seq1 = pF1KB6190.tfa, 1977 bp
seq2 = pF1KB6190/gi568815579f_57253722.tfa (gi568815579f:57253722_57457846), 204125 bp

>pF1KB6190 1977
>gi568815579f:57253722_57457846 (Chr19)

1-33  (97944-97976)   100% ->
34-160  (100004-100130)   100% ->
161-1977  (102309-104125)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCGGCGGTGCTGATGGACCGGGTTCAG         AGTTGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  97944 ATGGCAGCGGCGGTGCTGATGGACCGGGTTCAGGTG...CAGAGTTGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GACCTTCGAGGATGTGTTCGTGTACTTCTCTCGGGAGGAGTGGGAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 GACCTTCGAGGATGTGTTCGTGTACTTCTCTCGGGAGGAGTGGGAACTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGAGGAGGCACAGAGATTCCTGTACCGTGATGTGATGCTGGAGAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 TTGAGGAGGCACAGAGATTCCTGTACCGTGATGTGATGCTGGAGAACTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCACTTGTGGCTACACTAG         GTTTTTGGTGTGAAGCAGAACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100112 GCACTTGTGGCTACACTAGGTA...CAGGTTTTTGGTGTGAAGCAGAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAGGCACCTTCTGAGCAGAGCGTTTCTGTAGAAGGAGTGTCACAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102331 TGAGGCACCTTCTGAGCAGAGCGTTTCTGTAGAAGGAGTGTCACAGGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGACTGCTGAGTCAGGTCTTTTCCAGAAAGCACACCCATGTGAGATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102381 GGACTGCTGAGTCAGGTCTTTTCCAGAAAGCACACCCATGTGAGATGTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACCCACTCTTGAAAGACATTTTGCACCTGGCTGAACACCAGGGATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102431 GACCCACTCTTGAAAGACATTTTGCACCTGGCTGAACACCAGGGATCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTTACACAGAAACTGTGCACACGTGGGCTGTGTAGGAGAAGATTCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102481 CCTTACACAGAAACTGTGCACACGTGGGCTGTGTAGGAGAAGATTCTCGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAGTGCAAACTTTTACCAGCACCAGAAGCAACATAATGGAGAGAATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102531 TCAGTGCAAACTTTTACCAGCACCAGAAGCAACATAATGGAGAGAATTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTCAGAGGGGATGATGGAGGGGCCTCATTTGTGAAGAGCTGTACAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102581 TTCAGAGGGGATGATGGAGGGGCCTCATTTGTGAAGAGCTGTACAGTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATGTTAGGGAGATCCTTTACGTGCAGGGAGGAAGGGATGGACTTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102631 CATGTTAGGGAGATCCTTTACGTGCAGGGAGGAAGGGATGGACTTACCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATAGCTCTGGCCTTTTCCAGCACCAGACCACTTACAATAGGGTGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102681 ATAGCTCTGGCCTTTTCCAGCACCAGACCACTTACAATAGGGTGAGTCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGCAGAAGGACTGAATGCATGGAGTCTTTCCCACACAGCTCCAGTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102731 TGCAGAAGGACTGAATGCATGGAGTCTTTCCCACACAGCTCCAGTCTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCAACACCAAGGAGACTATGATGGACAGATGCTTTTCAGTTGCGGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102781 GCAACACCAAGGAGACTATGATGGACAGATGCTTTTCAGTTGCGGTGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AAGGGAAAGCCTTCCTGGACACCTTTACTCTTCTTGACAGCCAGATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102831 AAGGGAAAGCCTTCCTGGACACCTTTACTCTTCTTGACAGCCAGATGACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CATGCTGAGGTGAGACCCTTCAGATGCCTACCATGTGGAAATGTGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102881 CATGCTGAGGTGAGACCCTTCAGATGCCTACCATGTGGAAATGTGTTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGAGAAATCAGCTCTTATTAATCACAGAAAAATCCACAGTGGAGAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102931 GGAGAAATCAGCTCTTATTAATCACAGAAAAATCCACAGTGGAGAAATAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CTCATGTGTGTAAGGAGTGTGGAAAAGCCTTCATTCACTTGCACCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102981 CTCATGTGTGTAAGGAGTGTGGAAAAGCCTTCATTCACTTGCACCACCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AAAATGCACCAGAAATTTCACACTGGAAAAAGACACTATACATGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103031 AAAATGCACCAGAAATTTCACACTGGAAAAAGACACTATACATGCAGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 ATGTGGGAAGGCCTTCAGCCGCAAGGACACACTTGTTCAGCATCAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103081 ATGTGGGAAGGCCTTCAGCCGCAAGGACACACTTGTTCAGCATCAGAGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TTCACACTGGAGAAAGATCTTATGACTGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103131 TTCACACTGGAGAAAGATCTTATGACTGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AGCAGAAGCTCCCACCTTGTTCAGCACCAGAGAATTCACACAGGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103181 AGCAGAAGCTCCCACCTTGTTCAGCACCAGAGAATTCACACAGGAGAAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCCTTATAAGTGCAACGAATGTGGGAAAGCCTTTAGCCGTAAAGACACAC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 103231 GCCTTATAAGTGCAACAAATGTGGGAAAGCCTTTAGCCGTAAAGACACAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TTGTTCAGCACCAGAGATTTCATACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103281 TTGTTCAGCACCAGAGATTTCATACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GAATGTGGAAAATTCTTTAGCCAAAGCTCCCACCTTATTGAGCACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103331 GAATGTGGAAAATTCTTTAGCCAAAGCTCCCACCTTATTGAGCACTGGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 AATTCATACCGGGGCAAGGCCCTATGAATGCATAGAATGTGGAAAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103381 AATTCATACCGGGGCAAGGCCCTATGAATGCATAGAATGTGGAAAATTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TTAGCCATAACTCTAGCCTCATTAAACATCGGAGAGTCCACACAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103431 TTAGCCATAACTCTAGCCTCATTAAACATCGGAGAGTCCACACAGGAGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AGATCCTACGTGTGCAGCAAATGTGGGAAGGCCTTTGGCTGCAAAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103481 AGATCCTACGTGTGCAGCAAATGTGGGAAGGCCTTTGGCTGCAAAGACAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 ACTTGTTCAGCACCAGATAATTCACACTGGAGCAAGGCCTTATGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103531 ACTTGTTCAGCACCAGATAATTCACACTGGAGCAAGGCCTTATGAGTGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 GTGAATGTGGGAAGGCCTTCAGCCGTAAAGACACACTTGTGCAACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103581 GTGAATGTGGGAAGGCCTTCAGCCGTAAAGACACACTTGTGCAACACCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AAAATCCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGTGGTGAATGTGGTAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103631 AAAATCCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGTGGTGAATGTGGTAAATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 CTTCAGCCATAGCTCCAACCTTATTGTACACCAGAGAATTCACACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103681 CTTCAGCCATAGCTCCAACCTTATTGTACACCAGAGAATTCACACTGGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CAAAGCCTTATGAGTGCAATGAATGTGGGAAATGCTTTAGCCACAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103731 CAAAGCCTTATGAGTGCAATGAATGTGGGAAATGCTTTAGCCACAACTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 AGCCTCATTTTGCACCAGAGAGTTCACACAGGAGCAAGGCCTTATGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103781 AGCCTCATTTTGCACCAGAGAGTTCACACAGGAGCAAGGCCTTATGTGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 CAGTGAATGTGGGAAGGCTTACATTAGTAGCTCCCACCTTGTTCAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103831 CAGTGAATGTGGGAAGGCTTACATTAGTAGCTCCCACCTTGTTCAACACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 AGAAAGTTCACACTGGAGCAAGACCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103881 AGAAAGTTCACACTGGAGCAAGACCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 TTCTTTAGCCGCAACTCTGGCCTCATTCTGCACCAGAGGGTTCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103931 TTCTTTAGCCGCAACTCTGGCCTCATTCTGCACCAGAGGGTTCACACTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 AGAAAAGCCTTACGTATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTATAGCAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103981 AGAAAAGCCTTACGTATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTATAGCAGAAGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 CCCATCTTGTTCGTCACCAGAAAGCTCACACTGGAGAAAGAGCTCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104031 CCCATCTTGTTCGTCACCAGAAAGCTCACACTGGAGAAAGAGCTCACGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1933 TGCAACAGTTTTGGTGGCCCTTTAGCTGCATCTCTTAAACTTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104081 TGCAACAGTTTTGGTGGCCCTTTAGCTGCATCTCTTAAACTTGTT