seq1 = pF1KB6213.tfa, 2004 bp
seq2 = pF1KB6213/gi568815587r_62493878.tfa (gi568815587r:62493878_62700691), 206814 bp

>pF1KB6213 2004
>gi568815587r:62493878_62700691 (Chr11)

(complement)

1-28  (99242-99269)   100% ->
29-96  (100003-100070)   100% ->
97-190  (100433-100526)   100% ->
191-308  (102053-102170)   100% ->
309-372  (102302-102365)   100% ->
373-490  (102551-102668)   100% ->
491-593  (102980-103082)   100% ->
594-693  (103277-103376)   100% ->
694-882  (103867-104055)   100% ->
883-957  (104160-104234)   100% ->
958-1016  (104355-104413)   100% ->
1017-1114  (104585-104682)   100% ->
1115-1254  (104801-104940)   100% ->
1255-1483  (105200-105428)   100% ->
1484-1573  (105622-105711)   100% ->
1574-1692  (106058-106176)   100% ->
1693-1841  (106285-106433)   100% ->
1842-2004  (106652-106814)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCAACATGTACCGGGTGGGAG         ATTACGTCTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  99242 ATGGCGGCCAACATGTACCGGGTGGGAGGTG...CAGATTACGTCTATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAGAACTCTTCCAGCAATCCTTACCTGGTTAGACGGATTGAGGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 TGAGAACTCTTCCAGCAATCCTTACCTGGTTAGACGGATTGAGGAGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACAAG         ACTGCAAATGGAAATGTGGAGGCAAAGGTTGTCTGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100066 ACAAGGTG...TAGACTGCAAATGGAAATGTGGAGGCAAAGGTTGTCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTTTTCCGGCGCAGGGACATTTCTAGTAGCCTCAACAGCCTGGCTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 CTTTTCCGGCGCAGGGACATTTCTAGTAGCCTCAACAGCCTGGCTGATAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAATGCCA         GGGAGTTTGAAGAGGAATCAAAGCAGCCAGGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100519 TAATGCCAGTG...CAGGGGAGTTTGAAGAGGAATCAAAGCAGCCAGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGTCTGAGCAGCAGCGCCATCAACTGAAGCACCGGGAACTTTTTCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102086 TGTCTGAGCAGCAGCGCCATCAACTGAAGCACCGGGAACTTTTTCTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGGCAATTTGAATCATTACCAGCCACCCACATACG         GGGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102136 CGGCAATTTGAATCATTACCAGCCACCCACATACGGTA...TAGGGGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ATGCAGTGTGACCCTCTTGAATGAGACAGATATCTTGAGCCAGTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102308 ATGCAGTGTGACCCTCTTGAATGAGACAGATATCTTGAGCCAGTACCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAAAGGAG         GACTGCTTTTTTTACTCACTGGTGTTTGACCCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102358 AAAAGGAGGTG...CAGGACTGCTTTTTTTACTCACTGGTGTTTGACCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GTGCAGAAGACACTTCTCGCTGATCAGGGCGAGATTAGAGTTGGTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102584 GTGCAGAAGACACTTCTCGCTGATCAGGGCGAGATTAGAGTTGGTTGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 ATACCAAGCTGAGATCCCAGATCGCCTAGTAGAGG         GAGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102634 ATACCAAGCTGAGATCCCAGATCGCCTAGTAGAGGGTA...CAGGAGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CTGATAATCGGAACCAGCAGAAGATGGAGATGAAGGTCTGGGACCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102986 CTGATAATCGGAACCAGCAGAAGATGGAGATGAAGGTCTGGGACCCAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AACCCTCTCACAGACCGGCAGATCGACCAGTTTCTTGTGGTGGCCCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103036 AACCCTCTCACAGACCGGCAGATCGACCAGTTTCTTGTGGTGGCCCGGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    594       AGCTGTGGGAACCTTTGCAAGAGCCCTAGATTGTAGCAGCTCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103086 ...TAGAGCTGTGGGAACCTTTGCAAGAGCCCTAGATTGTAGCAGCTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TTCGGCAGCCAAGCTTGCACATGAGTGCAGCTGCTGCCTCCCGAGATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103321 TTCGGCAGCCAAGCTTGCACATGAGTGCAGCTGCTGCCTCCCGAGATATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ACTCTG         TTTCACGCCATGGATACCTTGCAAAGGAACGGCTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103371 ACTCTGGTG...TAGTTTCACGCCATGGATACCTTGCAAAGGAACGGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CGACCTGGCTAAGGCCATGTCGACCCTGGTACCCCAGGGAGGCCCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103902 CGACCTGGCTAAGGCCATGTCGACCCTGGTACCCCAGGGAGGCCCGGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGTGTCGGGATGAGATGGAGGAATGGTCAGCCTCAGAGGCCATGCTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103952 TGTGTCGGGATGAGATGGAGGAATGGTCAGCCTCAGAGGCCATGCTATTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GAGGAGGCCCTAGAGAAGTATGGGAAGGACTTCAATGATATTCGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104002 GAGGAGGCCCTAGAGAAGTATGGGAAGGACTTCAATGATATTCGCCAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TTTT         CTACCCTGGAAGTCACTTGCCAGCATAGTCCAGTTTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104052 TTTTGTA...TAGCTACCCTGGAAGTCACTTGCCAGCATAGTCCAGTTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ATTACATGTGGAAAACCACAGACCGGTATATTCAGCAG         AAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104197 ATTACATGTGGAAAACCACAGACCGGTATATTCAGCAGGTA...CAGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 AGGTTGAAAGCTGCTGAAGCAGACAGCAAACTGAAACAGGTCTACATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104358 AGGTTGAAAGCTGCTGAAGCAGACAGCAAACTGAAACAGGTCTACATTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CACCTA         CACTAAGCCAAACCCTAACCAGATCATTTCTGTGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104408 CACCTAGTA...TAGCACTAAGCCAAACCCTAACCAGATCATTTCTGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 GTTCAAAACCTGGCATGAATGGGGCTGGATTTCAGAAGGGCCTGACTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104620 GTTCAAAACCTGGCATGAATGGGGCTGGATTTCAGAAGGGCCTGACTTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 GAGAGTTGCCACA         CCACACAGTCTGCTCAGTGGTATGCCTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104670 GAGAGTTGCCACAGTG...CAGCCACACAGTCTGCTCAGTGGTATGCCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGGCCCACCTAACATGCAGTGCCGCCTCTGTGCTTCCTGTTGGATCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104829 GGGCCCACCTAACATGCAGTGCCGCCTCTGTGCTTCCTGTTGGATCTACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 GGAAGAAGTATGGGGGACTGAAGACCCCAACTCAGCTTGAGGGGGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104879 GGAAGAAGTATGGGGGACTGAAGACCCCAACTCAGCTTGAGGGGGCCACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CGGGGCACCACG         GAGCCACACTCAAGGGGTCATTTATCCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104929 CGGGGCACCACGGTA...TAGGAGCCACACTCAAGGGGTCATTTATCCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 ACCTGAAGCTCAAAGTCTCTCTCCTTACACAACCAGCGCCAACAGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105229 ACCTGAAGCTCAAAGTCTCTCTCCTTACACAACCAGCGCCAACAGGGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 AGCTACTGGCTAAGAACAGACAAACTTTCCTGCTTCAGACCACAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105279 AGCTACTGGCTAAGAACAGACAAACTTTCCTGCTTCAGACCACAAAGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 ACCCGTCTTGCCAGACGCATGTGCAGGGACCTATTACAGCCAAGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105329 ACCCGTCTTGCCAGACGCATGTGCAGGGACCTATTACAGCCAAGGAGGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CGCCCGACGGCCTTATGCTCCTATCAATGCCAATGCCATCAAAGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105379 CGCCCGACGGCCTTATGCTCCTATCAATGCCAATGCCATCAAAGCAGAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484          GCTCCATTCGACTTCCTAAGGCCGCCAAGACTCCATTGAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105429 GTA...CAGGCTCCATTCGACTTCCTAAGGCCGCCAAGACTCCATTGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 ATTCACCCTCTGGTGCGGCTGCCCCTGGCAACTATCGTCAAAGATCTGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105663 ATTCACCCTCTGGTGCGGCTGCCCCTGGCAACTATCGTCAAAGATCTGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574         TGGCCCAGGCACCCCTGAAACCAAAAACACCTCGGGGTACCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105713 TA...CAGTGGCCCAGGCACCCCTGAAACCAAAAACACCTCGGGGTACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 AGACACCGATCAACAGAAACCAGCTGTCCCAGAACCGGGGACTGGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106100 AGACACCGATCAACAGAAACCAGCTGTCCCAGAACCGGGGACTGGGGGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 ATTATGGTGAAACGGGCCTATGAGACT         ATGGCAGGGGCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106150 ATTATGGTGAAACGGGCCTATGAGACTGTG...CAGATGGCAGGGGCAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GGTTCCTTTCTCTGCCAATGGAAGGCCTCTGGCTTCAGGGATTCGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106299 GGTTCCTTTCTCTGCCAATGGAAGGCCTCTGGCTTCAGGGATTCGTTCAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 GCTCACAGCCAGCAGCCAAGCGTCAGAAACTAAACCCAGCTGATGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106349 GCTCACAGCCAGCAGCCAAGCGTCAGAAACTAAACCCAGCTGATGCCCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 AATCCTGTGGTGTTTGTGGCCACAAAGGATACCAG         GGCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106399 AATCCTGTGGTGTTTGTGGCCACAAAGGATACCAGGTA...CAGGGCCCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 ACGGAAGGCTCTGACCCATCTGGAAATGCGGCGAGCTGCTCGCCGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106658 ACGGAAGGCTCTGACCCATCTGGAAATGCGGCGAGCTGCTCGCCGACCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 ACTTGCCCCTGAAGGTGAAGCCAACGCTGATTGCAGTGCGGCCCCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106708 ACTTGCCCCTGAAGGTGAAGCCAACGCTGATTGCAGTGCGGCCCCCTGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 CCTCTACCTGCACCCTCACATCCTGCCAGCACCAATGAGCCTATTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106758 CCTCTACCTGCACCCTCACATCCTGCCAGCACCAATGAGCCTATTGTCCT

   2150     .
   1998 GGAGGAC
        |||||||
 106808 GGAGGAC