seq1 = pF1KB6108.tfa, 1851 bp
seq2 = pF1KB6108/gi568815586r_1846209.tfa (gi568815586r:1846209_2104431), 258223 bp

>pF1KB6108 1851
>gi568815586r:1846209_2104431 (Chr12)

(complement)

1-150  (100001-100150)   100% ->
151-191  (106457-106497)   100% ->
192-319  (111041-111168)   100% ->
320-386  (136522-136588)   100% ->
387-522  (138739-138874)   100% ->
523-651  (148872-149000)   100% ->
652-1524  (151144-152016)   100% ->
1525-1773  (155098-155346)   100% ->
1774-1851  (158146-158223)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCGTGGCGGCAGGCGGCCTGGTGGGAAAGGGGCGCGACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCGTGGCGGCAGGCGGCCTGGTGGGAAAGGGGCGCGACATCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTAGCGGCCCTGCAGCGCCACGACCCCTATATCAACCGCATCGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTAGCGGCCCTGCAGCGCCACGACCCCTATATCAACCGCATCGTGGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCAGCCAGGTGGCTCTGTACACCTTCGGCCATCGGGCCAACGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCCAGCCAGGTGGCTCTGTACACCTTCGGCCATCGGGCCAACGAGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151          GAGAAAACTGATGTGGAAGGAACCTTATTTGTTTATACAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTG...TAGGAGAAAACTGATGTGGAAGGAACCTTATTTGTTTATACAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192          GTCTGCTTCTCCAAAGCATGGATTCACCATTATGAATAGGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106498 GTA...TAGGTCTGCTTCTCCAAAGCATGGATTCACCATTATGAATAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGAGCATGGAAAATAGGACAGAACCTATTACTAAAGACTTGGATTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111082 TGAGCATGGAAAATAGGACAGAACCTATTACTAAAGACTTGGATTTCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCCAGGACCCTTTCCTTCTCTACAGAAATGCCAGAT         TGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111132 CTCCAGGACCCTTTCCTTCTCTACAGAAATGCCAGATGTG...CAGTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATCTATGGAATTTGGTTTTATGATAAGGAAGAATGCCAAAGAATTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136526 CATCTATGGAATTTGGTTTTATGATAAGGAAGAATGCCAAAGAATTGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCTTATGAAAAA         CCTAACTCAGTATGAACAGTTGAAAGCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 136576 AGCTTATGAAAAAGTA...TAGCCTAACTCAGTATGAACAGTTGAAAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CATCAGGGAACTGGAGCAGGAATTTCCCCAGTGATCCTCAATTCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138767 CATCAGGGAACTGGAGCAGGAATTTCCCCAGTGATCCTCAATTCAGGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGCAAAGAAGTAGACATTTTACGAATGCTCATCAAGGCCAAAGACGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138817 GGGCAAAGAAGTAGACATTTTACGAATGCTCATCAAGGCCAAAGACGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACACAAAG         TGTAAAACCTGTTCTGAGCCAAAAAAGATAACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 138867 ACACAAAGGTG...CAGTGTAAAACCTGTTCTGAGCCAAAAAAGATAACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGTTCCTCTGCCATCTATGACAATCCAAATCTCATCAAACCAATTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148905 AGTTCCTCTGCCATCTATGACAATCCAAATCTCATCAAACCAATTCCAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAAACCCAGTGAAAACCAGCAACAGCGTATACCTCAGCCCAACCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 148955 GAAACCCAGTGAAAACCAGCAACAGCGTATACCTCAGCCCAACCAGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    652      ACCTTAGACCCTGAACCCCAACACTTATCCTTGACAGCTCTGTTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149005 ..CAGACCTTAGACCCTGAACCCCAACACTTATCCTTGACAGCTCTGTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGGAAGCAGGACAAAGCTACATGTCAGGAAACTGTGGAGCCTCCGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151189 GGGAAGCAGGACAAAGCTACATGTCAGGAAACTGTGGAGCCTCCGCAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCTCCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAGAGAAGCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151239 TCTCCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAGAGAAGCTTCCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTAGGCAGGGGGTTGTACGCTCCCTGTCCTATGAGGAACCCAGAAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151289 TTAGGCAGGGGGTTGTACGCTCCCTGTCCTATGAGGAACCCAGAAGACAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCACCCCCCATTGAGAAGCAGCTCTGTCCAGCCATTCAGAAACTCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151339 TCACCCCCCATTGAGAAGCAGCTCTGTCCAGCCATTCAGAAACTCATGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAGGAGCGCAGACCTCCACCCATTGTCAGAGCTGCCTGAAAACCGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151389 CAGGAGCGCAGACCTCCACCCATTGTCAGAGCTGCCTGAAAACCGGCCTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GTGAAAATGGCAGTACCCATTCTGCGGGAGAATTTTTTACAGGACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151439 GTGAAAATGGCAGTACCCATTCTGCGGGAGAATTTTTTACAGGACCTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAGCCAGGGTCTCCTCACAACATTGGAACTTCTCGTGGTGTACAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151489 CAGCCAGGGTCTCCTCACAACATTGGAACTTCTCGTGGTGTACAAAATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TTCCAGAACTCAGAACCTGTTCGAGAAACTTCAGAGTACCCCAGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151539 TTCCAGAACTCAGAACCTGTTCGAGAAACTTCAGAGTACCCCAGGGGCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CAAACAAGTGTGACCCTAGTACACCAGCACCTGCCAGCTCAGCTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151589 CAAACAAGTGTGACCCTAGTACACCAGCACCTGCCAGCTCAGCTGCCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AACCGCAGCAGAGCTCCCACTTCTGTCACCCCTGTGGCTCCAGGAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151639 AACCGCAGCAGAGCTCCCACTTCTGTCACCCCTGTGGCTCCAGGAAAGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCTGGCTCAGCCACCACAGGCCTATTTCAATGGCTCCCTTCCACCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151689 TCTGGCTCAGCCACCACAGGCCTATTTCAATGGCTCCCTTCCACCTCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CAGTAGGACATCAGGCTCATGGAAGAGAACAGTCCACACTCCCAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151739 CAGTAGGACATCAGGCTCATGGAAGAGAACAGTCCACACTCCCAAGACAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ACACTCCCCATCTCTGGTAGTCAGACTGGCAGCTCTGGAGTGATCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151789 ACACTCCCCATCTCTGGTAGTCAGACTGGCAGCTCTGGAGTGATCTCCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 TCAAGAGTTACTGAAGAAGCTTCAGATTGTACAGCAGGAGCAGCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151839 TCAAGAGTTACTGAAGAAGCTTCAGATTGTACAGCAGGAGCAGCAGCTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 ATGCCTCTAACCGGCCAGCCTTGGCCGCTAAGTTTCCTGTGCTCGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151889 ATGCCTCTAACCGGCCAGCCTTGGCCGCTAAGTTTCCTGTGCTCGCTCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 AGCTCTGGAACAGGGAAACCCTTGGAATCCTGGATCAACAAGACACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151939 AGCTCTGGAACAGGGAAACCCTTGGAATCCTGGATCAACAAGACACCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CACAGAACAGCAGACTCCTCTTTTCCAG         GTCATCTCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 151989 CACAGAACAGCAGACTCCTCTTTTCCAGGTA...CAGGTCATCTCACCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 AGCGCATCCCTGCTACAGCAGCTCCGTCTCTGCTTATGTCCCCCATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155111 AGCGCATCCCTGCTACAGCAGCTCCGTCTCTGCTTATGTCCCCCATGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 TTCGCACAACCCACCTCCGTCCCGCCAAAGGAAAGGGAGAGCGGCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155161 TTCGCACAACCCACCTCCGTCCCGCCAAAGGAAAGGGAGAGCGGCCTCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 GCCTGTGGGAGGCCAGGAGCCACCTGCTGCTGCCACCAGCCTCCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155211 GCCTGTGGGAGGCCAGGAGCCACCTGCTGCTGCCACCAGCCTCCTCCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CCATACAGAGCCCGGAGCCCTCCGTGATCACCAGCAGCCCACTCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155261 CCATACAGAGCCCGGAGCCCTCCGTGATCACCAGCAGCCCACTCACCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CTCCAGCTCCAGGAGGCACTGCTGTACCTCATTCAG         AATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 155311 CTCCAGCTCCAGGAGGCACTGCTGTACCTCATTCAGGTA...CAGAATGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 TGACAACTTCTTAAATATAATCTATGAAGCCTATCTCTTCAGCATGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158151 TGACAACTTCTTAAATATAATCTATGAAGCCTATCTCTTCAGCATGACTC

   1900     .    :    .    :
   1829 AAGCAGCCATGAAAAAGACTATG
        |||||||||||||||||||||||
 158201 AAGCAGCCATGAAAAAGACTATG