seq1 = pF1KB6132.tfa, 1884 bp
seq2 = pF1KB6132/gi568815579f_44709125.tfa (gi568815579f:44709125_44920822), 211698 bp

>pF1KB6132 1884
>gi568815579f:44709125_44920822 (Chr19)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-204  (102101-102222)   100% ->
205-433  (103039-103267)   100% ->
434-504  (103354-103424)   100% ->
505-601  (104126-104222)   100% ->
602-784  (104314-104496)   100% ->
785-921  (105028-105164)   100% ->
922-1078  (105480-105636)   100% ->
1079-1194  (109398-109513)   100% ->
1195-1336  (109617-109758)   100% ->
1337-1473  (109932-110068)   100% ->
1474-1618  (110222-110366)   100% ->
1619-1763  (110458-110602)   100% ->
1764-1884  (111581-111699)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCCCCGGACGCACCGGCCCAGGCGCGCGGGGCCCCGCGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCCCCGGACGCACCGGCCCAGGCGCGCGGGGCCCCGCGGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGCTCGCAGTCCTGCTGGCGGCGCACCCAG         ATGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 GTTGCTCGCAGTCCTGCTGGCGGCGCACCCAGGTA...CAGATGCCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGAGGTGCGCTTGTCTGTACCCCCGCTGGTGGAGGTGATGCGAGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102110 CGGAGGTGCGCTTGTCTGTACCCCCGCTGGTGGAGGTGATGCGAGGAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTGTCATTCTGGACTGCACCCCTACGGGAACCCACGACCATTATATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102160 TCTGTCATTCTGGACTGCACCCCTACGGGAACCCACGACCATTATATGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAATGGTTCCTT         ACCGACCGCTCGGGAGCTCGCCCCCGCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102210 GGAATGGTTCCTTGTG...CAGACCGACCGCTCGGGAGCTCGCCCCCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAGCCTCGGCTGAGATGCAGGGCTCTGAGCTCCAGGTCACAATGCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103067 TAGCCTCGGCTGAGATGCAGGGCTCTGAGCTCCAGGTCACAATGCACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCCGGGGCCGCAGTCCCCCATACCAGCTGGACTCCCAGGGGCGCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103117 ACCCGGGGCCGCAGTCCCCCATACCAGCTGGACTCCCAGGGGCGCCTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTGGCTGAGGCCCAGGTGGGCGACGAGCGAGACTACGTGTGCGTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103167 GCTGGCTGAGGCCCAGGTGGGCGACGAGCGAGACTACGTGTGCGTGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGCAGGGGCGGCAGGCACTGCTGAGGCCACTGCGCGGCTCAACGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103217 GGGCAGGGGCGGCAGGCACTGCTGAGGCCACTGCGCGGCTCAACGTGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 G         CAAAGCCAGAGGCCACTGAGGTCTCCCCCAACAAAGGGAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103267 GGTA...CAGCAAAGCCAGAGGCCACTGAGGTCTCCCCCAACAAAGGGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACTGTCTGTGATGGAGGACTCTGCCCAGGAG         ATCGCCACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103394 ACTGTCTGTGATGGAGGACTCTGCCCAGGAGGTA...CAGATCGCCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCAACAGCCGGAACGGGAACCCGGCCCCCAAGATCACGTGGTATCGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104136 GCAACAGCCGGAACGGGAACCCGGCCCCCAAGATCACGTGGTATCGCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGGCAGCGCCTGGAGGTGCCCGTAGAGATGAACCCAG         AGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 104186 GGGCAGCGCCTGGAGGTGCCCGTAGAGATGAACCCAGGTG...CAGAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTACATGACCAGCCGCACGGTCCGGGAGGCCTCGGGCCTGCTCTCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104318 CTACATGACCAGCCGCACGGTCCGGGAGGCCTCGGGCCTGCTCTCCCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCAGCACCCTCTACCTGCGGCTCCGCAAGGATGACCGAGACGCCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104368 CCAGCACCCTCTACCTGCGGCTCCGCAAGGATGACCGAGACGCCAGCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CACTGCGCCGCCCACTACAGCCTGCCCGAGGGCCGCCACGGCCGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104418 CACTGCGCCGCCCACTACAGCCTGCCCGAGGGCCGCCACGGCCGCCTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAGCCCCACCTTCCACCTCACCCTGCACT         ATCCCACGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104468 CAGCCCCACCTTCCACCTCACCCTGCACTGTG...TAGATCCCACGGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACGTGCAGTTCTGGGTGGGCAGCCCGTCCACCCCAGCAGGCTGGGTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105040 ACGTGCAGTTCTGGGTGGGCAGCCCGTCCACCCCAGCAGGCTGGGTACGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGGGTGACACTGTCCAGCTGCTCTGCCGGGGGGACGGCAGCCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105090 GAGGGTGACACTGTCCAGCTGCTCTGCCGGGGGGACGGCAGCCCCAGCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGAGTATACGCTTTTCCGCCTTCAG         GATGAGCAGGAGGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105140 GGAGTATACGCTTTTCCGCCTTCAGGTG...CAGGATGAGCAGGAGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGCTGAATGTGAATCTCGAGGGGAACTTGACCCTGGAGGGAGTGACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105496 TGCTGAATGTGAATCTCGAGGGGAACTTGACCCTGGAGGGAGTGACCCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGCCAGAGCGGGACCTATGGCTGCAGAGTGGAGGATTACGACGCGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105546 GGCCAGAGCGGGACCTATGGCTGCAGAGTGGAGGATTACGACGCGGCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGACGTGCAGCTCTCCAAGACGCTGGAGCTGCGCGTGGCCT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105596 TGACGTGCAGCTCTCCAAGACGCTGGAGCTGCGCGTGGCCTGTG...CAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ATCTGGACCCCCTGGAGCTCAGCGAGGGGAAGGTGCTTTCCTTACCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109398 ATCTGGACCCCCTGGAGCTCAGCGAGGGGAAGGTGCTTTCCTTACCTCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AACAGCAGTGCAGTCGTGAACTGCTCCGTGCACGGCCTGCCCACCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109448 AACAGCAGTGCAGTCGTGAACTGCTCCGTGCACGGCCTGCCCACCCCTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCTACGCTGGACCAAG         GACTCCACTCCCCTGGGCGATGGCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 109498 CCTACGCTGGACCAAGGTG...CAGGACTCCACTCCCCTGGGCGATGGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCATGCTGTCGCTCAGTTCTATCACCTTCGATTCCAATGGCACCTACGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109642 CCATGCTGTCGCTCAGTTCTATCACCTTCGATTCCAATGGCACCTACGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TGTGAGGCCTCCCTGCCCACAGTCCCGGTCCTCAGCCGCACCCAGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109692 TGTGAGGCCTCCCTGCCCACAGTCCCGGTCCTCAGCCGCACCCAGAACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CACGCTGCTGGTCCAAG         GCTCGCCAGAGCTAAAGACAGCGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109742 CACGCTGCTGGTCCAAGGTT...CAGGCTCGCCAGAGCTAAAGACAGCGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AAATAGAGCCCAAGGCAGATGGCAGCTGGAGGGAAGGAGACGAAGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109956 AAATAGAGCCCAAGGCAGATGGCAGCTGGAGGGAAGGAGACGAAGTCACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CTCATCTGCTCTGCCCGCGGCCATCCAGACCCCAAACTCAGCTGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110006 CTCATCTGCTCTGCCCGCGGCCATCCAGACCCCAAACTCAGCTGGAGCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 ATTGGGGGGCAGC         CCCGCAGAGCCAATCCCCGGACGGCAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 110056 ATTGGGGGGCAGCGTA...TAGCCCGCAGAGCCAATCCCCGGACGGCAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GTTGGGTGAGCAGCTCTCTGACCCTGAAAGTGACCAGCGCCCTGAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110250 GTTGGGTGAGCAGCTCTCTGACCCTGAAAGTGACCAGCGCCCTGAGCCGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GATGGCATCTCCTGTGAAGCCTCCAACCCCCACGGGAACAAGCGCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110300 GATGGCATCTCCTGTGAAGCCTCCAACCCCCACGGGAACAAGCGCCATGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CTTCCACTTCGGCACCG         TGAGCCCCCAGACCTCCCAGGCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 110350 CTTCCACTTCGGCACCGGTG...CAGTGAGCCCCCAGACCTCCCAGGCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GAGTGGCCGTCATGGCCGTGGCCGTCAGCGTGGGCCTCCTGCTCCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110482 GAGTGGCCGTCATGGCCGTGGCCGTCAGCGTGGGCCTCCTGCTCCTCGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GTTGCTGTCTTCTACTGCGTGAGACGCAAAGGGGGCCCCTGCTGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110532 GTTGCTGTCTTCTACTGCGTGAGACGCAAAGGGGGCCCCTGCTGCCGCCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GCGGCGGGAGAAGGGGGCTCC         GCCGCCAGGGGAGCCAGGGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 110582 GCGGCGGGAGAAGGGGGCTCCGTG...CAGGCCGCCAGGGGAGCCAGGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TGAGCCACTCGGGGTCGGAGCAACCAGAGCAGACCGGCCTTCTCATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111601 TGAGCCACTCGGGGTCGGAGCAACCAGAGCAGACCGGCCTTCTCATGGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GGTGCCTCCGGAGGAGCCAGGGGTGGCAGCGGGGGCTTCGGAGACGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|
 111651 GGTGCCTCCGGAGGAGCCAGGGGTGGCAGCGGGGGCTTCGGAGACGAG G

   2000 
   1884 C
        -
 111700