seq1 = pF1KB5941.tfa, 1524 bp
seq2 = pF1KB5941/gi568815579r_11277987.tfa (gi568815579r:11277987_11484207), 206221 bp

>pF1KB5941 1524
>gi568815579r:11277987_11484207 (Chr19)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-251  (100976-101111)   100% ->
252-427  (102103-102278)   100% ->
428-585  (102359-102516)   100% ->
586-739  (102999-103152)   100% ->
740-827  (103237-103324)   100% ->
828-915  (105430-105517)   100% ->
916-1524  (105613-106221)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCACCTCGGGGCGTCCCTCTGGCCCCAGGTCGGCTCCCTTTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCACCTCGGGGCGTCCCTCTGGCCCCAGGTCGGCTCCCTTTGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTCGCTGGGGCCGCCTGGGCGCCCCCGCCTAACCTCCCGGACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTCGCTGGGGCCGCCTGGGCGCCCCCGCCTAACCTCCCGGACCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTTCGAGAGCAAAG         CGGCCTTGCTGGCGGCCCGGGGGCCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTTCGAGAGCAAAGGTA...CAGCGGCCTTGCTGGCGGCCCGGGGGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGAGCTTCTGTGCTTCACCGAGCGGTTGGAGGACTTGGTGTGTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101002 GAAGAGCTTCTGTGCTTCACCGAGCGGTTGGAGGACTTGGTGTGTTTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGGAAGCGGCGAGCGCTGGGGTGGGCCCGGGCAACTACAGCTTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101052 GGAGGAAGCGGCGAGCGCTGGGGTGGGCCCGGGCAACTACAGCTTCTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCAGCTCGA         GGATGAGCCATGGAAGCTGTGTCGCCTGCAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101102 ACCAGCTCGAGTG...TAGGGATGAGCCATGGAAGCTGTGTCGCCTGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGGCTCCCACGGCTCGTGGTGCGGTGCGCTTCTGGTGTTCGCTGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102134 CAGGCTCCCACGGCTCGTGGTGCGGTGCGCTTCTGGTGTTCGCTGCCTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCCGACACGTCGAGCTTCGTGCCCCTAGAGTTGCGCGTCACAGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102184 AGCCGACACGTCGAGCTTCGTGCCCCTAGAGTTGCGCGTCACAGCAGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCGGCGCTCCGCGATATCACCGTGTCATCCACATCAATGAAGTAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102234 CCGGCGCTCCGCGATATCACCGTGTCATCCACATCAATGAAGTAGGTA..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    428     TGCTCCTAGACGCCCCCGTGGGGCTGGTGGCGCGGTTGGCTGACGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102284 .CAGTGCTCCTAGACGCCCCCGTGGGGCTGGTGGCGCGGTTGGCTGACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGCGGCCACGTAGTGTTGCGCTGGCTCCCGCCGCCTGAGACACCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102405 GAGCGGCCACGTAGTGTTGCGCTGGCTCCCGCCGCCTGAGACACCCATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGTCTCACATCCGCTACGAGGTGGACGTCTCGGCCGGCAACGGCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102455 CGTCTCACATCCGCTACGAGGTGGACGTCTCGGCCGGCAACGGCGCAGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGCGTACAGAGG         GTGGAGATCCTGGAGGGCCGCACCGAGTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102505 AGCGTACAGAGGGTG...CAGGTGGAGATCCTGGAGGGCCGCACCGAGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGTGCTGAGCAACCTGCGGGGCCGGACGCGCTACACCTTCGCCGTCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103028 TGTGCTGAGCAACCTGCGGGGCCGGACGCGCTACACCTTCGCCGTCCGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGCGTATGGCTGAGCCGAGCTTCGGCGGCTTCTGGAGCGCCTGGTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103078 CGCGTATGGCTGAGCCGAGCTTCGGCGGCTTCTGGAGCGCCTGGTCGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCTGTGTCGCTGCTGACGCCTAGCG         ACCTGGACCCCCTCAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103128 CCTGTGTCGCTGCTGACGCCTAGCGGTG...TAGACCTGGACCCCCTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTGACGCTCTCCCTCATCCTCGTGGTCATCCTGGTGCTGCTGACCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103253 CCTGACGCTCTCCCTCATCCTCGTGGTCATCCTGGTGCTGCTGACCGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCGCGCTGCTCTCCCACCGCCG         GGCTCTGAAGCAGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103303 TCGCGCTGCTCTCCCACCGCCGGTG...CAGGGCTCTGAAGCAGAAGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TGGCCTGGCATCCCGAGCCCAGAGAGCGAGTTTGAAGGCCTCTTCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105449 TGGCCTGGCATCCCGAGCCCAGAGAGCGAGTTTGAAGGCCTCTTCACCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCACAAGGGTAACTTCCAG         CTGTGGCTGTACCAGAATGATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105499 CCACAAGGGTAACTTCCAGGTA...CAGCTGTGGCTGTACCAGAATGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCTGCCTGTGGTGGAGCCCCTGCACCCCCTTCACGGAGGACCCACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105635 GCTGCCTGTGGTGGAGCCCCTGCACCCCCTTCACGGAGGACCCACCTGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCCCTGGAAGTCCTCTCAGAGCGCTGCTGGGGGACGATGCAGGCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105685 TCCCTGGAAGTCCTCTCAGAGCGCTGCTGGGGGACGATGCAGGCAGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCCGGGGACAGATGATGAGGGCCCCCTGCTGGAGCCAGTGGGCAGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105735 GCCGGGGACAGATGATGAGGGCCCCCTGCTGGAGCCAGTGGGCAGTGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGCCCAGGATACCTATCTGGTGCTGGACAAATGGTTGCTGCCCCGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105785 ATGCCCAGGATACCTATCTGGTGCTGGACAAATGGTTGCTGCCCCGGAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCGCCCAGTGAGGACCTCCCAGGGCCTGGTGGCAGTGTGGACATAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105835 CCGCCCAGTGAGGACCTCCCAGGGCCTGGTGGCAGTGTGGACATAGTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CATGGATGAAGGCTCAGAAGCATCCTCCTGCTCATCTGCTTTGGCCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105885 CATGGATGAAGGCTCAGAAGCATCCTCCTGCTCATCTGCTTTGGCCTCGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGCCCAGCCCAGAGGGAGCCTCTGCTGCCAGCTTTGAGTACACTATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105935 AGCCCAGCCCAGAGGGAGCCTCTGCTGCCAGCTTTGAGTACACTATCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GACCCCAGCTCCCAGCTCTTGCGTCCATGGACACTGTGCCCTGAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105985 GACCCCAGCTCCCAGCTCTTGCGTCCATGGACACTGTGCCCTGAGCTGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CCCTACCCCACCCCACCTAAAGTACCTGTACCTTGTGGTATCTGACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106035 CCCTACCCCACCCCACCTAAAGTACCTGTACCTTGTGGTATCTGACTCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GCATCTCAACTGACTACAGCTCAGGGGACTCCCAGGGAGCCCAAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106085 GCATCTCAACTGACTACAGCTCAGGGGACTCCCAGGGAGCCCAAGGGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TTATCCGATGGCCCCTACTCCAACCCTTATGAGAACAGCCTTATCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106135 TTATCCGATGGCCCCTACTCCAACCCTTATGAGAACAGCCTTATCCCAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .
   1488 CGCTGAGCCTCTGCCCCCCAGCTATGTGGCTTGCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106185 CGCTGAGCCTCTGCCCCCCAGCTATGTGGCTTGCTCT