seq1 = pF1KB5891.tfa, 1494 bp
seq2 = pF1KB5891/gi568815597r_27308192.tfa (gi568815597r:27308192_27528890), 220699 bp

>pF1KB5891 1494
>gi568815597r:27308192_27528890 (Chr1)

(complement)

1-130  (100001-100130)   100% ->
131-265  (109803-109937)   100% ->
266-419  (110469-110622)   100% ->
420-537  (112789-112906)   100% ->
538-668  (113928-114058)   100% ->
669-824  (116164-116319)   100% ->
825-1339  (118685-119199)   100% ->
1340-1494  (120545-120699)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGTTAGTAACGAGGAACATCGAGCCAAGGCACCTGTGCCGTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGTTAGTAACGAGGAACATCGAGCCAAGGCACCTGTGCCGTCAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGCCTAGCGTTAGAAGCGAGCTGGAATGCGTGACCAACATCACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTGCCTAGCGTTAGAAGCGAGCTGGAATGCGTGACCAACATCACCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAAATGTCATCCGACAGCTGGGCAGCCTGA         GTAAATATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 CAAATGTCATCCGACAGCTGGGCAGCCTGAGTG...CAGGTAAATATGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGACATTTTTGGAGAGCTCTTTACTCAGGCAAATACCTTTGCCTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109814 GAGGACATTTTTGGAGAGCTCTTTACTCAGGCAAATACCTTTGCCTCTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTAAGCTCCCTTGCTGAGAGGGTCGACCGACTACAGGTTAAAGTCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109864 GGTAAGCTCCCTTGCTGAGAGGGTCGACCGACTACAGGTTAAAGTCACTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCTGGATCCCAAGGAAGAAGAAG         TGTCACTGCAAGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 109914 AGCTGGATCCCAAGGAAGAAGAAGGTA...CAGTGTCACTGCAAGGAATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AACACCCGAAAAGCCTTCAGAAGTTCCACCATTCAAGACCAGAAGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110486 AACACCCGAAAAGCCTTCAGAAGTTCCACCATTCAAGACCAGAAGCTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGACAGAAACTCTCTCCCAGTGCCTGTCTTAGAAACATACAATACCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110536 TGACAGAAACTCTCTCCCAGTGCCTGTCTTAGAAACATACAATACCTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATACTCCTCCCCCTCTCAACAATCTTACCCCTTACAG         GGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 110586 ATACTCCTCCCCCTCTCAACAATCTTACCCCTTACAGGTA...CAGGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATGGAAAAGAGGCACTCAAATTCTACACAGACCCTTCATACTTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112793 GATGGAAAAGAGGCACTCAAATTCTACACAGACCCTTCATACTTCTTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCTTTGGAAGGAGAAGATGCTGCAGGACACCAAGGATATCATGAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112843 TCTTTGGAAGGAGAAGATGCTGCAGGACACCAAGGATATCATGAAAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAGAAAGCATAGG         AAAGAAAAGAAAGATAATCCAAATCGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 112893 AGAGAAAGCATAGGGTG...TAGAAAGAAAAGAAAGATAATCCAAATCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGGAATGTAAACCCACGTAAAATCAAGACACGTAAGGAAGAGTGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113955 GGGAATGTAAACCCACGTAAAATCAAGACACGTAAGGAAGAGTGGGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AATGAAGATGGGGCAAGAATTTGTGGAGTCCAAAGAAAAGCTGGGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114005 AATGAAGATGGGGCAAGAATTTGTGGAGTCCAAAGAAAAGCTGGGGACTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTGG         GTATCCACCCACTTTGGTGTACCAGAATGGCAGCATT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114055 CTGGGTA...CAGGTATCCACCCACTTTGGTGTACCAGAATGGCAGCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGCTGTGTTGAAAACGTGGATGCAAGTAGCTATCCGCCACCACCACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116201 GGCTGTGTTGAAAACGTGGATGCAAGTAGCTATCCGCCACCACCACAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGACTCTGCTTCTTCACCTTCTCCTTCCTTCTCCGAGGACAACTTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116251 AGACTCTGCTTCTTCACCTTCTCCTTCCTTCTCCGAGGACAACTTGCCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTCCACCAGCAGAATTCAG         TTACCCAGTGGACAACCAAAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 116301 CTCCACCAGCAGAATTCAGGTA...TAGTTACCCAGTGGACAACCAAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGATCTGGTTTGGCTGGACCCAAAAGATCCAGTGTGGTCAGCCCAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118707 GGATCTGGTTTGGCTGGACCCAAAAGATCCAGTGTGGTCAGCCCAAGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCCACCACCAGCTCCTCCTCTAGGCTCTCCACCAGGCCCTAAACCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118757 TCCACCACCAGCTCCTCCTCTAGGCTCTCCACCAGGCCCTAAACCCGGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTGCTCCACCACCTGCCCCTCCGCCACCTCCGCCTCCAATGATAGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118807 TTGCTCCACCACCTGCCCCTCCGCCACCTCCGCCTCCAATGATAGGCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCACCTCCACCACCGCCTGTAGGATTTGGGTCTCCAGGGACGCCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118857 CCACCTCCACCACCGCCTGTAGGATTTGGGTCTCCAGGGACGCCTCCACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 ACCCTCACCCCCATCTTTCCCACCTCACCCTGATTTTGCTGCCCCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118907 ACCCTCACCCCCATCTTTCCCACCTCACCCTGATTTTGCTGCCCCTCCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTCCTCCTCCACCACCAGCAGCTGACTACCCAACTCTGCCACCACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118957 CTCCTCCTCCACCACCAGCAGCTGACTACCCAACTCTGCCACCACCTCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TTGTCCCAGCCAACAGGAGGAGCACCTCCTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119007 TTGTCCCAGCCAACAGGAGGAGCACCTCCTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCCGGGGCCCCCTCCTCCCCCTTTCACTGGTGCAGATGGCCAGCCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119057 TCCGGGGCCCCCTCCTCCCCCTTTCACTGGTGCAGATGGCCAGCCTGCTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TACCACCACCGCTTTCTGATACCACCAAGCCCAAGTCCTCCTTGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119107 TACCACCACCGCTTTCTGATACCACCAAGCCCAAGTCCTCCTTGCCTGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GTGAGCGATGCCCGTAGCGACCTGCTTTCAGCCATCCGTCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 119157 GTGAGCGATGCCCGTAGCGACCTGCTTTCAGCCATCCGTCAAGGTA...T

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1340   GTTTTCAGCTGCGCAGGGTTGAGGAGCAGCGGGAACAAGAGAAGCGGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120543 AGGTTTTCAGCTGCGCAGGGTTGAGGAGCAGCGGGAACAAGAGAAGCGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ATGTTGTGGGCAATGACGTGGCCACCATCTTGTCTCGTCGCATTGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120593 ATGTTGTGGGCAATGACGTGGCCACCATCTTGTCTCGTCGCATTGCTGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GAGTACAGTGACTCAGAAGATGACTCCTCTGAATTTGATGAGGACGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120643 GAGTACAGTGACTCAGAAGATGACTCCTCTGAATTTGATGAGGACGACTG

   1550     .
   1488 GTCCGAT
        |||||||
 120693 GTCCGAT