seq1 = pF1KB6007.tfa, 2502 bp
seq2 = pF1KB6007/gi568815585r_113879350.tfa (gi568815585r:113879350_114142980), 263631 bp

>pF1KB6007 2502
>gi568815585r:113879350_114142980 (Chr13)

(complement)

1-55  (10492-10546)   100% ->
56-173  (69144-69261)   100% ->
174-277  (90826-90929)   100% ->
278-372  (101887-101981)   100% ->
373-449  (113094-113170)   100% ->
450-530  (115054-115134)   100% ->
531-603  (115520-115592)   100% ->
604-680  (118626-118702)   100% ->
681-785  (121473-121577)   100% ->
786-942  (124062-124218)   100% ->
943-1091  (124729-124877)   100% ->
1092-1206  (125630-125744)   100% ->
1207-1281  (126710-126784)   100% ->
1282-1405  (127649-127772)   99% ->
1406-1512  (129733-129839)   100% ->
1513-1590  (131733-131810)   100% ->
1591-1668  (133517-133594)   100% ->
1669-1742  (135375-135448)   100% ->
1743-1849  (142049-142155)   100% ->
1850-1932  (143314-143396)   100% ->
1933-2141  (146242-146450)   100% ->
2142-2245  (150393-150496)   100% ->
2246-2429  (161123-161306)   100% ->
2430-2502  (163559-163631)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTGGAGGACGAGGGGCTCCGGGTCTTCCAGAGCGTGAAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10492 ATGGCGGTGGAGGACGAGGGGCTCCGGGTCTTCCAGAGCGTGAAGATCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATCG         GTGAAGCCAAAAACCTTCCCTCTTACCCGGGGCCGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10542 GATCGGTG...TAGGTGAAGCCAAAAACCTTCCCTCTTACCCGGGGCCGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAAGATGAGGGATTGCTACTGCACGGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69180 GCAAGATGAGGGATTGCTACTGCACGGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCAGGACCAAAATTGTGGAAAAGTCACTCTG         CCCGTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  69230 TTCAGGACCAAAATTGTGGAAAAGTCACTCTGGTA...TAGCCCGTTTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGGAGAAGACTTTTACTGTGAAATTCCTCGGAGCTTTCGTCACCTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  90835 CGGAGAAGACTTTTACTGTGAAATTCCTCGGAGCTTTCGTCACCTGTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTACATTTTCGATAGAGACGTTTTCCGGAGGGATTCCATCATAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
  90885 TCTACATTTTCGATAGAGACGTTTTCCGGAGGGATTCCATCATAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    278     GGAAGGTGGCCATCCAGAAGGAGGACTTGCAGAAGTACCACAACAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  90935 .CAGGGAAGGTGGCCATCCAGAAGGAGGACTTGCAGAAGTACCACAACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGACACCTGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCTGACTCGGAAGTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101933 GGACACCTGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCTGACTCGGAAGTGCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    373         GGCAAAGTGCACCTGGAGCTGCGGCTGAGCGAGGTCATCACA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101983 TG...CAGGGCAAAGTGCACCTGGAGCTGCGGCTGAGCGAGGTCATCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GACACTGGGGTCGTCTGCCACAAGCTCGCCACACG         CATCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 113136 GACACTGGGGTCGTCTGCCACAAGCTCGCCACACGGTA...CAGCATCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CGAGTGCCAGGGCCTCCCCATCGTGAATGGGCAATGTGACCCCTACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115060 CGAGTGCCAGGGCCTCCCCATCGTGAATGGGCAATGTGACCCCTACGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCGTGACGCTGGCAGGACCCTTCAG         ATCAGAAGCAAAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 115110 CCGTGACGCTGGCAGGACCCTTCAGGCA...CAGATCAGAAGCAAAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ACGAAAGTGAAGAGGAAGACCAACAATCCCCAGTTCGATGAAGTGTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115536 ACGAAAGTGAAGAGGAAGACCAACAATCCCCAGTTCGATGAAGTGTTTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TTTTGAG         GTGACCCGGCCCTGTAGCTACAGCAAGAAGTCCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115586 TTTTGAGGTT...CAGGTGACCCGGCCCTGTAGCTACAGCAAGAAGTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ACTTTGACTTTGAGGAGGAAGACGTGGACAAGCTCGAAATCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 118660 ACTTTGACTTTGAGGAGGAAGACGTGGACAAGCTCGAAATCAGGTG...C

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    681   AGTTGACCTCTGGAATGCCAGTAACCTGAAGTTTGGAGATGAATTCCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121471 AGAGTTGACCTCTGGAATGCCAGTAACCTGAAGTTTGGAGATGAATTCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GGGAGAACTAAGGATCCCGTTGAAAGTCCTGCGGCAGTCCAGCTCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121521 GGGAGAACTAAGGATCCCGTTGAAAGTCCTGCGGCAGTCCAGCTCCTACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AGGCGTG         GTACTTCCTCCAGCCCCGGGACAATGGTAGCAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121571 AGGCGTGGTA...CAGGTACTTCCTCCAGCCCCGGGACAATGGTAGCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 AGCCTAAAGCCAGACGACCTGGGCTCCCTGCGGCTGAACGTGGTATACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124096 AGCCTAAAGCCAGACGACCTGGGCTCCCTGCGGCTGAACGTGGTATACAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGAAGACCACGTGTTTTCTTCTGACTATTACAGCCCTCTGCGGGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124146 GGAAGACCACGTGTTTTCTTCTGACTATTACAGCCCTCTGCGGGACCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGTTGAAGTCTGCGGATGTGGAG         CCCGTGTCAGCGTCTGCG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 124196 TGTTGAAGTCTGCGGATGTGGAGGTG...CAGCCCGTGTCAGCGTCTGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GCCCACATCCTGGGCGAGGTTTGCCGGGAGAAGCAGGAGGCGGCCGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124747 GCCCACATCCTGGGCGAGGTTTGCCGGGAGAAGCAGGAGGCGGCCGTCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GCTGGTGCGGCTCTTCCTACACTATGGCAGGGTGGTGCCATTCATCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124797 GCTGGTGCGGCTCTTCCTACACTATGGCAGGGTGGTGCCATTCATCAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 CCATCGCCAGCGCGGAGGTGAAGCGGACCCA         GGACCCCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 124847 CCATCGCCAGCGCGGAGGTGAAGCGGACCCAGTG...CAGGGACCCCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 ACCATCTTCCGAGGAAACTCACTGGCGTCCAAGTGCATCGACGAGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125640 ACCATCTTCCGAGGAAACTCACTGGCGTCCAAGTGCATCGACGAGACCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GAAGCTGGCGGGGATGCATTACCTGCATGTCACCCTGAAGCCCGCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125690 GAAGCTGGCGGGGATGCATTACCTGCATGTCACCCTGAAGCCCGCCATCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AGGAG         ATATGCCAGAGCCACAAACCCTGTGAAATCGACCCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125740 AGGAGGTG...CAGATATGCCAGAGCCACAAACCCTGTGAAATCGACCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GTGAAGTTGAAAGACGGAGAAAACCTTGAAAACAACATG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 126746 GTGAAGTTGAAAGACGGAGAAAACCTTGAAAACAACATGGTA...CAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 GAACCTACGGCAGTATGTGGACCGCGTCTTCCACGCCATCACCGAGTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 127651 GAACCTACGGCAGTATGTGGACCGCGTCTTCCACGCCATCACTGAGTCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 GGGTGAGCTGCCCGACCGTCATGTGTGACATCTTCTTCTCCCTCCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127701 GGGTGAGCTGCCCGACCGTCATGTGTGACATCTTCTTCTCCCTCCGGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GCGGCGGCCAAGCGCTTCCAGG         ATGACCCGGACGTCAGGTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 127751 GCGGCGGCCAAGCGCTTCCAGGGTG...CAGATGACCCGGACGTCAGGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 CACTGCAGTGAGCAGCTTCATCTTCCTGAGGTTCTTTGCGCCCGCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129752 CACTGCAGTGAGCAGCTTCATCTTCCTGAGGTTCTTTGCGCCCGCCATTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 TCTCCCCCAACCTCTTCCAGCTCACGCCGCACCACACG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 129802 TCTCCCCCAACCTCTTCCAGCTCACGCCGCACCACACGGTG...CAGGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CCCCAGACGTCCAGGACGCTGACATTGATCTCCAAGACCGTTCAGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131736 CCCCAGACGTCCAGGACGCTGACATTGATCTCCAAGACCGTTCAGACCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 CGGCAGCCTGTCCAAGTCCAAATCT         GCGAGTTTTAAGGAGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 131786 CGGCAGCCTGTCCAAGTCCAAATCTGTG...TAGGCGAGTTTTAAGGAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 CCTACATGGCTACATTTTATGAATTCTTCAATGAGCAGAAATATGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133533 CCTACATGGCTACATTTTATGAATTCTTCAATGAGCAGAAATATGCTGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCGGTGAAGAAC         TTCTTGGATCTGATTTCGTCCTCGGGGAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 133583 GCGGTGAAGAACGTA...TAGTTCTTGGATCTGATTTCGTCCTCGGGGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 AAGAGACCCCAAGAGTGTTGAGCAGCCCATCGTGCTTAAAGAAGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 135404 AAGAGACCCCAAGAGTGTTGAGCAGCCCATCGTGCTTAAAGAAGGGTA..

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743     GTTCATGATCAAGAGGGCCCAAGGACGGAAGCGCTTTGGGATGAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135454 .CAGGTTCATGATCAAGAGGGCCCAAGGACGGAAGCGCTTTGGGATGAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 AATTTTAAGAAGAGATGGTTTCGCTTGACCAACCATGAATTTACCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142095 AATTTTAAGAAGAGATGGTTTCGCTTGACCAACCATGAATTTACCTACCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 CAAAAGCAAAG         GGGACCAGCCTCTCTACAGCATTCCCATCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 142145 CAAAAGCAAAGGTA...CAGGGGACCAGCCTCTCTACAGCATTCCCATCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 AGAACATCCTGGCAGTGGAGAAGCTGGAGGAGGAGTCTTTCAAAATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143344 AGAACATCCTGGCAGTGGAGAAGCTGGAGGAGGAGTCTTTCAAAATGAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 AAC         ATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCGCTGTACAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143394 AACGTG...CAGATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCGCTGTACAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1971 CCAGGCCAACAACTGCGTGGAGGCCAAGGACTGGATCGACATTCTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146280 CCAGGCCAACAACTGCGTGGAGGCCAAGGACTGGATCGACATTCTCACCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 AAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGCCTCACCGTCTACCACCCGTCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146330 AAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGCCTCACCGTCTACCACCCGTCCGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 TACCTGAGCGGCCACTGGCTGTGCTGTAGGGCGCCATCCGACTCGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146380 TACCTGAGCGGCCACTGGCTGTGCTGTAGGGCGCCATCCGACTCGGCTCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 GGGCTGCTCGCCCTGCACTGG         CGGCCTCCCAGCCAACATCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 146430 GGGCTGCTCGCCCTGCACTGGGTA...CAGCGGCCTCCCAGCCAACATCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2162 AGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAGACGGAGCGTATCTACTCCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150413 AGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAGACGGAGCGTATCTACTCCCTCTTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 AACTTGTACATGAGCAAGCTGGAGAAGATGCAGG         AGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 150463 AACTTGTACATGAGCAAGCTGGAGAAGATGCAGGGTG...CAGAGGCCTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2253 TGGGAGCAAATCTGTGTATGACGGCCCGGAGCAGGAGGAGTATTCGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161130 TGGGAGCAAATCTGTGTATGACGGCCCGGAGCAGGAGGAGTATTCGACGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2303 TCGTCATTGACGACCCCCAGGAGACCTACAAGACGCTAAAGCAAGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161180 TCGTCATTGACGACCCCCAGGAGACCTACAAGACGCTAAAGCAAGTCATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 GCTGGGGTTGGGGCTTTGGAGCAGGAGCACGCCCAGTATAAGAGGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161230 GCTGGGGTTGGGGCTTTGGAGCAGGAGCACGCCCAGTATAAGAGGGACAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 GTTCAAGAAGACGAAATATGGAAGCCA         GGAGCACCCCATCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 161280 GTTCAAGAAGACGAAATATGGAAGCCAGTG...CAGGGAGCACCCCATCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2444 GAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCCGAGACCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163573 GAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCCGAGACCTCCACT

   2700     .
   2494 CATTCCATT
        |||||||||
 163623 CATTCCATT