seq1 = pF1KB6133.tfa, 1770 bp
seq2 = pF1KB6133/gi568815586r_52414945.tfa (gi568815586r:52414945_52620296), 205352 bp

>pF1KB6133 1770
>gi568815586r:52414945_52620296 (Chr12)

(complement)

1-555  (100001-100555)   100% ->
556-770  (101137-101351)   100% ->
771-831  (102134-102194)   100% ->
832-927  (102305-102400)   100% ->
928-1092  (102543-102707)   100% ->
1093-1218  (103065-103190)   100% ->
1219-1439  (103440-103660)   100% ->
1440-1474  (104465-104499)   100% ->
1475-1770  (105057-105352)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCGCCAGTCAAGTGTGTCCTTCCGGAGCGGGGGCAGTCGTAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCGCCAGTCAAGTGTGTCCTTCCGGAGCGGGGGCAGTCGTAGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCACCGCCTCTGCCATCACCCCGTCTGTCTCCCGCACCAGCTTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCACCGCCTCTGCCATCACCCCGTCTGTCTCCCGCACCAGCTTCACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGTGTCCCGGTCCGGGGGTGGCGGTGGTGGTGGCTTCGGCAGGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGTGTCCCGGTCCGGGGGTGGCGGTGGTGGTGGCTTCGGCAGGGTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTGCGGGTGCTTGTGGAGTGGGTGGCTATGGCAGCCGGAGCCTCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTTGCGGGTGCTTGTGGAGTGGGTGGCTATGGCAGCCGGAGCCTCTACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGGGGGCTCCAAGAGGATATCCATCAGCACTAGTGGTGGCAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGGGGGCTCCAAGAGGATATCCATCAGCACTAGTGGTGGCAGCTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAACCGGTTTGGTGCTGGTGCTGGAGGCGGCTATGGCTTTGGAGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAACCGGTTTGGTGCTGGTGCTGGAGGCGGCTATGGCTTTGGAGGTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCGGTAGTGGATTTGGTTTCGGCGGTGGAGCTGGTGGTGGCTTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCGGTAGTGGATTTGGTTTCGGCGGTGGAGCTGGTGGTGGCTTTGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGTGGCGGAGCTGGCTTTGGAGGTGGCTTCGGTGGCCCTGGCTTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGTGGCGGAGCTGGCTTTGGAGGTGGCTTCGGTGGCCCTGGCTTTCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCTGCCCTCCTGGAGGTATCCAAGAGGTCACTGTCAACCAGAGTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCTGCCCTCCTGGAGGTATCCAAGAGGTCACTGTCAACCAGAGTCTCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTCCCCTCAACCTGCAAATCGACCCCAGCATCCAGAGGGTGAGGACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACTCCCCTCAACCTGCAAATCGACCCCAGCATCCAGAGGGTGAGGACCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGCGCGAGCAGATCAAGACCCTCAACAATAAGTTTGCCTCCTTCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAGCGCGAGCAGATCAAGACCCTCAACAATAAGTTTGCCTCCTTCATCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACAAG         GTGCGGTTCCTGGAGCAGCAGAACAAGGTTCTGGAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACAAGGTG...CAGGTGCGGTTCCTGGAGCAGCAGAACAAGGTTCTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACCAAGTGGACCCTGCTGCAGGAGCAGGGCACCAAGACTGTGAGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101173 ACCAAGTGGACCCTGCTGCAGGAGCAGGGCACCAAGACTGTGAGGCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCTGGAGCCGTTGTTCGAGCAGTACATCAACAACCTCAGGAGGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101223 CCTGGAGCCGTTGTTCGAGCAGTACATCAACAACCTCAGGAGGCAGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACAGCATCGTGGGGGAACGGGGCCGCCTGGACTCAGAGCTGAGAAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101273 ACAGCATCGTGGGGGAACGGGGCCGCCTGGACTCAGAGCTGAGAAACATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGGACCTGGTGGAAGACTTCAAGAACAA         GTATGAGGATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101323 CAGGACCTGGTGGAAGACTTCAAGAACAAGTG...CAGGTATGAGGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AATCAACAAGCGTACCACTGCTGAGAATGAGTTTGTGATGCTGAAGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102146 AATCAACAAGCGTACCACTGCTGAGAATGAGTTTGTGATGCTGAAGAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832         GATGTAGATGCTGCCTACATGAACAAGGTGGAGCTGGAGGCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102196 TG...CAGGATGTAGATGCTGCCTACATGAACAAGGTGGAGCTGGAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAGGTTGATGCACTGATGGATGAGATTAACTTCATGAAGATGTTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102347 AAGGTTGATGCACTGATGGATGAGATTAACTTCATGAAGATGTTCTTTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGCG         GAGCTGTCCCAGATGCAGACGCATGTCTCTGACACCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102397 TGCGGTA...CAGGAGCTGTCCCAGATGCAGACGCATGTCTCTGACACCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CAGTGGTCCTCTCCATGGACAACAACCGCAACCTGGACCTGGATAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102580 CAGTGGTCCTCTCCATGGACAACAACCGCAACCTGGACCTGGATAGCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ATCGCTGAGGTCAAGGCCCAGTATGAGGAGATTGCCAACCGCAGCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102630 ATCGCTGAGGTCAAGGCCCAGTATGAGGAGATTGCCAACCGCAGCCGGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGAAGCCGAGTCCTGGTATCAGACCAAG         TATGAGGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102680 AGAAGCCGAGTCCTGGTATCAGACCAAGGTG...CAGTATGAGGAGCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGCAGACAGCTGGCCGGCATGGCGATGACCTCCGCAACACCAAGCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103078 AGCAGACAGCTGGCCGGCATGGCGATGACCTCCGCAACACCAAGCATGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 ATCTCTGAGATGAACCGGATGATCCAGAGGCTGAGAGCCGAGATTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103128 ATCTCTGAGATGAACCGGATGATCCAGAGGCTGAGAGCCGAGATTGACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TGTCAAGAAACAG         TGCGCCAATCTGCAGAACGCCATTGCGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103178 TGTCAAGAAACAGGTA...TAGTGCGCCAATCTGCAGAACGCCATTGCGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ATGCCGAGCAGCGTGGGGAGCTGGCCCTCAAGGATGCCAGGAACAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103468 ATGCCGAGCAGCGTGGGGAGCTGGCCCTCAAGGATGCCAGGAACAAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GCCGAGCTGGAGGAGGCCCTGCAGAAGGCCAAGCAGGACATGGCCCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103518 GCCGAGCTGGAGGAGGCCCTGCAGAAGGCCAAGCAGGACATGGCCCGGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GCTGCGTGAGTACCAGGAGCTCATGAACACCAAGCTGGCCCTGGACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103568 GCTGCGTGAGTACCAGGAGCTCATGAACACCAAGCTGGCCCTGGACGTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 AGATCGCCACTTACCGCAAGCTGCTGGAGGGCGAGGAATGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103618 AGATCGCCACTTACCGCAAGCTGCTGGAGGGCGAGGAATGCAGGTG...C

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1440   ACTCAGTGGAGAAGGAGTTGGACCAGTCAACATCT         CTGT
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 104463 AGACTCAGTGGAGAAGGAGTTGGACCAGTCAACATCTGTA...CAGCTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TGTCACAAGCAGTGTTTCCTCTGGATATGGCAGTGGCAGTGGCTATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105061 TGTCACAAGCAGTGTTTCCTCTGGATATGGCAGTGGCAGTGGCTATGGCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GTGGCCTCGGTGGAGGTCTTGGCGGCGGCCTCGGTGGAGGTCTTGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105111 GTGGCCTCGGTGGAGGTCTTGGCGGCGGCCTCGGTGGAGGTCTTGCCGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GGTAGCAGTGGAAGCTACTACTCCAGCAGCAGTGGGGGTGTCGGCCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105161 GGTAGCAGTGGAAGCTACTACTCCAGCAGCAGTGGGGGTGTCGGCCTAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 TGGTGGGCTCAGTGTGGGGGGCTCTGGCTTCAGTGCAAGCAGTGGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105211 TGGTGGGCTCAGTGTGGGGGGCTCTGGCTTCAGTGCAAGCAGTGGCCGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 GGCTGGGGGTGGGCTTTGGCAGTGGCGGGGGTAGCAGCTCCAGCGTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105261 GGCTGGGGGTGGGCTTTGGCAGTGGCGGGGGTAGCAGCTCCAGCGTCAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TTTGTCTCCACCACCTCCTCCTCCCGGAAGAGCTTCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105311 TTTGTCTCCACCACCTCCTCCTCCCGGAAGAGCTTCAAGAGC