seq1 = pF1KB5917.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KB5917/gi568815578r_33308510.tfa (gi568815578r:33308510_33543620), 235111 bp

>pF1KB5917 1515
>gi568815578r:33308510_33543620 (Chr20)

(complement)

1-310  (100001-100310)   100% ->
311-496  (104595-104780)   100% ->
497-701  (125698-125902)   100% ->
702-909  (130839-131046)   100% ->
910-1040  (131195-131325)   100% ->
1041-1237  (133290-133486)   100% ->
1238-1425  (134733-134920)   100% ->
1426-1515  (135022-135111)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCGGCAGGCGCGCCCCGCGCACCGGGCTGCTGGAGCTGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCCGGCAGGCGCGCCCCGCGCACCGGGCTGCTGGAGCTGCGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGCGGGCTCGGGGGCCGGCGGCGAGCGATGGCAGCGGGTGCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGGCGGGCTCGGGGGCCGGCGGCGAGCGATGGCAGCGGGTGCTGCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCTGGCGGAGGACGTGCTGACCGTGAGCCCCGCCGACGGCGACCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCTGGCGGAGGACGTGCTGACCGTGAGCCCCGCCGACGGCGACCCTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGAGCCCGGCGCTCCGCGGGAGCAGGAGCCCGCGCAGCTCAACGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGAGCCCGGCGCTCCGCGGGAGCAGGAGCCCGCGCAGCTCAACGGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCGGAGCCGGGCGCCGGGCCCCCGCAGCTGCCAGAGGCGCTACTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCGGAGCCGGGCGCCGGGCCCCCGCAGCTGCCAGAGGCGCTACTGCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCGGCGCCGCGTGACGGTGCGCAAGGCCGACGCCGGTGGGCTGGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCGGCGCCGCGTGACGGTGCGCAAGGCCGACGCCGGTGGGCTGGGCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCATCAAAG         GCGGCCGGGAGAACAAGATGCCTATTCTCAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCATCAAAGGTG...CAGGCGGCCGGGAGAACAAGATGCCTATTCTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTCCAAGATCTTCAAGGGATTGGCAGCTGACCAGACAGAGGCCCTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104626 TTCCAAGATCTTCAAGGGATTGGCAGCTGACCAGACAGAGGCCCTTTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGGGGATGCCATCCTGTCTGTGAATGGGGAAGACTTGTCCTCTGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104676 TGGGGGATGCCATCCTGTCTGTGAATGGGGAAGACTTGTCCTCTGCTACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CATGATGAGGCGGTGCAGGTCCTCAAGAAGACAGGCAAGGAGGTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104726 CATGATGAGGCGGTGCAGGTCCTCAAGAAGACAGGCAAGGAGGTGGTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGAGG         TCAAGTATATGAAGGACGTCTCACCGTATTTCAAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104776 GGAGGGTA...CAGTCAAGTATATGAAGGACGTCTCACCGTATTTCAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACTCTACTGGTGGGACCTCGGTCGGCTGGGACTCACCTCCTGCCTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125734 ACTCTACTGGTGGGACCTCGGTCGGCTGGGACTCACCTCCTGCCTCACCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTTCAGCGGCAGCCTTCCTCCCCTGGCCCCACACCCCGGAACTTCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125784 CTTCAGCGGCAGCCTTCCTCCCCTGGCCCCACACCCCGGAACTTCAGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGCCAAACACATGTCCTTGAAGATGGCATATGTCTCGAAGAGGTGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125834 GGCCAAACACATGTCCTTGAAGATGGCATATGTCTCGAAGAGGTGCACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCAATGACCCGGAGCCCAG         GTATCTGGAGATCTGCTCGGCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 125884 CCAATGACCCGGAGCCCAGGTA...CAGGTATCTGGAGATCTGCTCGGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GATGGTCAAGACACCCTCTTCCTGAGGGCCAAGGATGAGGCTAGTGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130861 GATGGTCAAGACACCCTCTTCCTGAGGGCCAAGGATGAGGCTAGTGCGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GTCGTGGGCGACTGCCATCCAAGCCCAGGTCAATACTCTGACGCCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130911 GTCGTGGGCGACTGCCATCCAAGCCCAGGTCAATACTCTGACGCCGCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCAAGGATGAGCTGCAGGCACTGTTGGCAGCCACCAGCACAGCTGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130961 TCAAGGATGAGCTGCAGGCACTGTTGGCAGCCACCAGCACAGCTGGGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAGGACATCAAGCAGATTGGCTGGCTAACTGAGCAG         CTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 131011 CAGGACATCAAGCAGATTGGCTGGCTAACTGAGCAGGTA...CAGCTGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAGTGGGGGCACAGCCCCCACCCTGGCCCTGCTAACTGAAAAGGAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131200 CAGTGGGGGCACAGCCCCCACCCTGGCCCTGCTAACTGAAAAGGAACTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCCTCTACTTGTCTCTCCCCGAGACCCGCGAGGCCCTGAGCCGGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131250 TCCTCTACTTGTCTCTCCCCGAGACCCGCGAGGCCCTGAGCCGGCCAGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CGTACTGCCCCACTCATCGCCACCAG         ACTGGTGCACTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 131300 CGTACTGCCCCACTCATCGCCACCAGGTA...CAGACTGGTGCACTCAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCCCTCCAAGGGCTCAGTGCCCTACGATGCAGAGCTCTCTTTTGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133305 CCCCTCCAAGGGCTCAGTGCCCTACGATGCAGAGCTCTCTTTTGCCCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCACGGGCACGCGTCACGGTGTGGACACTCACCTGTTCAGCGTGGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133355 GCACGGGCACGCGTCACGGTGTGGACACTCACCTGTTCAGCGTGGAGTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CCGCAGGAGCTGGCTGCCTGGACCCGCCAGCTTGTGGATGGCTGTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133405 CCGCAGGAGCTGGCTGCCTGGACCCGCCAGCTTGTGGATGGCTGTCACCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGCCGCCGAGGGTGTGCAGGAGGTGTCTACAG         CCTGCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 133455 GGCCGCCGAGGGTGTGCAGGAGGTGTCTACAGGTG...CAGCCTGCACGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GGAATGGGCGTCCCTGCAGCCTGTCTGTGCACATCGACAAGGGCTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134742 GGAATGGGCGTCCCTGCAGCCTGTCTGTGCACATCGACAAGGGCTTCACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CTGTGGGCGGCTGAGCCAGGTGCAGCCCGAGCTGTGCTCCTGCGACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134792 CTGTGGGCGGCTGAGCCAGGTGCAGCCCGAGCTGTGCTCCTGCGACAGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CTTCGAGAAGCTGCAGATGTCTTCAGATGACGGTGCCAGTCTCCTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134842 CTTCGAGAAGCTGCAGATGTCTTCAGATGACGGTGCCAGTCTCCTTTTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TGGATTTTGGAGGTGCTGAAGGCGAGATC         CAGCTGGACCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 134892 TGGATTTTGGAGGTGCTGAAGGCGAGATCGTG...CAGCAGCTGGACCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CACTCGTGTCCCAAAACCATAGTCTTCATCATCCACTCCTTCCTGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135034 CACTCGTGTCCCAAAACCATAGTCTTCATCATCCACTCCTTCCTGTCGGC

   1550     .    :    .    :    .
   1488 CAAAGTCACCCGCCTCGGGCTGTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 135084 CAAAGTCACCCGCCTCGGGCTGTTGGCC