seq1 = pF1KB5915.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KB5915/gi568815586f_27680331.tfa (gi568815586f:27680331_27898163), 217833 bp

>pF1KB5915 1515
>gi568815586f:27680331_27898163 (Chr12)

1-872  (100001-100872)   100% ->
873-1066  (111378-111571)   100% ->
1067-1515  (117385-117833)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCCGAGGAGATGGTGCAGATCCGCCTGGAGGACCGCTGCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCCGAGGAGATGGTGCAGATCCGCCTGGAGGACCGCTGCTACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGAGCAAGAGGAAGCTCATCGAGCAGAGCGACTACTTCCGCGCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGAGCAAGAGGAAGCTCATCGAGCAGAGCGACTACTTCCGCGCCCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGCTCCGGCATGCGCGAGGCCCTGAGCCAGGAGGCCGGCGGCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCGCTCCGGCATGCGCGAGGCCCTGAGCCAGGAGGCCGGCGGCCCGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCAGCAGCTGCGCGGCCTCAGCGCGCCGGGCCTGCGGCTGGTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCAGCAGCTGCGCGGCCTCAGCGCGCCGGGCCTGCGGCTGGTGCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCATCAACGCCGGCGGGGCCCGCGAAGGCTGGCTCCTGGGCCCGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCATCAACGCCGGCGGGGCCCGCGAAGGCTGGCTCCTGGGCCCGCGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGAAAAGGGCGGCGGGGTGGACGAGGACGAGGAGATGGATGAGGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGAAAAGGGCGGCGGGGTGGACGAGGACGAGGAGATGGATGAGGTGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTGTCCGAGCTGGTGGAGGCGGCCTCCTTCCTGCAGGTCACGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTGTCCGAGCTGGTGGAGGCGGCCTCCTTCCTGCAGGTCACGTCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGCAGCTGCTGCTGTCCCAGGTGCGGCTCAATAACTGCCTGGAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGCAGCTGCTGCTGTCCCAGGTGCGGCTCAATAACTGCCTGGAGATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCGCCTGGCGCAGGTGTACGGGCTGCCCGACCTGCAGGAGGCCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCGCCTGGCGCAGGTGTACGGGCTGCCCGACCTGCAGGAGGCCTGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCTTCATGGTCGTCCACTTCCACGAGGTGCTGTGCAAGCCCCAGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCTTCATGGTCGTCCACTTCCACGAGGTGCTGTGCAAGCCCCAGTTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTCCTGGGGTCTCCTCCCCAAGCTCCAGGGGATGTCAGCCTGAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCCTGGGGTCTCCTCCCCAAGCTCCAGGGGATGTCAGCCTGAAGCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGCTGAGGGAGGCCCGGATGACTGGGACTCCTGTCCTCGTGGCCCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGCTGAGGGAGGCCCGGATGACTGGGACTCCTGTCCTCGTGGCCCTCGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACTTCCTGGGGGGACCCCTGGCCCCTCACCCCTACCAGGGGGAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACTTCCTGGGGGGACCCCTGGCCCCTCACCCCTACCAGGGGGAGCCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTCCATGCTCAGGTACGAGGAGATGACTGAGCGTTGGTTCCCGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTCCATGCTCAGGTACGAGGAGATGACTGAGCGTTGGTTCCCGCTGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAACCTTCCTCCCGACCTGGTCAATGTCAGGGGCTATGGGTCTGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACAACCTTCCTCCCGACCTGGTCAATGTCAGGGGCTATGGGTCTGCCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGGACAACTACCTCTTCATAGTGGGCGGGTACAGGATCACTAGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGGACAACTACCTCTTCATAGTGGGCGGGTACAGGATCACTAGCCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATCTCCGCTGCGCATTCCTACAACCCCAGCACCAACGAGTGGCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATCTCCGCTGCGCATTCCTACAACCCCAGCACCAACGAGTGGCTCCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGCCTCCATGAACCAGAAGAG         GTCTAACTTCAAACTTGTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100851 TGGCCTCCATGAACCAGAAGAGGTA...CAGGTCTAACTTCAAACTTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCTGTTAATTCAAAACTCTATGCCATCGGAGGGCAGGCCGTTTCTAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111397 GCTGTTAATTCAAAACTCTATGCCATCGGAGGGCAGGCCGTTTCTAACGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGAGTGTTACAACCCCGAGCAGGATGCGTGGAATTTTGTGGCGCCCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111447 TGAGTGTTACAACCCCGAGCAGGATGCGTGGAATTTTGTGGCGCCCTTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCAATCCTCTGGCTGAGTTCTCTGCCTGTGAGTGTAAGGGAAAAATTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111497 CCAATCCTCTGGCTGAGTTCTCTGCCTGTGAGTGTAAGGGAAAAATTTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTCATTGGAGGATACACTACCAGAG         ACCGGAACATGAACAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 111547 GTCATTGGAGGATACACTACCAGAGGTA...CAGACCGGAACATGAACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TTTGCAGTACTGCCCCTCTTCCGACATGTGGACGCTCTTTGAAACATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117401 TTTGCAGTACTGCCCCTCTTCCGACATGTGGACGCTCTTTGAAACATGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ACGTCCACATTCGCAAGCAGCAGATGGTGTCTGTGGAAGAGACCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117451 ACGTCCACATTCGCAAGCAGCAGATGGTGTCTGTGGAAGAGACCATCTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 ATCGTGGGGGGGTGTCTCCACGAGCTGGGGCCCAACCGCAGGAGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117501 ATCGTGGGGGGGTGTCTCCACGAGCTGGGGCCCAACCGCAGGAGCAGCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GAGCGAGGACATGCTCACCGTGCAGTCCTACAACACCGTCACCCGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117551 GAGCGAGGACATGCTCACCGTGCAGTCCTACAACACCGTCACCCGCCAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 GGCTCTACCTCAAGGAGAACACGTCCAAATCGGGTCTTAACTTGACTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117601 GGCTCTACCTCAAGGAGAACACGTCCAAATCGGGTCTTAACTTGACTTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GCGCTCCATAACGACGGCATCTACATCATGAGCAGAGACGTCACCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117651 GCGCTCCATAACGACGGCATCTACATCATGAGCAGAGACGTCACCCTGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GACCAGCTTGGAACACCGAGTGTTCCTCAAGTACAACATCTTTTCAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117701 GACCAGCTTGGAACACCGAGTGTTCCTCAAGTACAACATCTTTTCAGATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 GTTGGGAAGCATTTCGGCGTTTTCCAGCTTTTGGACATAACTTGCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117751 GTTGGGAAGCATTTCGGCGTTTTCCAGCTTTTGGACATAACTTGCTGGTT

   1500     .    :    .    :    .    :
   1483 TCTTCTCTTTATCTGCCCAATAAAGCAGAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 117801 TCTTCTCTTTATCTGCCCAATAAAGCAGAAACA