seq1 = pF1KB5893.tfa, 1497 bp
seq2 = pF1KB5893/gi568815579f_46247097.tfa (gi568815579f:46247097_46490343), 243247 bp

>pF1KB5893 1497
>gi568815579f:46247097_46490343 (Chr19)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-363  (106652-106893)   100% ->
364-511  (128508-128655)   100% ->
512-633  (129357-129478)   100% ->
634-699  (136315-136380)   100% ->
700-798  (136684-136782)   100% ->
799-904  (137708-137813)   100% ->
905-1047  (139997-140139)   100% ->
1048-1135  (140270-140357)   100% ->
1136-1176  (141312-141352)   100% ->
1177-1355  (141457-141635)   100% ->
1356-1437  (142955-143036)   100% ->
1438-1497  (143188-143247)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGATGGCGGAGGGCGAGAGGACTGAGTGTGCTGAGCCCCCCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGATGGCGGAGGGCGAGAGGACTGAGTGTGCTGAGCCCCCCCGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAACCCCCGGCTGATGGAGCTCTGAAGCGGGCAGAGGAGCTCAAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAACCCCCGGCTGATGGAGCTCTGAAGCGGGCAGAGGAGCTCAAGACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCAATGACTACTTCAAAG         CCAAGGACTACGAGAACGCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 AGGCCAATGACTACTTCAAAGGTG...CAGCCAAGGACTACGAGAACGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCAAGTTCTACAGCCAGGCCATCGAGCTGAACCCCAGCAATGCCATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106672 ATCAAGTTCTACAGCCAGGCCATCGAGCTGAACCCCAGCAATGCCATCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTATGGCAACCGCAGCCTGGCCTACCTGCGCACTGAGTGCTATGGCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106722 CTATGGCAACCGCAGCCTGGCCTACCTGCGCACTGAGTGCTATGGCTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCTGGGAGACGCCACGCGGGCCATTGAGCTGGACAAGAAGTACATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106772 CGCTGGGAGACGCCACGCGGGCCATTGAGCTGGACAAGAAGTACATCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGTTATTACCGCCGGGCTGCCAGCAACATGGCACTGGGCAAGTTCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106822 GGTTATTACCGCCGGGCTGCCAGCAACATGGCACTGGGCAAGTTCCGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCGCTGCGAGACTACGAGACG         GTGGTCAAGGTGAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 106872 CGCGCTGCGAGACTACGAGACGGTG...CAGGTGGTCAAGGTGAAGCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGACAAGGATGCCAAAATGAAATACCAGGAGTGCAACAAGATCGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128527 ATGACAAGGATGCCAAAATGAAATACCAGGAGTGCAACAAGATCGTGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGAAGGCCTTTGAGCGGGCCATCGCGGGCGACGAGCACAAGCGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128577 CAGAAGGCCTTTGAGCGGGCCATCGCGGGCGACGAGCACAAGCGCTCCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGTGGACTCGCTGGACATCGAGAGCATGA         CCATTGAGGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 128627 GGTGGACTCGCTGGACATCGAGAGCATGAGTG...TAGCCATTGAGGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTACAGCGGACCCAAGCTTGAAGACGGCAAAGTGACAATCAGTTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129369 AGTACAGCGGACCCAAGCTTGAAGACGGCAAAGTGACAATCAGTTTCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGGAGCTCATGCAGTGGTACAAGGACCAGAAGAAACTGCACCGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129419 AAGGAGCTCATGCAGTGGTACAAGGACCAGAAGAAACTGCACCGGAAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGCCTACCAG         ATTCTGGTACAGGTCAAAGAGGTCCTCTCCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 129469 TGCCTACCAGGTA...CAGATTCTGGTACAGGTCAAAGAGGTCCTCTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCTGAGCACGCTCGTGGAAACCACACTCAAAGAG         ACAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 136346 AGCTGAGCACGCTCGTGGAAACCACACTCAAAGAGGTG...CAGACAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGATTACAGTATGTGGGGACACCCATGGCCAGTTCTATGACCTCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136690 AAGATTACAGTATGTGGGGACACCCATGGCCAGTTCTATGACCTCCTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATATTCGAGCTCAACGGTTTACCCTCGGAGACCAACCCCTAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 136740 CATATTCGAGCTCAACGGTTTACCCTCGGAGACCAACCCCTATGTA...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    799   ATATTTAATGGTGACTTTGTGGACCGAGGCTCCTTCTCTGTAGAAGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137706 AGATATTTAATGGTGACTTTGTGGACCGAGGCTCCTTCTCTGTAGAAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATCCTCACCCTTTTCGGCTTCAAGCTCCTGTACCCAGATCACTTTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137756 ATCCTCACCCTTTTCGGCTTCAAGCTCCTGTACCCAGATCACTTTCACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCTTCGAG         GCAACCACGAGACAGACAACATGAACCAGATCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 137806 CCTTCGAGGTG...CAGGCAACCACGAGACAGACAACATGAACCAGATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACGGTTTCGAGGGTGAGGTGAAGGCCAAGTACACAGCCCAGATGTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140030 ACGGTTTCGAGGGTGAGGTGAAGGCCAAGTACACAGCCCAGATGTACGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTCTTTAGCGAGGTGTTCGAGTGGCTCCCGTTGGCCCAGTGCATCAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140080 CTCTTTAGCGAGGTGTTCGAGTGGCTCCCGTTGGCCCAGTGCATCAACGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAAAGTGCTG         ATCATGCACGGAGGCCTGTTCAGTGAAGACG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 140130 CAAAGTGCTGGTG...CAGATCATGCACGGAGGCCTGTTCAGTGAAGACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GTGTCACCCTGGATGACATCCGGAAAATTGAGCGGAATCGACAACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140301 GTGTCACCCTGGATGACATCCGGAAAATTGAGCGGAATCGACAACCCCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GATTCAG         GGCCCATGTGTGACCTGCTCTGGTCAGATCCACA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140351 GATTCAGGTG...CAGGGCCCATGTGTGACCTGCTCTGGTCAGATCCACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCCACAG         AACGGGCGCTCGATCAGCAAGCGGGGCGTGAGCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141346 GCCACAGGTG...CAGAACGGGCGCTCGATCAGCAAGCGGGGCGTGAGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GTCAGTTTGGGCCTGACGTCACCAAGGCCTTCTTGGAAGAGAACAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141491 GTCAGTTTGGGCCTGACGTCACCAAGGCCTTCTTGGAAGAGAACAACCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GACTATATCATCCGCAGCCACGAAGTCAAGGCCGAGGGCTACGAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141541 GACTATATCATCCGCAGCCACGAAGTCAAGGCCGAGGGCTACGAGGTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TCACGGAGGCCGCTGTGTCACCGTCTTCTCTGCCCCCAACTACTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 141591 TCACGGAGGCCGCTGTGTCACCGTCTTCTCTGCCCCCAACTACTGGTA..

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356     CGACCAGATGGGGAACAAAGCCTCCTACATCCACCTCCAGGGCTCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141641 .CAGCGACCAGATGGGGAACAAAGCCTCCTACATCCACCTCCAGGGCTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GACCTACGGCCTCAGTTCCACCAGTTCACAGCAGTG         CCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 143001 GACCTACGGCCTCAGTTCCACCAGTTCACAGCAGTGGTG...CAGCCTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCCCAACGTCAAGCCCATGGCCTATGCCAACACGCTGCTGCAGCTAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143193 TCCCAACGTCAAGCCCATGGCCTATGCCAACACGCTGCTGCAGCTAGGAA

   1600     .
   1493 TGATG
        |||||
 143243 TGATG