seq1 = pF1KB6229.tfa, 2019 bp
seq2 = pF1KB6229/gi568815587f_113963301.tfa (gi568815587f:113963301_114350552), 387252 bp

>pF1KB6229 2019
>gi568815587f:113963301_114350552 (Chr11)

1-1268  (100001-101268)   100% ->
1269-1366  (193037-193134)   100% ->
1367-1453  (223652-223738)   100% ->
1454-1624  (278867-279037)   100% ->
1625-1792  (283898-284065)   100% ->
1793-2019  (287026-287252)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCTGACAAAAATGGGCATGATCCAGCTGCAGAACCCTAGCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCTGACAAAAATGGGCATGATCCAGCTGCAGAACCCTAGCCACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACGGGGCTACTGTGCAAGGCCAACCAGATGCGGCTGGCCGGGACTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACGGGGCTACTGTGCAAGGCCAACCAGATGCGGCTGGCCGGGACTTTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGATGTGGTCATCATGGTGGACAGCCAGGAGTTCCACGCCCACCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGATGTGGTCATCATGGTGGACAGCCAGGAGTTCCACGCCCACCGGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCTGGCCTGCACCAGCAAGATGTTTGAGATCCTCTTCCACCGCAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCTGGCCTGCACCAGCAAGATGTTTGAGATCCTCTTCCACCGCAATAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAACACTATACTTTGGACTTCCTCTCGCCAAAGACCTTCCAGCAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCAACACTATACTTTGGACTTCCTCTCGCCAAAGACCTTCCAGCAGATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGAGTATGCATATACAGCCACGCTGCAAGCCAAGGCGGAGGACCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGAGTATGCATATACAGCCACGCTGCAAGCCAAGGCGGAGGACCTGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACCTGCTGTATGCGGCCGAGATCCTGGAGATCGAGTACCTGGAGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACCTGCTGTATGCGGCCGAGATCCTGGAGATCGAGTACCTGGAGGAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCCTGAAGATGCTGGAGACCATCCAGGCCTCAGACGACAATGACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGCCTGAAGATGCTGGAGACCATCCAGGCCTCAGACGACAATGACACGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGCCACCATGGCCGATGGCGGGGCCGAGGAAGAAGAGGACCGCAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGCCACCATGGCCGATGGCGGGGCCGAGGAAGAAGAGGACCGCAAGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGGTACCTCAAGAACATCTTCATCTCGAAGCATTCCAGCGAGGAGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGGTACCTCAAGAACATCTTCATCTCGAAGCATTCCAGCGAGGAGAGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTATGCCAGTGTGGCTGGACAGAGCCTCCCTGGGCCCATGGTGGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTATGCCAGTGTGGCTGGACAGAGCCTCCCTGGGCCCATGGTGGACCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCCTTCAGTCTCCACTTCATTTGGTCTTTCAGCCATGAGTCCCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCCTTCAGTCTCCACTTCATTTGGTCTTTCAGCCATGAGTCCCACCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTGCAGTGGACAGTTTGATGACCATAGGACAGTCTCTCCTGCAGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTGCAGTGGACAGTTTGATGACCATAGGACAGTCTCTCCTGCAGGGAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCTTCAGCCACCTGCAGGGCCCGAGGAGCCAACTCTGGCTGGGGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCTTCAGCCACCTGCAGGGCCCGAGGAGCCAACTCTGGCTGGGGGTGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCACCCTGGGGTGGCTGAGGTGAAGACGGAGATGATGCAGGTGGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCACCCTGGGGTGGCTGAGGTGAAGACGGAGATGATGCAGGTGGATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGCCCAGCCAGGACAGCCCTGGGGCAGCCGAGTCCAGCATCTCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGCCCAGCCAGGACAGCCCTGGGGCAGCCGAGTCCAGCATCTCAGGAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATGGGGGACAAGGTTGAGGAAAGAGGCAAAGAGGGGCCTGGGACCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATGGGGGACAAGGTTGAGGAAAGAGGCAAAGAGGGGCCTGGGACCCCGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTCGAAGCAGCGTCATCACCAGTGCTAGGGAGCTACACTATGGGCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTCGAAGCAGCGTCATCACCAGTGCTAGGGAGCTACACTATGGGCGAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGAGTGCCGAGCAGGTGCCACCCCCAGCTGAGGCTGGCCAGGCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGAGTGCCGAGCAGGTGCCACCCCCAGCTGAGGCTGGCCAGGCCCCCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGCCGACCTGAGCACCCAGCACCCCCGCCTGAGAAGCATCTGGGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGGCCGACCTGAGCACCCAGCACCCCCGCCTGAGAAGCATCTGGGCATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACTCCGTGTTGCCCAACCACAAGGCTGACGCTGTATTGAGCATGCCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACTCCGTGTTGCCCAACCACAAGGCTGACGCTGTATTGAGCATGCCGTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TCCGTGACCTCTGGCCTCCACGTGCAGCCTGCCCTGGCTGTCTCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TCCGTGACCTCTGGCCTCCACGTGCAGCCTGCCCTGGCTGTCTCCATGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTTCAGCACCTATGGGGGGCTGCTGCCCCAGGGCTTCATCCAGAGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTTCAGCACCTATGGGGGGCTGCTGCCCCAGGGCTTCATCCAGAGGGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGTTCAGCAAGCTGGGGGAGCTGGCTGTGGGCATGAAGTCAGAGAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGTTCAGCAAGCTGGGGGAGCTGGCTGTGGGCATGAAGTCAGAGAGCCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACCATCGGAGAGCAGTGCAGCGTGTGTGGGGTCGAGCTTCCTGATAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACCATCGGAGAGCAGTGCAGCGTGTGTGGGGTCGAGCTTCCTGATAACGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGCTGTGGAGCAGCACAG         GAAGCTGCACAGTGGGATGAAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101251 GGCTGTGGAGCAGCACAGGTA...CAGGAAGCTGCACAGTGGGATGAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CGTACGGGTGCGAGCTCTGCGGGAAGCGGTTCCTGGATAGTTTGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193060 CGTACGGGTGCGAGCTCTGCGGGAAGCGGTTCCTGGATAGTTTGCGGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AGAATGCACTTACTGGCTCATTCAG         CGGGTGCCAAAGCCTT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 193110 AGAATGCACTTACTGGCTCATTCAGGTA...CAGCGGGTGCCAAAGCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TGTCTGTGATCAGTGCGGTGCACAGTTTTCGAAGGAGGATGCCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223668 TGTCTGTGATCAGTGCGGTGCACAGTTTTCGAAGGAGGATGCCCTGGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 CACACAGGCAGACCCATACTG         GCACTGACATGGCCGTCTTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 223718 CACACAGGCAGACCCATACTGGTG...CAGGCACTGACATGGCCGTCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 TGTCTGCTGTGTGGGAAGCGCTTCCAGGCGCAGAGCGCACTGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278887 TGTCTGCTGTGTGGGAAGCGCTTCCAGGCGCAGAGCGCACTGCAGCAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CATGGAGGTCCACGCGGGCGTGCGCAGCTACATCTGCAGTGAGTGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278937 CATGGAGGTCCACGCGGGCGTGCGCAGCTACATCTGCAGTGAGTGCAACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GCACCTTCCCCAGCCACACGGCTCTCAAACGCCACCTGCGCTCACATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278987 GCACCTTCCCCAGCCACACGGCTCTCAAACGCCACCTGCGCTCACATACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 G         GCGACCACCCCTACGAGTGTGAGTTCTGTGGCAGCTGCTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279037 GGTA...CAGGCGACCACCCCTACGAGTGTGAGTTCTGTGGCAGCTGCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 CCGGGATGAGAGCACACTCAAGAGCCACAAACGCATCCACACGGGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283938 CCGGGATGAGAGCACACTCAAGAGCCACAAACGCATCCACACGGGTGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 AACCCTACGAGTGCAATGGCTGTGGCAAGAAGTTCAGCCTCAAGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283988 AACCCTACGAGTGCAATGGCTGTGGCAAGAAGTTCAGCCTCAAGCATCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 CTGGAGACGCACTATAGGGTGCACACAG         GTGAGAAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 284038 CTGGAGACGCACTATAGGGTGCACACAGGTA...CAGGTGAGAAGCCCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 TGAGTGTAAGCTCTGCCACCAGCGCTCCCGGGACTACTCGGCCATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287039 TGAGTGTAAGCTCTGCCACCAGCGCTCCCGGGACTACTCGGCCATGATCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 AGCACCTGAGAACGCACAACGGCGCCTCGCCCTACCAGTGCACCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287089 AGCACCTGAGAACGCACAACGGCGCCTCGCCCTACCAGTGCACCATCTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 ACAGAGTACTGCCCCAGCCTCTCCTCCATGCAGAAGCACATGAAGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287139 ACAGAGTACTGCCCCAGCCTCTCCTCCATGCAGAAGCACATGAAGGGCCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 CAAGCCCGAGGAGATCCCGCCCGACTGGAGGATAGAGAAGACGTACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287189 CAAGCCCGAGGAGATCCCGCCCGACTGGAGGATAGAGAAGACGTACCTCT

   2050     .    :
   2006 ACCTGTGCTATGTG
        ||||||||||||||
 287239 ACCTGTGCTATGTG