seq1 = pF1KB6166.tfa, 1809 bp
seq2 = pF1KB6166/gi568815586r_94922232.tfa (gi568815586r:94922232_95167384), 245153 bp

>pF1KB6166 1809
>gi568815586r:94922232_95167384 (Chr12)

(complement)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-285  (104647-104877)   100% ->
286-364  (107401-107479)   100% ->
365-544  (108896-109075)   100% ->
545-692  (109507-109654)   100% ->
693-783  (109742-109832)   100% ->
784-965  (115442-115623)   100% ->
966-1131  (118152-118317)   100% ->
1132-1253  (126788-126909)   100% ->
1254-1393  (135897-136036)   100% ->
1394-1531  (138861-138998)   100% ->
1532-1637  (142130-142235)   100% ->
1638-1809  (144982-145153)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAACCATAGAAGAAATTGCACATCAAATTATTGAACAACAGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAACCATAGAAGAAATTGCACATCAAATTATTGAACAACAGATGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAG         ATTGTTACAGAGCAGCAAACTGGGCAGAAAATCCAGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGTA...TAGATTGTTACAGAGCAGCAAACTGGGCAGAAAATCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGTGACAGCACTTGATCATAATACCCAAGGCAAGCAGTTCATTCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104684 TTGTGACAGCACTTGATCATAATACCCAAGGCAAGCAGTTCATTCTGACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATCACGACGGCTCTACTCCAAGCAAAGTCATTCTGGCCAGGCAAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104734 AATCACGACGGCTCTACTCCAAGCAAAGTCATTCTGGCCAGGCAAGATTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACTCCGGGAAAAGTTTTCCTTACAACTCCAGATGCAGCAGGTGTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104784 CACTCCGGGAAAAGTTTTCCTTACAACTCCAGATGCAGCAGGTGTCAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTTATTTTTTACCACTCCTGATCTGTCTGCACAACACCTGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104834 AGTTATTTTTTACCACTCCTGATCTGTCTGCACAACACCTGCAGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286    CTCCTAACAGATAATTCTCCAGACCAAGGACCAAATAAGGTTTTTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107398 TAGCTCCTAACAGATAATTCTCCAGACCAAGGACCAAATAAGGTTTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTTTGCGTAGTATGTGGAGACAAAGCATCAG         GACGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 107448 TCTTTGCGTAGTATGTGGAGACAAAGCATCAGGTA...TAGGACGTCATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGGAGCAGTAACTTGTGAAGGCTGCAAAGGATTTTTTAAAAGAAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108905 ATGGAGCAGTAACTTGTGAAGGCTGCAAAGGATTTTTTAAAAGAAGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGAAAAAATTTAGTATATTCATGTCGAGGATCAAAGGATTGTATTATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108955 CGAAAAAATTTAGTATATTCATGTCGAGGATCAAAGGATTGTATTATTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAAGCACCACCGAAACCGCTGTCAATACTGCAGGTTACAGAGATGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109005 TAAGCACCACCGAAACCGCTGTCAATACTGCAGGTTACAGAGATGTATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGTTTGGAATGAAGCAAGACT         CTGTCCAATGTGAAAGAAAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 109055 CGTTTGGAATGAAGCAAGACTGTA...TAGCTGTCCAATGTGAAAGAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCCATTGAAGTATCACGAGAAAAATCTTCCAACTGTGCCGCTTCAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109527 CCCATTGAAGTATCACGAGAAAAATCTTCCAACTGTGCCGCTTCAACAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAAAATCTATATCCGAAAGGACCTTCGTAGCCCATTAACTGCAACTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109577 AAAAATCTATATCCGAAAGGACCTTCGTAGCCCATTAACTGCAACTCCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTTTTGTAACAGATAGTGAAAGTACAAG         GTCAACAGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 109627 CTTTTGTAACAGATAGTGAAAGTACAAGGTA...CAGGTCAACAGGACTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTAGATTCAGGAATGTTCATGAATATTCATCCATCTGGAGTAAAAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109755 TTAGATTCAGGAATGTTCATGAATATTCATCCATCTGGAGTAAAAACTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTCAGCTGTGCTGATGACATCAGATAAG         GCTGAATCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 109805 GTCAGCTGTGCTGATGACATCAGATAAGGTG...AAGGCTGAATCATGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGGGAGATTTAAGTACATTGGCCAATGTGGTTACATCATTAGCGAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115455 AGGGAGATTTAAGTACATTGGCCAATGTGGTTACATCATTAGCGAATCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGAAAAACTAAAGATCTTTCTCAAAATAGTAATGAAATGTCTATGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115505 GGAAAAACTAAAGATCTTTCTCAAAATAGTAATGAAATGTCTATGATTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAGCTTAAGCAATGATGATACCTCTTTGTGTGAATTTCAAGAAATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115555 AAGCTTAAGCAATGATGATACCTCTTTGTGTGAATTTCAAGAAATGCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCAACGGTGATGTTTCAAG         GGCATTTGACACTCTTGCAAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 115605 CCAACGGTGATGTTTCAAGGTA...CAGGGCATTTGACACTCTTGCAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GCATTGAATCCTGGAGAGAGCACAGCCTGCCAGAGCTCAGTAGCGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118174 GCATTGAATCCTGGAGAGAGCACAGCCTGCCAGAGCTCAGTAGCGGGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGAAGGAAGTGTACACCTAATCACTGGAGATTCAAGCATAAATTACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118224 GGAAGGAAGTGTACACCTAATCACTGGAGATTCAAGCATAAATTACACCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AAAAAGAGGGGCCACTTCTCAGCGATTCACATGTAGCTTTCAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 118274 AAAAAGAGGGGCCACTTCTCAGCGATTCACATGTAGCTTTCAGGGTA...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132    CTCACCATGCCTTCTCCTATGCCTGAGTACCTGAATGTGCACTACAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126785 TAGCTCACCATGCCTTCTCCTATGCCTGAGTACCTGAATGTGCACTACAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGGGGAGTCTGCCTCCAGACTGCTGTTCTTATCAATGCACTGGGCACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126835 TGGGGAGTCTGCCTCCAGACTGCTGTTCTTATCAATGCACTGGGCACTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CGATTCCTTCTTTCCAGGCTCTAGG         GCAAGAAAACAGCATA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 126885 CGATTCCTTCTTTCCAGGCTCTAGGGTG...TAGGCAAGAAAACAGCATA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TCACTGGTGAAAGCTTACTGGAATGAACTTTTTACTCTTGGTCTTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135913 TCACTGGTGAAAGCTTACTGGAATGAACTTTTTACTCTTGGTCTTGCCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GTGCTGGCAAGTGATGAATGTAGCAACTATATTAGCAACATTTGTCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135963 GTGCTGGCAAGTGATGAATGTAGCAACTATATTAGCAACATTTGTCAATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GTCTTCACAATAGTCTTCAACAAG         ATAAAATGTCAACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 136013 GTCTTCACAATAGTCTTCAACAAGGTA...AAGATAAAATGTCAACAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGAAGAAAATTATTGATGGAGCACATCTTCAAACTACAGGAGTTTTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138878 AGAAGAAAATTATTGATGGAGCACATCTTCAAACTACAGGAGTTTTGTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CAGCATGGTTAAACTCTGCATTGATGGATACGAATATGCCTACCTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138928 CAGCATGGTTAAACTCTGCATTGATGGATACGAATATGCCTACCTGAAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAATAGTACTCTTCAGTCCAG         ATCATCCAAGCCTAGAAAAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 138978 CAATAGTACTCTTCAGTCCAGGTA...CAGATCATCCAAGCCTAGAAAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ATGGAACAGATAGAGAAATTTCAGGAAAAGGCTTATGTGGAATTCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142150 ATGGAACAGATAGAGAAATTTCAGGAAAAGGCTTATGTGGAATTCCAAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TTATATAACCAAAACATATCCAGATGACACCTACAG         GTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 142200 TTATATAACCAAAACATATCCAGATGACACCTACAGGTA...TAGGTTAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CCAGACTACTACTCAGATTGCCAGCTTTAAGACTGATGAATGCTACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144987 CCAGACTACTACTCAGATTGCCAGCTTTAAGACTGATGAATGCTACCATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 ACTGAAGAATTGTTTTTCAAAGGTCTCATTGGCAATATACGAATTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145037 ACTGAAGAATTGTTTTTCAAAGGTCTCATTGGCAATATACGAATTGACAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGTTATCCCACATATTTTGAAAATGGAGCCTGCAGATTATAACTCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145087 TGTTATCCCACATATTTTGAAAATGGAGCCTGCAGATTATAACTCTCAAA

   1900     .    :    .
   1793 TAATTGGTCACAGCATT
        |||||||||||||||||
 145137 TAATTGGTCACAGCATT