seq1 = pF1KB6162.tfa, 1941 bp
seq2 = pF1KB6162/gi568815575r_48862584.tfa (gi568815575r:48862584_49070271), 207688 bp

>pF1KB6162 1941
>gi568815575r:48862584_49070271 (ChrX)

(complement)

1-1121  (100001-101121)   100% ->
1122-1284  (103166-103328)   100% ->
1285-1368  (103428-103511)   100% ->
1369-1467  (103596-103694)   100% ->
1468-1718  (103967-104217)   100% ->
1719-1941  (107466-107688)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCAGGCCTGGCCACGTGGCTGCCTTTTGCTCGGGCAGCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCAGGCCTGGCCACGTGGCTGCCTTTTGCTCGGGCAGCAGCAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTGGCTGCCCCTGGCCCAGCAACCCCTGCCCCCGGCACCGGGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCTGGCTGCCCCTGGCCCAGCAACCCCTGCCCCCGGCACCGGGGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCATCTCGAGGAGATGAGGTTCTGGTGGTGAACGTGAGCGGACGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCATCTCGAGGAGATGAGGTTCTGGTGGTGAACGTGAGCGGACGGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGAGACTTGGAAGAATACGCTGGACCGCTACCCAGACACCTTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGAGACTTGGAAGAATACGCTGGACCGCTACCCAGACACCTTGCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCTCGGAGAAGGAATTCTTCTACGATGCTGACTCAGGCGAGTACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCTCGGAGAAGGAATTCTTCTACGATGCTGACTCAGGCGAGTACTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGATCGCGACCCTGACATGTTCCGCCATGTGCTGAACTTCTACCGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGATCGCGACCCTGACATGTTCCGCCATGTGCTGAACTTCTACCGAACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGCGGCTGCATTGCCCACGGCAGGAGTGCATCCAGGCCTTCGACGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGCGGCTGCATTGCCCACGGCAGGAGTGCATCCAGGCCTTCGACGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGCTTTCTACGGCCTGGTTCCCGAGCTAGTCGGTGACTGCTGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGCTTTCTACGGCCTGGTTCCCGAGCTAGTCGGTGACTGCTGCCTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGAGTATCGGGACCGAAAGAAGGAGAATGCCGAGCGCCTGGCAGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAGAGTATCGGGACCGAAAGAAGGAGAATGCCGAGCGCCTGGCAGAGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGGAGGCAGAGCAGGCCGGGGACGGCCCAGCCCTGCCAGCAGGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGGAGGCAGAGCAGGCCGGGGACGGCCCAGCCCTGCCAGCAGGCAGCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGCGGCAGCGGCTCTGGCGGGCCTTCGAGAATCCACACACGAGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGCGGCAGCGGCTCTGGCGGGCCTTCGAGAATCCACACACGAGCACCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGCCCTCGTTTTCTACTATGTGACCGGCTTCTTCATCGCCGTGTCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAGCCCTCGTTTTCTACTATGTGACCGGCTTCTTCATCGCCGTGTCGGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCGCCAATGTGGTGGAGACCATCCCATGCCGCGGCTCTGCACGCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCGCCAATGTGGTGGAGACCATCCCATGCCGCGGCTCTGCACGCAGGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCAAGGGAGCAGCCCTGTGGCGAACGCTTCCCACAGGCCTTTTTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCAAGGGAGCAGCCCTGTGGCGAACGCTTCCCACAGGCCTTTTTCTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGACACAGCCTGTGTACTCATATTCACAGGTGAATACCTCCTGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGACACAGCCTGTGTACTCATATTCACAGGTGAATACCTCCTGCGGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGCCGCCCCCAGCCGTTGCCGCTTCCTGCGGAGTGTCATGAGCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGCCGCCCCCAGCCGTTGCCGCTTCCTGCGGAGTGTCATGAGCCTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGACGTGGTGGCCATCCTGCCCTACTACATTGGGCTTTTGGTGCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGACGTGGTGGCCATCCTGCCCTACTACATTGGGCTTTTGGTGCCCAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACGACGATGTCTCTGGCGCCTTTGTCACCCTGCGTGTGTTCCGGGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACGACGATGTCTCTGGCGCCTTTGTCACCCTGCGTGTGTTCCGGGTGTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGCATCTTCAAGTTCTCCAGGCACTCACAGGGCTTGAGGATTCTGGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGCATCTTCAAGTTCTCCAGGCACTCACAGGGCTTGAGGATTCTGGGCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CACACTCAAGAGCTGTGCCTCTGAGCTGGGCTTTCTCCTCTTTTCCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CACACTCAAGAGCTGTGCCTCTGAGCTGGGCTTTCTCCTCTTTTCCCTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCATGGCCATCATCATCTTTGCCACTGTCATGTTTTATGCTGAGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCATGGCCATCATCATCTTTGCCACTGTCATGTTTTATGCTGAGAAGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ACAAACAAGACCAACTTTACAAGCATCCCTGCGGCCTTCTGGTATACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ACAAACAAGACCAACTTTACAAGCATCCCTGCGGCCTTCTGGTATACCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGTCACCATGACCACGCTTGG         CTACGGAGACATGGTGCCCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101101 TGTCACCATGACCACGCTTGGGTG...CAGCTACGGAGACATGGTGCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GCACCATTGCTGGCAAGATTTTCGGGTCCATCTGCTCACTCAGTGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103186 GCACCATTGCTGGCAAGATTTTCGGGTCCATCTGCTCACTCAGTGGCGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TTGGTCATTGCCCTGCCTGTGCCAGTCATTGTGTCCAACTTTAGCCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103236 TTGGTCATTGCCCTGCCTGTGCCAGTCATTGTGTCCAACTTTAGCCGCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CTACCACCAGAACCAGCGGGCTGACAAGCGCCGAGCACAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103286 CTACCACCAGAACCAGCGGGCTGACAAGCGCCGAGCACAGCAGGTA...C

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1285   AAGGTGCGCTTGGCAAGGATCCGATTGGCAAAGAGTGGTACCACCAAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103426 AGAAGGTGCGCTTGGCAAGGATCCGATTGGCAAAGAGTGGTACCACCAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GCCTTCCTGCAGTACAAGCAGAATGGGGGCCTTGAG         GACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103476 GCCTTCCTGCAGTACAAGCAGAATGGGGGCCTTGAGGTG...CAGGACAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CGGCAGTGGCGAGGAACAGGCTCTTTGTGTCAGGAACCGTTCTGCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103601 CGGCAGTGGCGAGGAACAGGCTCTTTGTGTCAGGAACCGTTCTGCCTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AACAGCAACATCACCACTTGCTGCACTGTCTAGAGAAGACAACG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103651 AACAGCAACATCACCACTTGCTGCACTGTCTAGAGAAGACAACGGTG...

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1468    TGCCATGAGTTCACAGATGAGCTCACCTTCAGTGAAGCCCTGGGAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103964 TAGTGCCATGAGTTCACAGATGAGCTCACCTTCAGTGAAGCCCTGGGAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CGTCTCGCCGGGTGGCCGCACCAGCCGTAGCACCTCTGTGTCTTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104014 CGTCTCGCCGGGTGGCCGCACCAGCCGTAGCACCTCTGTGTCTTCCCAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CAGTGGGACCCGGAAGCCTGCTGTCTTCTTGCTGCCCTCGCAGGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104064 CAGTGGGACCCGGAAGCCTGCTGTCTTCTTGCTGCCCTCGCAGGGCCAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 CGCCGCGCCATCCGCCTTGCCAACTCCACTGCCTCAGTCAGCCGTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104114 CGCCGCGCCATCCGCCTTGCCAACTCCACTGCCTCAGTCAGCCGTGGCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 CATGCAGGAGCTGGACATGCTGGCAGGGCTGCGCAGGAGCCATGCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104164 CATGCAGGAGCTGGACATGCTGGCAGGGCTGCGCAGGAGCCATGCCCCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 AGAG         CCGCTCCAGCCTCAATGCCAAGCCCCATGACAGCCTT
        ||||>>>...>>>||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 104214 AGAGGTA...CAGCCGTTCCAGCCTCAATGCCAAGCCCCATGACAGCCTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GACCTGAACTGCGACAGCCGGGACTTCGTGGCTGCCATTATCAGCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107503 GACCTGAACTGCGACAGCCGGGACTTCGTGGCTGCCATTATCAGCATCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 TACCCCTCCTGCCAACACCCCAGATGAGAGCCAACCTTCCTCCCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107553 TACCCCTCCTGCCAACACCCCAGATGAGAGCCAACCTTCCTCCCCTGGCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 GCGGTGGCAGGGCCGGCAGCACCCTCAGGAACTCCAGCCTGGGTACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107603 GCGGTGGCAGGGCCGGCAGCACCCTCAGGAACTCCAGCCTGGGTACCCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .
   1906 TGCCTCTTCCCCGAGACTGTCAAGATCTCATCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107653 TGCCTCTTCCCCGAGACTGTCAAGATCTCATCCCTG