seq1 = pF1KB5918.tfa, 1596 bp
seq2 = pF1KB5918/gi568815579f_10171160.tfa (gi568815579f:10171160_10385284), 214125 bp

>pF1KB5918 1596
>gi568815579f:10171160_10385284 (Chr19)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-331  (103606-103869)   100% ->
332-637  (112322-112627)   100% ->
638-925  (112874-113161)   100% ->
926-1180  (113244-113498)   100% ->
1181-1426  (113624-113869)   100% ->
1427-1596  (113956-114125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCCAGCAGCCCCCGGCCCGCGCTGCCCGCACTCCTGGTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCCCAGCAGCCCCCGGCCCGCGCTGCCCGCACTCCTGGTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGCTCTGTTCCCAG         GACCTGGCAATGCCCAGACATCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGGCTCTGTTCCCAGGTG...TAGGACCTGGCAATGCCCAGACATCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTCCCCCTCAAAAGTCATCCTGCCCCGGGGAGGCTCCGTGCTGGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103630 TGTCCCCCTCAAAAGTCATCCTGCCCCGGGGAGGCTCCGTGCTGGTGACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCAGCACCTCCTGTGACCAGCCCAAGTTGTTGGGCATAGAGACCCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103680 TGCAGCACCTCCTGTGACCAGCCCAAGTTGTTGGGCATAGAGACCCCGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCTAAAAAGGAGTTGCTCCTGCCTGGGAACAACCGGAAGGTGTATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103730 GCCTAAAAAGGAGTTGCTCCTGCCTGGGAACAACCGGAAGGTGTATGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAGCAATGTGCAAGAAGATAGCCAACCAATGTGCTATTCAAACTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103780 TGAGCAATGTGCAAGAAGATAGCCAACCAATGTGCTATTCAAACTGCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGGGCAGTCAACAGCTAAAACCTTCCTCACCGTGTACT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 103830 GATGGGCAGTCAACAGCTAAAACCTTCCTCACCGTGTACTGTG...CAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACTCCAGAACGGGTGGAACTGGCACCCCTCCCCTCTTGGCAGCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112323 GACTCCAGAACGGGTGGAACTGGCACCCCTCCCCTCTTGGCAGCCAGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAAGAACCTTACCCTACGCTGCCAGGTGGAGGGTGGGGCACCCCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112373 GCAAGAACCTTACCCTACGCTGCCAGGTGGAGGGTGGGGCACCCCGGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AACCTCACCGTGGTGCTGCTCCGTGGGGAGAAGGAGCTGAAACGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112423 AACCTCACCGTGGTGCTGCTCCGTGGGGAGAAGGAGCTGAAACGGGAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCTGTGGGGGAGCCCGCTGAGGTCACGACCACGGTGCTGGTGAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112473 AGCTGTGGGGGAGCCCGCTGAGGTCACGACCACGGTGCTGGTGAGGAGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATCACCATGGAGCCAATTTCTCGTGCCGCACTGAACTGGACCTGCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112523 ATCACCATGGAGCCAATTTCTCGTGCCGCACTGAACTGGACCTGCGGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CAAGGGCTGGAGCTGTTTGAGAACACCTCGGCCCCCTACCAGCTCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112573 CAAGGGCTGGAGCTGTTTGAGAACACCTCGGCCCCCTACCAGCTCCAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTTTG         TCCTGCCAGCGACTCCCCCACAACTTGTCAGCCCCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112623 CTTTGGTG...TAGTCCTGCCAGCGACTCCCCCACAACTTGTCAGCCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGGTCCTAGAGGTGGACACGCAGGGGACCGTGGTCTGTTCCCTGGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112910 GGGTCCTAGAGGTGGACACGCAGGGGACCGTGGTCTGTTCCCTGGACGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGTTCCCAGTCTCGGAGGCCCAGGTCCACCTGGCACTGGGGGACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112960 CTGTTCCCAGTCTCGGAGGCCCAGGTCCACCTGGCACTGGGGGACCAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GTTGAACCCCACAGTCACCTATGGCAACGACTCCTTCTCGGCCAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113010 GTTGAACCCCACAGTCACCTATGGCAACGACTCCTTCTCGGCCAAGGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CAGTCAGTGTGACCGCAGAGGACGAGGGCACCCAGCGGCTGACGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113060 CAGTCAGTGTGACCGCAGAGGACGAGGGCACCCAGCGGCTGACGTGTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GTAATACTGGGGAACCAGAGCCAGGAGACACTGCAGACAGTGACCATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113110 GTAATACTGGGGAACCAGAGCCAGGAGACACTGCAGACAGTGACCATCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CA         GCTTTCCGGCGCCCAACGTGATTCTGACGAAGCCAGAGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113160 CAGTA...CAGGCTTTCCGGCGCCCAACGTGATTCTGACGAAGCCAGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCTCAGAAGGGACCGAGGTGACAGTGAAGTGTGAGGCCCACCCTAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113283 TCTCAGAAGGGACCGAGGTGACAGTGAAGTGTGAGGCCCACCCTAGAGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AAGGTGACGCTGAATGGGGTTCCAGCCCAGCCACTGGGCCCGAGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113333 AAGGTGACGCTGAATGGGGTTCCAGCCCAGCCACTGGGCCCGAGGGCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GCTCCTGCTGAAGGCCACCCCAGAGGACAACGGGCGCAGCTTCTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113383 GCTCCTGCTGAAGGCCACCCCAGAGGACAACGGGCGCAGCTTCTCCTGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CTGCAACCCTGGAGGTGGCCGGCCAGCTTATACACAAGAACCAGACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113433 CTGCAACCCTGGAGGTGGCCGGCCAGCTTATACACAAGAACCAGACCCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GAGCTTCGTGTCCTGT         ATGGCCCCCGACTGGACGAGAGGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113483 GAGCTTCGTGTCCTGTGTG...CAGATGGCCCCCGACTGGACGAGAGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TTGTCCGGGAAACTGGACGTGGCCAGAAAATTCCCAGCAGACTCCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113649 TTGTCCGGGAAACTGGACGTGGCCAGAAAATTCCCAGCAGACTCCAATGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GCCAGGCTTGGGGGAACCCATTGCCCGAGCTCAAGTGTCTAAAGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113699 GCCAGGCTTGGGGGAACCCATTGCCCGAGCTCAAGTGTCTAAAGGATGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ACTTTCCCACTGCCCATCGGGGAATCAGTGACTGTCACTCGAGATCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113749 ACTTTCCCACTGCCCATCGGGGAATCAGTGACTGTCACTCGAGATCTTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GGGCACCTACCTCTGTCGGGCCAGGAGCACTCAAGGGGAGGTCACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113799 GGGCACCTACCTCTGTCGGGCCAGGAGCACTCAAGGGGAGGTCACCCGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AGGTGACCGTGAATGTGCTCT         CCCCCCGGTATGAGATTGTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113849 AGGTGACCGTGAATGTGCTCTGTG...CAGCCCCCCGGTATGAGATTGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 ATCATCACTGTGGTAGCAGCCGCAGTCATAATGGGCACTGCAGGCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113976 ATCATCACTGTGGTAGCAGCCGCAGTCATAATGGGCACTGCAGGCCTCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CACGTACCTCTATAACCGCCAGCGGAAGATCAAGAAATACAGACTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114026 CACGTACCTCTATAACCGCCAGCGGAAGATCAAGAAATACAGACTACAAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 AGGCCCAAAAAGGGACCCCCATGAAACCGAACACACAAGCCACGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114076 AGGCCCAAAAAGGGACCCCCATGAAACCGAACACACAAGCCACGCCTCCC