seq1 = pF1KB5874.tfa, 1482 bp
seq2 = pF1KB5874/gi568815597r_29048413.tfa (gi568815597r:29048413_29281752), 233340 bp

>pF1KB5874 1482
>gi568815597r:29048413_29281752 (Chr1)

(complement)

1-107  (100001-100107)   100% ->
108-250  (121236-121378)   100% ->
251-363  (122267-122379)   100% ->
364-578  (126843-127057)   100% ->
579-668  (131561-131650)   100% ->
669-1482  (132527-133340)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCGGGTGTACATCGGCCGCCTGAGCTACCAGGCCCGGGAGCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCGGGTGTACATCGGCCGCCTGAGCTACCAGGCCCGGGAGCGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGGAGCGCTTCTTTAAGGGCTACGGGAAGATCCTGGAGGTGGATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGGAGCGCTTCTTTAAGGGCTACGGGAAGATCCTGGAGGTGGATCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAACGG         ATATGGTTTTGTGGAGTTTGATGATCTGCGTGAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAACGGGTG...TAGATATGGTTTTGTGGAGTTTGATGATCTGCGTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGATGATGCTGTTTATGAACTGAATGGCAAAGACCTTTGTGGTGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121270 GCAGATGATGCTGTTTATGAACTGAATGGCAAAGACCTTTGTGGTGAGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTAATTGTTGAGCATGCCCGCGGCCCACGGCGAGATGGCAGTTACGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121320 AGTAATTGTTGAGCATGCCCGCGGCCCACGGCGAGATGGCAGTTACGGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGGACGCA         GTGGATATGGTTATAGAAGAAGTGGCCGAGAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 121370 CTGGACGCAGTA...AAGGTGGATATGGTTATAGAAGAAGTGGCCGAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAATATGGCCCTCCTACTCGCACAGAGTACAGACTTATTGTGGAGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122299 AAATATGGCCCTCCTACTCGCACAGAGTACAGACTTATTGTGGAGAATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCAAGTCGGTGCAGCTGGCAAGACCTAAAG         GATTATATGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 122349 GTCAAGTCGGTGCAGCTGGCAAGACCTAAAGGTT...CAGGATTATATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTCAGGCAGGAGAAGTGACTTATGCAGATGCTCACAAGGGACGCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126853 GTCAGGCAGGAGAAGTGACTTATGCAGATGCTCACAAGGGACGCAAAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGGGGTGATTGAATTTGTATCTTATTCTGATATGAAAAGAGCTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126903 GAAGGGGTGATTGAATTTGTATCTTATTCTGATATGAAAAGAGCTTTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAGTTGGATGGAACTGAAGTCAATGGGAGAAAAATCAGATTAGTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126953 AAAGTTGGATGGAACTGAAGTCAATGGGAGAAAAATCAGATTAGTTGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAAGCCAGGTTCCAGACGACGCCGGTCCTACTCCAGAAGCCGGAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127003 ACAAGCCAGGTTCCAGACGACGCCGGTCCTACTCCAGAAGCCGGAGTCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCAAG         GTCTCGCTCTCGAAGCAGACATTCCCGTAAGAGCAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127053 TCAAGGTA...TAGGTCTCGCTCTCGAAGCAGACATTCCCGTAAGAGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAGCCGAAGTGGCAGCAGCAAAAGCAGTCATTCTAAGAGTAGATCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131597 AAGCCGAAGTGGCAGCAGCAAAAGCAGTCATTCTAAGAGTAGATCTCGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCAG         GTCGGGCTCCCGCTCCCGGAGCAAGAGCCGGAGCCGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131647 CCAGGTA...CAGGTCGGGCTCCCGCTCCCGGAGCAAGAGCCGGAGCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGCCAGAGTCGGAGCCGGAGCAAGAAAGAGAAAAGCAGGAGCCCCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132564 AGCCAGAGTCGGAGCCGGAGCAAGAAAGAGAAAAGCAGGAGCCCCAGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGACAAGAGCCGCAGCCGCAGCCATAGCGCTGGCAAGAGCCGCAGCAAGA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132614 GGAAAAGAGCCGCAGCCGCAGCCATAGCGCTGGCAAGAGCCGCAGCAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCAAAGACCAAGCTGAAGAGAAGATCCAAAACAATGACAATGTCGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132664 GCAAAGACCAAGCTGAAGAGAAGATCCAAAACAATGACAATGTCGGGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCCAAGAGCCGGAGTCCTAGCAGGCATAAAAGTAAGAGCAAAAGTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132714 CCCAAGAGCCGGAGTCCTAGCAGGCATAAAAGTAAGAGCAAAAGTCGGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAGGAGTCAGGAGAGGAGAGTGGAGGAGGAGAAGCGAGGGAGTGTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132764 CAGGAGTCAGGAGAGGAGAGTGGAGGAGGAGAAGCGAGGGAGTGTGAGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GGGGCAGGAGCCAGGAGAAGAGCCTCCGCCAGAGTCGGAGCCGGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132814 GGGGCAGGAGCCAGGAGAAGAGCCTCCGCCAGAGTCGGAGCCGGAGCAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AGCAAAGGGGGCAGCAGGAGCCGGAGCAGGAGCCGCAGCAAGAGCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132864 AGCAAAGGGGGCAGCAGGAGCCGGAGCAGGAGCCGCAGCAAGAGCAAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAAGAGGAAGGGCAGGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAGCCGCAGTCGCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132914 CAAGAGGAAGGGCAGGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAGCCGCAGTCGCAGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCAGCCGCAGCAAGAGTGAGAGGAGCAGAAAGCGAGGCAGCAAGCGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132964 GCAGCCGCAGCAAGAGTGAGAGGAGCAGAAAGCGAGGCAGCAAGCGAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AGCAAGGCGGGCAGCAGCAAGAAGAAGAAGAAGGAAGACACTGACCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133014 AGCAAGGCGGGCAGCAGCAAGAAGAAGAAGAAGGAAGACACTGACCGCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CCAGTCCAGATCTCCATCCCGCTCCGTGTCAAAGGAGCGGGAACATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133064 CCAGTCCAGATCTCCATCCCGCTCCGTGTCAAAGGAGCGGGAACATGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AGTCTGAATCCAGCCAGAGGGAAGGTCGAGGAGAGAGTGAGAATGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133114 AGTCTGAATCCAGCCAGAGGGAAGGTCGAGGAGAGAGTGAGAATGCTGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ACCAATCAGGAGACCCGGTCCAGGTCGAGATCCAATTCCAAATCGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133164 ACCAATCAGGAGACCCGGTCCAGGTCGAGATCCAATTCCAAATCGAAACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 AAACCTTCCATCAGAATCACGCTCCAGATCAAAGTCAGCTTCAAAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133214 AAACCTTCCATCAGAATCACGCTCCAGATCAAAGTCAGCTTCAAAAACCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GATCTCGGTCCAAGTCTAGATCCAGGTCTGCTTCCAGATCGCCCTCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133264 GATCTCGGTCCAAGTCTAGATCCAGGTCTGCTTCCAGATCGCCCTCCCGA

   1500     .    :    .    :    .
   1456 TCTAGATCTAGGTCCCACTCAAGGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||
 133314 TCTAGATCTAGGTCCCACTCAAGGTCC