seq1 = pF1KB6154.tfa, 1926 bp
seq2 = pF1KB6154/gi568815580f_2472986.tfa (gi568815580f:2472986_2716571), 243586 bp

>pF1KB6154 1926
>gi568815580f:2472986_2716571 (Chr18)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-179  (102004-102081)   100% ->
180-303  (104761-104884)   100% ->
304-476  (104984-105156)   100% ->
477-579  (105942-106044)   100% ->
580-669  (112128-112217)   100% ->
670-763  (114845-114938)   100% ->
764-870  (116219-116325)   100% ->
871-1015  (117033-117177)   100% ->
1016-1221  (122431-122636)   100% ->
1222-1374  (126034-126186)   100% ->
1375-1464  (128411-128500)   100% ->
1465-1557  (133430-133522)   100% ->
1558-1688  (135715-135845)   100% ->
1689-1791  (137774-137876)   100% ->
1792-1926  (143452-143586)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCGCAGTTCAGTTTCCAGCGGTGGTGCTGGCCGCCTCTCCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCGCAGTTCAGTTTCCAGCGGTGGTGCTGGCCGCCTCTCCATGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGTTAAGATCCCAGGATGTAAATAAACAAGGCCTCTATACCCCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGTTAAGATCCCAGGATGTAAATAAACAAGGCCTCTATACCCCTCAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 C         CAAAGAGAAACCAACCTTTGGAAAGTTGAGTATAAACAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTG...AAGCAAAGAGAAACCAACCTTTGGAAAGTTGAGTATAAACAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCGACATCTGAAAGAAAAGTCTCGCTATTTGGCAAAAG         AAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102044 CCGACATCTGAAAGAAAAGTCTCGCTATTTGGCAAAAGGTA...CAGAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAGTGGACATGGATCCCGGAATAGTCAACTTGGTATATTTTCCAGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104764 TAGTGGACATGGATCCCGGAATAGTCAACTTGGTATATTTTCCAGTTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAAATCAAGGACCCGAGACCACTTAATGACAAAGCATTCATTCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104814 AGAAAATCAAGGACCCGAGACCACTTAATGACAAAGCATTCATTCAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTATTCGACAACTCTGTGAG         TTTCTTACAGAAAATGGTTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104864 TGTATTCGACAACTCTGTGAGGTA...TAGTTTCTTACAGAAAATGGTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCACATAATGTGTCCATGAAATCTCTACAAGCTCCCTCTGTTAAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105004 TGCACATAATGTGTCCATGAAATCTCTACAAGCTCCCTCTGTTAAAGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCCTGAAGATCTTCACATTTCTTTATGGCTTCCTGTGCCCCTCATACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105054 TCCTGAAGATCTTCACATTTCTTTATGGCTTCCTGTGCCCCTCATACGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTTCCTGACACAAAGTTTGAAGAAGAGGTTCCAAGAATCTTTAAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105104 CTTCCTGACACAAAGTTTGAAGAAGAGGTTCCAAGAATCTTTAAAGACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGG         GTATCCTTTTGCACTATCCAAAAGCTCCATGTACACAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105154 TGGGTA...TAGGTATCCTTTTGCACTATCCAAAAGCTCCATGTACACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGGGGCTCCTCATACATGGCCTCACATTGTGGCAGCCTTAGTTTGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105980 TGGGGGCTCCTCATACATGGCCTCACATTGTGGCAGCCTTAGTTTGGCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATAGACTGCATCAAG         ATACATACTGCCATGAAAGAAAGCTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106030 ATAGACTGCATCAAGGTA...TAGATACATACTGCCATGAAAGAAAGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACCTTTATTTGATGATGGGCAGCCTTGGGGAGAAGAAACTGAAGATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112154 ACCTTTATTTGATGATGGGCAGCCTTGGGGAGAAGAAACTGAAGATGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTATGCATAATAAG         TTGTTTTTGGACTACACCATAAAATGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 112204 TTATGCATAATAAGGTA...TAGTTGTTTTTGGACTACACCATAAAATGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TATGAGAGTTTTATGAGTGGTGCCGACAGCTTTGATGAGATGAATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114872 TATGAGAGTTTTATGAGTGGTGCCGACAGCTTTGATGAGATGAATGCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCTGCAGTCAAAACTGA         AGGATTTATTTAATGTGGATGCTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114922 GCTGCAGTCAAAACTGAGTA...CAGAGGATTTATTTAATGTGGATGCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTAAGCTGGAATCATTAGAAGCAAAAAACAGAGCATTGAATGAACAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116243 TTAAGCTGGAATCATTAGAAGCAAAAAACAGAGCATTGAATGAACAGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCAAGATTGGAACAAGAAAGAGAAAAAGAACCG         AATCGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116293 GCAAGATTGGAACAAGAAAGAGAAAAAGAACCGGTT...AAGAATCGTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGAGTCGTTGAGAAAACTGAAGGCTTCCTTACAAGGAGATGTTCAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117041 AGAGTCGTTGAGAAAACTGAAGGCTTCCTTACAAGGAGATGTTCAAAAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATCAGGCATACATGAGCAATTTGGAGTCTCATTCAGCCATTCTTGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117091 ATCAGGCATACATGAGCAATTTGGAGTCTCATTCAGCCATTCTTGACCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAATTAAATGGTCTCAATGAGGAAATTGCTAGAGTAG         AACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 117141 AAATTAAATGGTCTCAATGAGGAAATTGCTAGAGTAGGTA...CAGAACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGAATGTGAAACAATAAAACAGGAGAACACTCGACTACAGAATATCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122435 AGAATGTGAAACAATAAAACAGGAGAACACTCGACTACAGAATATCATTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ACAACCAGAAGTACTCAGTTGCAGACATTGAGCGAATAAATCATGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122485 ACAACCAGAAGTACTCAGTTGCAGACATTGAGCGAATAAATCATGAAAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AATGAATTGCAGCAGACTATTAATAAATTAACCAAGGACCTGGAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122535 AATGAATTGCAGCAGACTATTAATAAATTAACCAAGGACCTGGAAGCTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 ACAACAGAAGTTGTGGAATGAGGAGTTAAAATATGCCAGAGGCAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122585 ACAACAGAAGTTGTGGAATGAGGAGTTAAAATATGCCAGAGGCAAAGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CG         ATTGAAACACAATTAGCAGAGTATCACAAATTGGCTAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122635 CGGTA...CAGATTGAAACACAATTAGCAGAGTATCACAAATTGGCTAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAATTAAAACTTATTCCTAAAGGTGCTGAGAATTCCAAAGGTTATGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126073 AAATTAAAACTTATTCCTAAAGGTGCTGAGAATTCCAAAGGTTATGACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGAAATTAAGTTTAATCCCGAGGCTGGTGCCAACTGCCTTGTCAAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126123 TGAAATTAAGTTTAATCCCGAGGCTGGTGCCAACTGCCTTGTCAAATACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GGGCTCAAGTTTAT         GTACCTCTTAAGGAACTCCTGAATGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 126173 GGGCTCAAGTTTATGTA...TAGGTACCTCTTAAGGAACTCCTGAATGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ACTGAAGAAGAAATTAATAAAGCCCTAAATAAAAAAATGGGTTTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128438 ACTGAAGAAGAAATTAATAAAGCCCTAAATAAAAAAATGGGTTTGGAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TACTTTAGAACAA         TTGAATGCAATGATAACAGAAAGCAAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 128488 TACTTTAGAACAAGTA...CAGTTGAATGCAATGATAACAGAAAGCAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GAAGTGTGAGAACTCTGAAAGAAGAAGTTCAAAAGCTGGATGATCTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133458 GAAGTGTGAGAACTCTGAAAGAAGAAGTTCAAAAGCTGGATGATCTTTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CAACAAAAAATTAAG         GAAGCAGAGGAAGAGGATGAAAAATG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 133508 CAACAAAAAATTAAGGTA...TAGGAAGCAGAGGAAGAGGATGAAAAATG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TGCCAGTGAGCTTGAGTCCTTGGAGAAACACAAGCACCTGCTAGAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135741 TGCCAGTGAGCTTGAGTCCTTGGAGAAACACAAGCACCTGCTAGAAAGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CTGTTAACCAGGGGCTCAGTGAAGCTATGAATGAATTAGATGCTGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135791 CTGTTAACCAGGGGCTCAGTGAAGCTATGAATGAATTAGATGCTGTTCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CGGGA         ATACCAACTAGTTGTGCAAACCACGACTGAAGAAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135841 CGGGAGTA...CAGATACCAACTAGTTGTGCAAACCACGACTGAAGAAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 ACGAAAAGTGGGAAATAACTTGCAACGTCTGTTAGAGATGGTTGCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137810 ACGAAAAGTGGGAAATAACTTGCAACGTCTGTTAGAGATGGTTGCTACAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 ATGTTGGGTCTGTAGAG         AAACATCTTGAGGAGCAGATTGCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 137860 ATGTTGGGTCTGTAGAGGTA...TAGAAACATCTTGAGGAGCAGATTGCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AAAGTTGATAGAGAATATGAAGAATGCATGTCAGAAGATCTCTCGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143476 AAAGTTGATAGAGAATATGAAGAATGCATGTCAGAAGATCTCTCGGAAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TATTAAAGAGATTAGAGATAAGTATGAGAAGAAAGCTACTCTAATTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143526 TATTAAAGAGATTAGAGATAAGTATGAGAAGAAAGCTACTCTAATTAAGT

   2050     .    :
   1916 CTTCTGAAGAA
        |||||||||||
 143576 CTTCTGAAGAA