seq1 = pF1KB6233.tfa, 2244 bp
seq2 = pF1KB6233/gi568815596r_190930972.tfa (gi568815596r:190930972_191248203), 317232 bp

>pF1KB6233 2244
>gi568815596r:190930972_191248203 (Chr2)

(complement)

1-128  (100001-100128)   100% ->
129-273  (101447-101591)   100% ->
274-372  (171879-171977)   100% ->
373-465  (175014-175106)   100% ->
466-544  (178433-178511)   100% ->
545-630  (181689-181774)   100% ->
631-782  (183246-183397)   100% ->
783-941  (185284-185442)   100% ->
942-1034  (186383-186475)   100% ->
1035-1094  (189435-189494)   100% ->
1095-1206  (190075-190186)   92% ->
1207-1251  (193670-193714)   100% ->
1252-1335  (207056-207139)   100% ->
1336-1434  (208907-209005)   100% ->
1435-1570  (211905-212040)   100% ->
1571-1620  (213607-213656)   100% ->
1621-1715  (214199-214293)   100% ->
1716-1852  (214578-214714)   100% ->
1853-2044  (215055-215246)   100% ->
2045-2111  (216688-216754)   100% ->
2112-2220  (217124-217232)   100% ->
2221-2244  (218338-218361)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCAGTGGAATCAAGTCCAACAGTTAGAAATCAAGTTTTTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCAGTGGAATCAAGTCCAACAGTTAGAAATCAAGTTTTTGGAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGATCAATTCTATGATGACAACTTTCCCATGGAAATTCGGCATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGATCAATTCTATGATGACAACTTTCCCATGGAAATTCGGCATCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCCAATGGATTGAAAATCAAGACTG         GGAGGCAGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100101 TGGCCCAATGGATTGAAAATCAAGACTGGTA...TAGGGAGGCAGCTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACAATGAAACCATGGCAACGATTCTTCTTCAAAACTTGTTAATACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101460 AACAATGAAACCATGGCAACGATTCTTCTTCAAAACTTGTTAATACAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATGAACAGTTAGGTCGTGTTTCCAAAGAGAAAAACCTACTCTTGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101510 GGATGAACAGTTAGGTCGTGTTTCCAAAGAGAAAAACCTACTCTTGATAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACAATCTAAAAAGAATTAGGAAGGTCCTTCAG         GGAAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101560 ACAATCTAAAAAGAATTAGGAAGGTCCTTCAGGTA...CAGGGAAAATTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATGGAAATCCAATGCATGTAGCTGTGGTTATTTCAAACTGTTTAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171888 CATGGAAATCCAATGCATGTAGCTGTGGTTATTTCAAACTGTTTAAGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAGAGGAGAATATTGGCTGCAGCCAACATGCCTGTCCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 171938 AGAGAGGAGAATATTGGCTGCAGCCAACATGCCTGTCCAGGTA...CAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGCCTCTAGAGAAATCCTTACAAAGTTCTTCAGTTTCAGAAAGACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175015 GGCCTCTAGAGAAATCCTTACAAAGTTCTTCAGTTTCAGAAAGACAGAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATGTGGAGCACAAAGTGGCTGCCATTAAAAACAGTGTGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 175065 AATGTGGAGCACAAAGTGGCTGCCATTAAAAACAGTGTGCAGGTA...AA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    466  ATGACAGAACAAGATACCAAATACTTAGAAGATCTGCAAGACGAATTTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178432 GATGACAGAACAAGATACCAAATACTTAGAAGATCTGCAAGACGAATTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACTACAGGTATAAAACAATTCAGACAATGG         ATCAGAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 178482 ACTACAGGTATAAAACAATTCAGACAATGGGTA...CAGATCAGAGTGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAGAATAGTGCCATGGTGAATCAGGAAGTTTTGACACTGCAGGAAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181700 AAGAATAGTGCCATGGTGAATCAGGAAGTTTTGACACTGCAGGAAATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TAACAGCCTCGATTTCAAGAGAAAG         GAGGCTCTCAGTAAAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 181750 TAACAGCCTCGATTTCAAGAGAAAGGTT...TAGGAGGCTCTCAGTAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGACCCAAATCATCCATGAGACAGACCTGTTAATGAACACCATGCTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183262 TGACCCAAATCATCCATGAGACAGACCTGTTAATGAACACCATGCTCATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAAGAGCTGCAAGACTGGAAGCGGCGGCAGCAAATCGCCTGCATCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183312 GAAGAGCTGCAAGACTGGAAGCGGCGGCAGCAAATCGCCTGCATCGGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCCACTCCACAATGGGCTCGACCAGCTTCAGAACTG         CTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 183362 TCCACTCCACAATGGGCTCGACCAGCTTCAGAACTGGTA...TAGCTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CACTATTGGCAGAAAGTCTTTTCCAACTGAGAAGGCAATTGGAGAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185289 CACTATTGGCAGAAAGTCTTTTCCAACTGAGAAGGCAATTGGAGAAACTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAGGAGCAATCTACCAAAATGACATATGAAGGTGATCCCATTCCAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185339 GAGGAGCAATCTACCAAAATGACATATGAAGGTGATCCCATTCCAATGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AAGAACTCACATGCTAGAAAGAGTCACCTTCTTGATCTACAACCTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185389 AAGAACTCACATGCTAGAAAGAGTCACCTTCTTGATCTACAACCTTTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGAA         CTCATTTGTGGTTGAGCGACAGCCATGTATGCCAACC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185439 AGAAGTA...TAGCTCATTTGTGGTTGAGCGACAGCCATGTATGCCAACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CACCCTCAGAGGCCGTTGGTACTTAAAACCCTAATTCAGTTCACTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186420 CACCCTCAGAGGCCGTTGGTACTTAAAACCCTAATTCAGTTCACTGTAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 ACTAAG         GCTACTAATAAAATTGCCAGAACTAAACTATCAGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186470 ACTAAGGTA...CAGGCTACTAATAAAATTGCCAGAACTAAACTATCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TAAAGGTTAAGGCATCAATTGACAA          GAATGTTTCAACTCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>- ||  ||||  ||| 
 189470 TAAAGGTTAAGGCATCAATTGACAAGTA...TAGCTAAGATTTCCTCTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1110 AAGCAACCGAAGATTTGTACTTTGTGGAACTAATGTCAAAGCCATGTCTA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190091 A GCAACCGAAGATTTGTACTTTGTGGAACTAATGTCAAAGCCATGTCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1160 TTGAAGAATCTTCCAATGGGAGTCTCTCAGTAGAATTTCGACATTTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 190140 TTGAAGAATCTTCCAATGGGAGTCTCTCAGTAGAATTTCGACATTTGGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1207       CAACCAAAGGAAATGAAGTCCAGTGCTGGAGGTAAAGGAAATGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190190 ...AAGCAACCAAAGGAAATGAAGTCCAGTGCTGGAGGTAAAGGAAATGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 G         GGCTGTCACATGGTGACTGAAGAACTTCATTCCATAACGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193714 GGTA...TAGGGCTGTCACATGGTGACTGAAGAACTTCATTCCATAACGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TTGAAACACAGATCTGCCTCTATGGCCTGACCATAGATTTGGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 207096 TTGAAACACAGATCTGCCTCTATGGCCTGACCATAGATTTGGAGGTA...

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1336    ACCAGCTCATTGCCTGTGGTGATGATTTCCAATGTCAGTCAGTTACC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208904 CAGACCAGCTCATTGCCTGTGGTGATGATTTCCAATGTCAGTCAGTTACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TAATGCTTGGGCATCCATCATTTGGTACAACGTGTCAACCAACGATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208954 TAATGCTTGGGCATCCATCATTTGGTACAACGTGTCAACCAACGATTCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AG         AACTTGGTTTTCTTTAATAATCCTCCACCTGCCACATTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209004 AGGTA...CAGAACTTGGTTTTCTTTAATAATCCTCCACCTGCCACATTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AGTCAACTACTGGAGGTGATGAGCTGGCAGTTTTCATCGTACGTTGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211944 AGTCAACTACTGGAGGTGATGAGCTGGCAGTTTTCATCGTACGTTGGTCG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 TGGTCTTAACTCAGATCAACTCCATATGCTGGCAGAGAAGCTTACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 211994 TGGTCTTAACTCAGATCAACTCCATATGCTGGCAGAGAAGCTTACAGGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1571       TCCAATCTAGCTACAGTGATGGTCACCTCACCTGGGCCAAGTTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212044 ...CAGTCCAATCTAGCTACAGTGATGGTCACCTCACCTGGGCCAAGTTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 TGCAAG         GAACATTTACCTGGTAAATCATTTACCTTTTGGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213651 TGCAAGGTA...TAGGAACATTTACCTGGTAAATCATTTACCTTTTGGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 ATGGCTTGAAGCAATATTGGATCTAATTAAGAAACACATTCTTCCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214234 ATGGCTTGAAGCAATATTGGATCTAATTAAGAAACACATTCTTCCCCTTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 GGATTGATGG         GTATGTCATGGGCTTTGTTAGCAAAGAGAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 214284 GGATTGATGGGTA...TAGGTATGTCATGGGCTTTGTTAGCAAAGAGAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 GAACGGCTGTTGCTAAAGGATAAAATGCCTGGCACCTTTTTATTAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214609 GAACGGCTGTTGCTAAAGGATAAAATGCCTGGCACCTTTTTATTAAGATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 CAGTGAAAGCCATCTCGGAGGAATAACTTTCACCTGGGTGGACCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214659 CAGTGAAAGCCATCTCGGAGGAATAACTTTCACCTGGGTGGACCATTCTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 AAAGTG         GGGAAGTGAGATTCCACTCTGTAGAACCCTACAAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214709 AAAGTGGTA...AAGGGGAAGTGAGATTCCACTCTGTAGAACCCTACAAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AAAGGCCGGTTGTCTGCTCTGCCATTCGCTGACATCCTGCGAGACTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215090 AAAGGCCGGTTGTCTGCTCTGCCATTCGCTGACATCCTGCGAGACTACAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 AGTTATTATGGCTGAAAACATTCCTGAAAACCCTCTGAAGTACCTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215140 AGTTATTATGGCTGAAAACATTCCTGAAAACCCTCTGAAGTACCTATATC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 CTGACATTCCCAAAGACAAAGCCTTCGGTAAACACTACAGCTCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215190 CTGACATTCCCAAAGACAAAGCCTTCGGTAAACACTACAGCTCTCAGCCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 TGCGAAG         TTTCAAGACCAACAGAAAGGGGTGACAAAGGTTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215240 TGCGAAGGTT...CAGTTTCAAGACCAACAGAAAGGGGTGACAAAGGTTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 TGTTCCTTCTGTTTTTATCCCCATCTCAACAAT         CCGAAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 216722 TGTTCCTTCTGTTTTTATCCCCATCTCAACAATGTG...AAGCCGAAGTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 ATTCAACAGAGCCACATTCTCCATCAGACCTTCTTCCCATGTCTCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217132 ATTCAACAGAGCCACATTCTCCATCAGACCTTCTTCCCATGTCTCCAAGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 GTGTATGCGGTGTTGAGAGAAAACCTGAGTCCCACAACAATTGAAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217182 GTGTATGCGGTGTTGAGAGAAAACCTGAGTCCCACAACAATTGAAACTGC

   2400     .    :    .    :    .    :
   2220 A         ATGAAGTCTCCTTATTCTGCTGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 217232 AGTA...TAGATGAAGTCTCCTTATTCTGCTGAA