC...CAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 384074 TTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTA         GTGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 384124 CCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTA...TAGGTGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 408711 CTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAG         CAGTTATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 408761 ACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGGTA...TAGCAGTTATATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 445080 TGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 445130 TACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGCAAG         GATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 445180 GACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGCAAGGTA...CAGGATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AGTGGCACAGCCACTGAACCTATCAGCTAAACCCAAGACCTCTGATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 473769 AGTGGCACAGCCACTGAACCTATCAGCTAAACCCAAGACCTCTGATGGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AATCACCCACATCACCCACCTCTCCCCATATGCCAGCTCTGAGAATAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 473819 AATCACCCACATCACCCACCTCTCCCCATATGCCAGCTCTGAGAATAAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AGTGGGGCAGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCAGCAGCGTTAGCTAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 473869 AGTGGGGCAGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCAGCAGCGTTAGCTAGTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TTCAGCCAGAGTTAGCACAATAG         GTTACTTAAATGACCATG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 473919 TTCAGCCAGAGTTAGCACAATAGGTA...CAGGTTACTTAAATGACCATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGGCAAATGAAGGAGCAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 486217 ATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGGCAAATGAAGGAGCAACTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CGACGGGAACAACAGGTGCTTGATGGGAAGGTGGCTGTTGTGAATAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 486267 CGACGGGAACAACAGGTGCTTGATGGGAAGGTGGCTGTTGTGAATAGTCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GGGTCTCAATAACTGCCGAACAGAAAAG         GAAAAAACAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 486317 GGGTCTCAATAACTGCCGAACAGAAAAGGTC...AAGGAAAAAACAACAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 503191 TGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 503241 TTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGTT.

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598      GAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 503291 ..CAGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506263 GGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506313 GTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGG         GATCTCGCTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 506363 GCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGTA...TAGGATCTCGCTGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 512945 AAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 512995 CTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 513045 GCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 ACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 513095 ACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GTTGG         GCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 513145 GTTGGGTA...CAGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 515116 TGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 515166 CCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 515216 ATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 515266 GATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 AAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 515316 AAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATT

   2400     .    :    .
   2275 GCAGGACAAGCCAAC
        |||||||||||||||
 515366 GCAGGACAAGCCAAC