seq1 = pF1KB5972.tfa, 1683 bp
seq2 = pF1KB5972/gi568815588f_38014751.tfa (gi568815588f:38014751_38218834), 204084 bp

>pF1KB5972 1683
>gi568815588f:38014751_38218834 (Chr10)

12-142  (100001-100131)   100% ->
143-238  (100445-100540)   100% ->
239-1683  (102640-104084)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     12 CCAGGGATCAGTGTCGTTTAGGGATGTGACTGTGGGCTTCACTCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CCAGGGATCAGTGTCGTTTAGGGATGTGACTGTGGGCTTCACTCAAGAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     62 AGTGGCAGCATCTGGACCCTGCTCAGAGGACCCTGTACAGGGATGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGGCAGCATCTGGACCCTGCTCAGAGGACCCTGTACAGGGATGTGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    112 CTGGAGAACTACAGCCACCTTGTCTCAGTAG         GGTATTGCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 CTGGAGAACTACAGCCACCTTGTCTCAGTAGGTA...CAGGGTATTGCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    153 TCCTAAACCAGAAGTGATTCTCAAGTTGGAGAAAGGCGAGGAGCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100455 TCCTAAACCAGAAGTGATTCTCAAGTTGGAGAAAGGCGAGGAGCCATGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    203 TATTAGAGGAAAAATTTCCAAGCCAGAGTCATCTGG         AATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100505 TATTAGAGGAAAAATTTCCAAGCCAGAGTCATCTGGGTG...CAGAATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244 ATTAATACCAGTAGAAACTATTCAATAATGAAGTTCAATGAGTTTAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102645 ATTAATACCAGTAGAAACTATTCAATAATGAAGTTCAATGAGTTTAACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    294 AGGTGGAAAATGTTTCTGTGATGAAAAGCATGAAATAATTCATTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102695 AGGTGGAAAATGTTTCTGTGATGAAAAGCATGAAATAATTCATTCTGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    344 AGGAACCTTCTGAATATAATAAAAATGGGAACAGCTTCTGGCTGAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102745 AGGAACCTTCTGAATATAATAAAAATGGGAACAGCTTCTGGCTGAATGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    394 GACCTCATTTGGCATCAGAAAATTAAAAATTGGGAACAATCTTTTGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102795 GACCTCATTTGGCATCAGAAAATTAAAAATTGGGAACAATCTTTTGAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    444 CAATGAATGTGGGAAAGCTTTCCCTGAGAATTCACTCTTCCTTGTACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102845 CAATGAATGTGGGAAAGCTTTCCCTGAGAATTCACTCTTCCTTGTACATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    494 AGAGAGGTTACACAGGACAGAAAACCTGCAAATATACTGAACATGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102895 AGAGAGGTTACACAGGACAGAAAACCTGCAAATATACTGAACATGGGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    544 ACCTGTGATATGTCATTTTTCATCACTCATCAGCAAACACATCCAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102945 ACCTGTGATATGTCATTTTTCATCACTCATCAGCAAACACATCCAAGAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    594 AAACCACTATGGTAATGAATGTGGAGAAAATATCTTTGAGGAATCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102995 AAACCACTATGGTAATGAATGTGGAGAAAATATCTTTGAGGAATCCATTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    644 TCCTTGAACATCAGAGTGTTTACCCATTCAGCCAGAAGTTAAATCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103045 TCCTTGAACATCAGAGTGTTTACCCATTCAGCCAGAAGTTAAATCTCACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694 CCAATTCAGAGAACCCACTCAATTAACAATATTATTGAATATAATGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103095 CCAATTCAGAGAACCCACTCAATTAACAATATTATTGAATATAATGAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    744 TGGAACATTTTTCAGTGAAAAATTAGTCCTTCATTTACAACAGAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103145 TGGAACATTTTTCAGTGAAAAATTAGTCCTTCATTTACAACAGAGAACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    794 ATACAGGAGAAAAACCTTATGAATGTCATGAATGTGGAAAAACCTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103195 ATACAGGAGAAAAACCTTATGAATGTCATGAATGTGGAAAAACCTTCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    844 CAGAAGTCAGCCCACACAAGACATCAGAGAACACACACAGGGGGAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103245 CAGAAGTCAGCCCACACAAGACATCAGAGAACACACACAGGGGGAAAACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    894 CTATGAATGTCATGAATGTGGGAAGACCTTCTATAAGAATTCAGACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103295 CTATGAATGTCATGAATGTGGGAAGACCTTCTATAAGAATTCAGACCTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    944 TTAAACATCAAAGAATTCATACAGGGGAGAGACCTTATGGATGTCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103345 TTAAACATCAAAGAATTCATACAGGGGAGAGACCTTATGGATGTCATGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    994 TGTGGGAAATCCTTCAGTGAAAAGTCAACCCTTACTCAACATCAAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103395 TGTGGGAAATCCTTCAGTGAAAAGTCAACCCTTACTCAACATCAAAGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1044 GCACACAGGGGAGAAACCATATGAATGTCATGAATGTGGGAAAACCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103445 GCACACAGGGGAGAAACCATATGAATGTCATGAATGTGGGAAAACCTTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1094 CATTTAAGTCAGTCCTTACTGTGCATCAGAAAACACACACAGGGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103495 CATTTAAGTCAGTCCTTACTGTGCATCAGAAAACACACACAGGGGAGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1144 CCCTATGAATGCTATGCATGTGGGAAAGCCTTTCTCAGAAAATCAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103545 CCCTATGAATGCTATGCATGTGGGAAAGCCTTTCTCAGAAAATCAGACCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1194 CATTAAACATCAAAGAATACACACAGGTGAAAAACCTTATGAATGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103595 CATTAAACATCAAAGAATACACACAGGTGAAAAACCTTATGAATGTAATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1244 AATGTGGGAAGTCATTCTCTGAGAAGTCAACCCTTACTAAACATCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103645 AATGTGGGAAGTCATTCTCTGAGAAGTCAACCCTTACTAAACATCTAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1294 ACTCACACAGGTGAGAAACCTTATGAATGTATTCAGTGTGGAAAATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103695 ACTCACACAGGTGAGAAACCTTATGAATGTATTCAGTGTGGAAAATTTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1344 CTGCTACTACTCCGGTTTCACAGAACATCTGAGAAGACACACAGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103745 CTGCTACTACTCCGGTTTCACAGAACATCTGAGAAGACACACAGGGGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1394 AACCTTTTGGATGTAATGAATGTGGGAAAACCTTCCGTCAGAAGTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103795 AACCTTTTGGATGTAATGAATGTGGGAAAACCTTCCGTCAGAAGTCAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1444 CTAATTGTTCACCAGAGAACTCATATAAGACAGAAACCCTATGGATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103845 CTAATTGTTCACCAGAGAACTCATATAAGACAGAAACCCTATGGATGTAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1494 TCAATGTGGAAAATCATTCTGTGTGAAGTCAAAACTCATTGCACATCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103895 TCAATGTGGAAAATCATTCTGTGTGAAGTCAAAACTCATTGCACATCATA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1544 GAACACACACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTAATGTTTGTGGAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103945 GAACACACACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTAATGTTTGTGGAAAATCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1594 TTCTATGTTAAGTCAAAACTAACTGTACATCAGAGAATACACTTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103995 TTCTATGTTAAGTCAAAACTAACTGTACATCAGAGAATACACTTGGGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :
   1644 AAACCCTATAAATGTAGTAAACGAGGGAAATTACTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104045 AAACCCTATAAATGTAGTAAACGAGGGAAATTACTCTGGG