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seq2 = pF1KB6244/gi568815595f_189531516.tfa (gi568815595f:189531516_189994499), 462984 bp

>pF1KB6244 2040
>gi568815595f:189531516_189994499 (Chr3)

1-62  (100001-100062)   100% ->
63-191  (206225-206353)   100% ->
192-324  (207127-207259)   100% ->
325-579  (276757-277011)   100% ->
580-766  (332717-332903)   100% ->
767-882  (335167-335282)   100% ->
883-992  (336318-336427)   100% ->
993-1129  (337065-337201)   100% ->
1130-1212  (337809-337891)   100% ->
1213-1349  (341344-341480)   100% ->
1350-1507  (354879-355036)   100% ->
1508-1652  (357825-357969)   100% ->
1653-1746  (359274-359367)   100% ->
1747-2040  (362691-362984)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTTTGAAACTTCACGGTGTGCCACCCTACAGTACTGCCCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTTTGAAACTTCACGGTGTGCCACCCTACAGTACTGCCCTGACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTACATCCAGCG         TTTCGTAGAAACCCCAGCTCATTTCTCTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTACATCCAGCGGTG...AAGTTTCGTAGAAACCCCAGCTCATTTCTCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAAAGAAAGTTATTACCGATCCACCATGTCCCAGAGCACACAGACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206254 GGAAAGAAAGTTATTACCGATCCACCATGTCCCAGAGCACACAGACAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAATTCCTCAGTCCAGAGGTTTTCCAGCATATCTGGGATTTTCTGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206304 GAATTCCTCAGTCCAGAGGTTTTCCAGCATATCTGGGATTTTCTGGAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192          GCCTATATGTTCAGTTCAGCCCATTGACTTGAACTTTGTGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206354 GTA...TAGGCCTATATGTTCAGTTCAGCCCATTGACTTGAACTTTGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGAACCATCAGAAGATGGTGCGACAAACAAGATTGAGATTAGCATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207168 ATGAACCATCAGAAGATGGTGCGACAAACAAGATTGAGATTAGCATGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTATCCGCATGCAGGACTCGGACCTGAGTGACCCCATGTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 207218 TGTATCCGCATGCAGGACTCGGACCTGAGTGACCCCATGTGGGTG...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    325  CCACAGTACACGAACCTGGGGCTCCTGAACAGCATGGACCAGCAGATTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276756 GCCACAGTACACGAACCTGGGGCTCCTGAACAGCATGGACCAGCAGATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAACGGCTCCTCGTCCACCAGTCCCTATAACACAGACCACGCGCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276806 AGAACGGCTCCTCGTCCACCAGTCCCTATAACACAGACCACGCGCAGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCGTCACGGCGCCCTCGCCCTACGCACAGCCCAGCTCCACCTTCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276856 AGCGTCACGGCGCCCTCGCCCTACGCACAGCCCAGCTCCACCTTCGATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCTCTCTCCATCACCCGCCATCCCCTCCAACACCGACTACCCAGGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276906 TCTCTCTCCATCACCCGCCATCCCCTCCAACACCGACTACCCAGGCCCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAGTTTCGACGTGTCCTTCCAGCAGTCGAGCACCGCCAAGTCGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276956 ACAGTTTCGACGTGTCCTTCCAGCAGTCGAGCACCGCCAAGTCGGCCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGGACG         TATTCCACTGAACTGAAGAAACTCTACTGCCAAAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277006 TGGACGGTA...CAGTATTCCACTGAACTGAAGAAACTCTACTGCCAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCAAAGACATGCCCCATCCAGATCAAGGTGATGACCCCACCTCCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 332752 TGCAAAGACATGCCCCATCCAGATCAAGGTGATGACCCCACCTCCTCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAGCTGTTATCCGCGCCATGCCTGTCTACAAAAAAGCTGAGCACGTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 332802 GAGCTGTTATCCGCGCCATGCCTGTCTACAAAAAAGCTGAGCACGTCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGGTGGTGAAGCGGTGCCCCAACCATGAGCTGAGCCGTGAATTCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 332852 GAGGTGGTGAAGCGGTGCCCCAACCATGAGCTGAGCCGTGAATTCAACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GG         GACAGATTGCCCCTCCTAGTCATTTGATTCGAGTAGAGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 332902 GGGTA...CAGGACAGATTGCCCCTCCTAGTCATTTGATTCGAGTAGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGAACAGCCATGCCCAGTATGTAGAAGATCCCATCACAGGAAGACAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 335206 GGAACAGCCATGCCCAGTATGTAGAAGATCCCATCACAGGAAGACAGAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTGCTGGTACCTTATGAGCCACCCCAG         GTTGGCACTGAATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 335256 GTGCTGGTACCTTATGAGCCACCCCAGGTA...CAGGTTGGCACTGAATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACGACAGTCTTGTACAATTTCATGTGTAACAGCAGTTGTGTTGGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336332 CACGACAGTCTTGTACAATTTCATGTGTAACAGCAGTTGTGTTGGAGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGAACCGCCGTCCAATTTTAATCATTGTTACTCTGGAAACCAGAGA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 336382 TGAACCGCCGTCCAATTTTAATCATTGTTACTCTGGAAACCAGAGAGTA.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    993      TGGGCAAGTCCTGGGCCGACGCTGCTTTGAGGCCCGGATCTGTGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336432 ..TAGTGGGCAAGTCCTGGGCCGACGCTGCTTTGAGGCCCGGATCTGTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTGCCCAGGAAGAGACAGGAAGGCGGATGAAGATAGCATCAGAAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 337110 TTGCCCAGGAAGAGACAGGAAGGCGGATGAAGATAGCATCAGAAAGCAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AAGTTTCGGACAGTACAAAGAACGGTGATGGTACGAAGCGCC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 337160 AAGTTTCGGACAGTACAAAGAACGGTGATGGTACGAAGCGCCGTA...CA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1130  CGTTTCGTCAGAACACACATGGTATCCAGATGACATCCATCAAGAAACG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 337808 GCGTTTCGTCAGAACACACATGGTATCCAGATGACATCCATCAAGAAACG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AAGATCCCCAGATGATGAACTGTTATACTTACCA         GTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 337858 AAGATCCCCAGATGATGAACTGTTATACTTACCAGTA...TAGGTGAGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCCGTGAGACTTATGAAATGCTGTTGAAGATCAAAGAGTCCCTGGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 341351 GCCGTGAGACTTATGAAATGCTGTTGAAGATCAAAGAGTCCCTGGAACTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ATGCAGTACCTTCCTCAGCACACAATTGAAACGTACAGGCAACAGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 341401 ATGCAGTACCTTCCTCAGCACACAATTGAAACGTACAGGCAACAGCAACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCAGCAGCACCAGCACTTACTTCAGAAACA         GACCTCAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 341451 GCAGCAGCACCAGCACTTACTTCAGAAACAGTG...TAGGACCTCAATAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AGTCTCCATCTTCATATGGTAACAGCTCCCCACCTCTGAACAAAATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 354890 AGTCTCCATCTTCATATGGTAACAGCTCCCCACCTCTGAACAAAATGAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGCATGAACAAGCTGCCTTCTGTGAGCCAGCTTATCAACCCTCAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 354940 AGCATGAACAAGCTGCCTTCTGTGAGCCAGCTTATCAACCCTCAGCAGCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CAACGCCCTCACTCCTACAACCATTCCTGATGGCATGGGAGCCAACA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 354990 CAACGCCCTCACTCCTACAACCATTCCTGATGGCATGGGAGCCAACAGTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1508       TTCCCATGATGGGCACCCACATGCCAATGGCTGGAGACATGAAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355040 ...CAGTTCCCATGATGGGCACCCACATGCCAATGGCTGGAGACATGAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GGACTCAGCCCCACCCAGGCACTCCCTCCCCCACTCTCCATGCCATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 357869 GGACTCAGCCCCACCCAGGCACTCCCTCCCCCACTCTCCATGCCATCCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CTCCCACTGCACACCCCCACCTCCGTATCCCACAGATTGCAGCATTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 357919 CTCCCACTGCACACCCCCACCTCCGTATCCCACAGATTGCAGCATTGTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 G         TTTCTTAGCGAGGTTGGGCTGTTCATCATGTCTGGACTAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 357969 GGTG...CAGTTTCTTAGCGAGGTTGGGCTGTTCATCATGTCTGGACTAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TTCACGACCCAGGGGCTGACCACCATCTATCAGATTGAGCATTACTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 359314 TTCACGACCCAGGGGCTGACCACCATCTATCAGATTGAGCATTACTCCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GGAT         GATCTGGCAAGTCTGAAAATCCCTGAGCAATTTCGAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 359364 GGATGTA...CAGGATCTGGCAAGTCTGAAAATCCCTGAGCAATTTCGAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ATGCGATCTGGAAGGGCATCCTGGACCACCGGCAGCTCCACGAATTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362728 ATGCGATCTGGAAGGGCATCCTGGACCACCGGCAGCTCCACGAATTCTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TCCCCTTCTCATCTCCTGCGGACCCCAAGCAGTGCCTCTACAGTCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362778 TCCCCTTCTCATCTCCTGCGGACCCCAAGCAGTGCCTCTACAGTCAGTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GGGCTCCAGTGAGACCCGGGGTGAGCGTGTTATTGATGCTGTGCGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362828 GGGCTCCAGTGAGACCCGGGGTGAGCGTGTTATTGATGCTGTGCGATTCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CCCTCCGCCAGACCATCTCTTTCCCACCCCGAGATGAGTGGAATGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362878 CCCTCCGCCAGACCATCTCTTTCCCACCCCGAGATGAGTGGAATGACTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 AACTTTGACATGGATGCTCGCCGCAATAAGCAACAGCGCATCAAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362928 AACTTTGACATGGATGCTCGCCGCAATAAGCAACAGCGCATCAAAGAGGA

   2150     .
   2034 GGGGGAG
        |||||||
 362978 GGGGGAG