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seq2 = pF1KB5896/gi568815595f_196682647.tfa (gi568815595f:196682647_196928402), 245756 bp

>pF1KB5896 1572
>gi568815595f:196682647_196928402 (Chr3)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-288  (119281-119381)   100% ->
289-436  (120371-120518)   100% ->
437-468  (122706-122737)   100% ->
469-576  (123933-124040)   100% ->
577-709  (125136-125268)   100% ->
710-773  (127944-128007)   100% ->
774-822  (129573-129621)   100% ->
823-935  (130093-130205)   100% ->
936-1053  (131805-131922)   100% ->
1054-1153  (135411-135510)   100% ->
1154-1350  (137725-137921)   100% ->
1351-1488  (144550-144687)   100% ->
1489-1572  (145673-145756)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGATAACGGAGAACTGGAAGATAAGCCTCCAGCACCTCCTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGATAACGGAGAACTGGAAGATAAGCCTCCAGCACCTCCTGTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATGAGCAGCACCATCTTTAGCACTGGAGGCAAAGACCCTTTGTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATGAGCAGCACCATCTTTAGCACTGGAGGCAAAGACCCTTTGTCAGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCACAGTTTGAAACCTTTGCCCTCTGTTCCAGAAGAGAAAAAGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCACAGTTTGAAACCTTTGCCCTCTGTTCCAGAAGAGAAAAAGCCCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATAAAATCATCTCCATATTCTCAGGCACAGAGAAAG         GAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 CATAAAATCATCTCCATATTCTCAGGCACAGAGAAAGGTA...TAGGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAAAAAGAAAGAAAAGGAACGGCCAGAAATTTCTCCTCCATCTGATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119285 TAAAAAGAAAGAAAAGGAACGGCCAGAAATTTCTCCTCCATCTGATTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCACACCATCCATGTTGGCTTTGATGCTGTTACTGGAGAATTCACT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 119335 AGCACACCATCCATGTTGGCTTTGATGCTGTTACTGGAGAATTCACTGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       GGCATGCCAGAACAGTGGGCTCGATTACTACAGACCTCCAATAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119385 ...TAGGGCATGCCAGAACAGTGGGCTCGATTACTACAGACCTCCAATAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACCAAACTAGAGCAAAAGAAGAATCCTCAGGCTGTGCTGGATGTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120415 CACCAAACTAGAGCAAAAGAAGAATCCTCAGGCTGTGCTGGATGTCCTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTTCTACGACTCCAACACAGTGAAGCAGAAATATCTGAGCTTTACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120465 AGTTCTACGACTCCAACACAGTGAAGCAGAAATATCTGAGCTTTACTCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCTG         AGAAAGATGGCTTTCCTTCTGGAACACCAGCA     
        ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 120515 CCTGGTA...CAGAGAAAGATGGCTTTCCTTCTGGAACACCAGCAGTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    469     CTGAATGCCAAGGGAACAGAAGCACCCGCAGTAGTGACAGAGGAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122743 .CAGCTGAATGCCAAGGGAACAGAAGCACCCGCAGTAGTGACAGAGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGATGATGATGAAGAGACTGCTCCTCCCGTTATTGCCCCGCGACCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123979 AGGATGATGATGAAGAGACTGCTCCTCCCGTTATTGCCCCGCGACCGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CATACGAAATCA         ATTTACACACGGTCTGTAATTGACCCTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 124029 CATACGAAATCAGTG...CAGATTTACACACGGTCTGTAATTGACCCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCCTGCACCAGTTGGTGATTCACATGTTGATGGTGCTGCCAAGTCTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125165 TCCTGCACCAGTTGGTGATTCACATGTTGATGGTGCTGCCAAGTCTTTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACAAACAGAAAAAGAAGACTAAGATGACAGATGAAGAGATTATGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125215 ACAAACAGAAAAAGAAGACTAAGATGACAGATGAAGAGATTATGGAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTAA         GAACTATCGTGAGCATAGGTGACCCTAAGAAAAAATA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125265 TTAAGTA...TAGGAACTATCGTGAGCATAGGTGACCCTAAGAAAAAATA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TACAAGATATGAAAAAATTGGACAAGG         GGCTTCTGGTACAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 127981 TACAAGATATGAAAAAATTGGACAAGGGTA...TAGGGCTTCTGGTACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTTTCACTGCTACTGACGTTGCACTGGGACAGGAG         GTTGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 129587 TTTTCACTGCTACTGACGTTGCACTGGGACAGGAGGTA...TAGGTTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ATCAAACAAATTAATTTACAGAAACAGCCAAAGAAGGAACTGATCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130099 ATCAAACAAATTAATTTACAGAAACAGCCAAAGAAGGAACTGATCATTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CGAGATTCTGGTGATGAAAGAATTGAAAAATCCCAACATCGTTAACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130149 CGAGATTCTGGTGATGAAAGAATTGAAAAATCCCAACATCGTTAACTTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGGACAG         TTACCTGGTAGGAGATGAATTGTTTGTGGTCATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130199 TGGACAGGTA...TAGTTACCTGGTAGGAGATGAATTGTTTGTGGTCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAATACCTTGCTGGGGGGTCACTCACTGATGTGGTAACAGAAACGTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131839 GAATACCTTGCTGGGGGGTCACTCACTGATGTGGTAACAGAAACGTGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GGATGAAGCACAGATTGCTGCTGTATGCAGAGAG         TGTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 131889 GGATGAAGCACAGATTGCTGCTGTATGCAGAGAGGTA...CAGTGTTTAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGGCATTGGAGTTTTTACATGCTAATCAAGTGATCCACAGAGACATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135418 AGGCATTGGAGTTTTTACATGCTAATCAAGTGATCCACAGAGACATCAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AGTGACAATGTACTTTTGGGAATGGAAGGATCTGTTAAGCTCA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 135468 AGTGACAATGTACTTTTGGGAATGGAAGGATCTGTTAAGCTCAGTG...T

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1154   CTGACTTTGGTTTCTGTGCCCAGATCACCCCTGAGCAGAGCAAACGCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137723 AGCTGACTTTGGTTTCTGTGCCCAGATCACCCCTGAGCAGAGCAAACGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GTACCATGGTCGGAACGCCATACTGGATGGCACCAGAGGTGGTTACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137773 GTACCATGGTCGGAACGCCATACTGGATGGCACCAGAGGTGGTTACACGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AAAGCTTATGGCCCTAAAGTCGACATATGGTCTCTGGGTATCATGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137823 AAAGCTTATGGCCCTAAAGTCGACATATGGTCTCTGGGTATCATGGCTAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGAGATGGTAGAAGGAGAGCCTCCATACCTCAATGAAAATCCCTTGAGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 137873 TGAGATGGTAGAAGGAGAGCCTCCATACCTCAATGAAAATCCCTTGAGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351         GCCTTGTACCTAATAGCAACTAATGGAACCCCAGAACTTCAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137923 TA...TAGGCCTTGTACCTAATAGCAACTAATGGAACCCCAGAACTTCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AATCCAGAGAAACTTTCCCCAATATTTCGGGATTTCTTAAATCGATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144592 AATCCAGAGAAACTTTCCCCAATATTTCGGGATTTCTTAAATCGATGTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGAAATGGATGTGGAAAAAAGGGGTTCAGCCAAAGAATTATTACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 144642 GGAAATGGATGTGGAAAAAAGGGGTTCAGCCAAAGAATTATTACAGGTA.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1489      CATCCTTTCCTGAAACTGGCCAAACCGTTATCTAGCTTGACACCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144692 ..CAGCATCCTTTCCTGAAACTGGCCAAACCGTTATCTAGCTTGACACCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .
   1534 CTGATCATGGCAGCTAAAGAAGCAATGAAGAGTAACCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145718 CTGATCATGGCAGCTAAAGAAGCAATGAAGAGTAACCGT