seq1 = pF1KB6250.tfa, 2046 bp
seq2 = pF1KB6250/gi568815579r_43813390.tfa (gi568815579r:43813390_44019701), 206312 bp

>pF1KB6250 2046
>gi568815579r:43813390_44019701 (Chr19)

(complement)

6-142  (99993-100129)   97% ->
143-235  (100740-100832)   100% ->
236-2046  (104502-106312)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 GAAG TCTAAGGAGGCAGTGACATTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCTCT
        || |-| ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99993 GATGTTGTA GGAGGCAGTGACATTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     55 GAGGAGGAGCTGCAACTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100042 GAGGAGGAGCTGCAACTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    105 TGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAATGTGGTCTCAGTGG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100092 TGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAATGTGGTCTCAGTGGGTG...CAGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146 ATCAGTCCACACCAGATGGCCTACCACAGTTAGAGAGAGAAGAAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100743 ATCAGTCCACACCAGATGGCCTACCACAGTTAGAGAGAGAAGAAAAGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196 TGGATGATGAAGATGGCAACCCAGAGAGATAACTCCTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100793 TGGATGATGAAGATGGCAACCCAGAGAGATAACTCCTCAGGTG...TAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    237 AGCCAAGAATCTAAAAGAGATGGAGACTCTTCAAGAAGTAGGATTAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104503 AGCCAAGAATCTAAAAGAGATGGAGACTCTTCAAGAAGTAGGATTAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287 ACCTGCCTCATGAAGAGCTTTTCTGCTCCCAGATCTGGCAACAGATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104553 ACCTGCCTCATGAAGAGCTTTTCTGCTCCCAGATCTGGCAACAGATTACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337 AGAGAGTTAATCAAGTATCAAGATTCTGTGGTAAATATTCAAAGAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104603 AGAGAGTTAATCAAGTATCAAGATTCTGTGGTAAATATTCAAAGAACAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    387 CTGCCAGTTGGAAAAACGAGATGATTTGCACTATAAAGATGAGGGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104653 CTGCCAGTTGGAAAAACGAGATGATTTGCACTATAAAGATGAGGGATTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    437 GTAATCAGAGTTCCCATCTTCAAGTTCACAGAGTCCACACTGGTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104703 GTAATCAGAGTTCCCATCTTCAAGTTCACAGAGTCCACACTGGTGAAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    487 CCCTACAAAGGAGAACATTGTGTGAAAAGTTTCAGCTGGAGCTCTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104753 CCCTACAAAGGAGAACATTGTGTGAAAAGTTTCAGCTGGAGCTCTCATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    537 TCAAATTAACCAAAGGGCTCACGCAGGAGAGAAGCCCTACAAATGTGAAA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 104803 TCAAATTAACCAAAGGGCTCATGCAGGAGAGAAGCCCTACAAATGTGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    587 AATGTGATAATGCCTTCCGTCGGTTTTCAAGTCTTCAAGCCCATCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104853 AATGTGATAATGCCTTCCGTCGGTTTTCAAGTCTTCAAGCCCATCAGAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    637 GTCCACAGTAGAGCAAAATCATACACAAATGATGCAAGTTACAGGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104903 GTCCACAGTAGAGCAAAATCATACACAAATGATGCAAGTTACAGGAGTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    687 TAGTCAGAGGTCACATCTTCCCCATCATCAGAGAGTTCCCACTGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104953 TAGTCAGAGGTCACATCTTCCCCATCATCAGAGAGTTCCCACTGGAGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    737 ATCCATACAAATATGAAGAGTGTGGGAAGAATGTTGGGAAAAGCTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 105003 ATCCATACAAATATGAAGAGTGTGGGAGGAATGTTGGGAAAAGCTCACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    787 TGTCAAGCTCCTCTGATAGTTCATACGGGAGAGAAACCCTATAAATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105053 TGTCAAGCTCCTCTGATAGTTCATACGGGAGAGAAACCCTATAAATGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    837 GGAGTGTGGGGTGGGCTTCAGTCAGAGATCATATCTTCAAGTTCATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105103 GGAGTGTGGGGTGGGCTTCAGTCAGAGATCATATCTTCAAGTTCATCTGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    887 AAGTTCACGCTGGAAAGAAACGATATAAGTGTGAAGAGTGTGGGAAGAGC
        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 105153 AAGTTCACACTGGAAAGAAACCATATAAGTGTGAAGAGTGTGGGAAGAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    937 TTCAGTTGGCGTTCACGACTGCAGGCTCATGAGCGAATCCACACTGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105203 TTCAGTTGGCGTTCACGACTGCAGGCTCATGAGCGAATCCACACTGGCGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    987 GAAACCATACAAATGCAATGCATGTGGCAAGAGCTTTAGTTACAGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105253 GAAACCATACAAATGCAATGCATGTGGCAAGAGCTTTAGTTACAGCTCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1037 ACCTTAACATTCATTGTAGAATCCACACAGGAGAGAAACCCTATAAGTGT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105303 ACCTTAATATTCATTGTAGAATCCACACAGGAGAGAAACCCTATAAGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1087 GAGGAGTGTGGGAAAGGTTTCAGTGTGGGTTCACACCTTCAGGCCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105353 GAGGAGTGTGGGAAAGGTTTCAGTGTGGGTTCACACCTTCAGGCCCATCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1137 GATAAGCCACACTGGAGAGAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105403 GATAAGCCACACTGGAGAGAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1187 GCTTCTGCCGGGCCTCAAATCTGCTGGACCATCAAAGAGGCCATACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105453 GCTTCTGCCGGGCCTCAAATCTGCTGGACCATCAAAGAGGCCATACTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1237 GAGAAACCATATCAGTGTGATGCATGTGGTAAGGGCTTCAGTCGTAGCTC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105503 GAGAAACCGTATCAGTGTGATGCATGTGGTAAGGGCTTCAGTCGTAGCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1287 AGATTTTAACATTCATTTTAGAGTCCATACAGGGGAAAAACCCTATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105553 AGATTTTAACATTCATTTTAGAGTCCATACAGGGGAAAAACCCTATAAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1337 GTGAGGAGTGTGGCAAGGGCTTCAGCCAGGCCTCAAATCTTCTGGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105603 GTGAGGAGTGTGGCAAGGGCTTCAGCCAGGCCTCAAATCTTCTGGCCCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1387 CAAAGAGGCCACACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGGTACATGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105653 CAAAGAGGCCACACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGGTACATGTGGGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1437 GGGCTTCAGTCGGAGCTCAGATCTTAATGTACACTGTAGAATCCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105703 GGGCTTCAGTCGGAGCTCAGATCTTAATGTACACTGTAGAATCCACACAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1487 GAGAGAAACCCTATAAATGCGAGAAGTGTGGTAAGGCCTTCAGTCAGTTC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 105753 GAGAGAAACCCTATAAATGCGAGAGGTGTGGTAAGGCCTTCAGTCAGTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1537 TCCAGCCTTCAGGTGCATCAGAGAGTTCACACTGGAGAGAAACCATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105803 TCCAGCCTTCAGGTGCATCAGAGAGTTCACACTGGAGAGAAACCATATCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1587 GTGTGCAGAGTGTGGGAAGGGCTTCAGTGTAGGTTCACAGCTTCAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105853 GTGTGCAGAGTGTGGGAAGGGCTTCAGTGTAGGTTCACAGCTTCAAGCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1637 ATCAGAGGTGCCACACTGGAGAGAAACCCTATCAATGTGAGGAGTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105903 ATCAGAGGTGCCACACTGGAGAGAAACCCTATCAATGTGAGGAGTGTGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1687 AAGGGCTTCTGTCGGGCCTCCAATTTTCTGGCACATCGTGGAGTCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105953 AAGGGCTTCTGTCGGGCCTCCAATTTTCTGGCACATCGTGGAGTCCACAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1737 AGGAGAAAAACCATACCGATGTGATGTGTGTGGTAAGCGCTTCAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106003 AGGAGAAAAACCATACCGATGTGATGTGTGTGGTAAGCGCTTCAGACAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1787 GATCCTACCTTCAAGCCCACCAGAGGGTCCACACAGGAGAGAGACCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106053 GATCCTACCTTCAAGCCCACCAGAGGGTCCACACAGGAGAGAGACCATAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1837 AAATGTGAGGAATGTGGGAAAGTCTTCAGCTGGAGCTCATACCTTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106103 AAATGTGAGGAATGTGGGAAAGTCTTCAGCTGGAGCTCATACCTTCAAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1887 CCATCAAAGAGTTCACACCGGAGAAAAACCATACAAATGTGAGGAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106153 CCATCAAAGAGTTCACACCGGAGAAAAACCATACAAATGTGAGGAGTGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1937 GGAAGGGCTTCAGTTGGAGCTCAAGTCTTATCATTCATCAGCGAGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106203 GGAAGGGCTTCAGTTGGAGCTCAAGTCTTATCATTCATCAGCGAGTCCAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1987 GCTGATGATGAGGGTGACAAGGACTTCCCTTCATCAGAGGATTCACACAG
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 106253 GCTGATGATGAGGGTGACAAGGACTTTCCTTCATCAGAGGATTCACACAG

   2050     .    :
   2037 GAAAACTCGA
        ||||||||||
 106303 GAAAACTCGA