seq1 = pF1KB5841.tfa, 1209 bp
seq2 = pF1KB5841/gi568815579r_4224136.tfa (gi568815579r:4224136_4438753), 214618 bp

>pF1KB5841 1209
>gi568815579r:4224136_4438753 (Chr19)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-174  (104710-104781)   100% ->
175-297  (104938-105060)   99% ->
298-354  (106676-106732)   100% ->
355-455  (108693-108793)   100% ->
456-590  (109945-110079)   100% ->
591-660  (111369-111438)   100% ->
661-763  (111528-111630)   100% ->
764-829  (111747-111812)   100% ->
830-979  (113209-113358)   100% ->
980-1072  (113446-113538)   100% ->
1073-1147  (114225-114299)   100% ->
1148-1209  (114557-114618)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCTGCCCTGAGGCCACCCCGTGTCCCCAAGCCTAAGGGTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCTGCCCTGAGGCCACCCCGTGTCCCCAAGCCTAAGGGTGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTTCACACTACTATGAGAGCTTTCTAGAGAAGAAGGGGCCCTGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTTCACACTACTATGAGAGCTTTCTAGAGAAGAAGGGGCCCTGTGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GG         GATTACAAGAAGTTCTGGGCAGGCCTGCAGGGTCTCACC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTA...TAGGATTACAAGAAGTTCTGGGCAGGCCTGCAGGGTCTCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTTATTTCTACAATAGCAATCGGGACTTCCAG         CACGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 104749 ATTTATTTCTACAATAGCAATCGGGACTTCCAGGTA...CAGCACGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAGCTCAACTTGGGAGCATTTGAGAAACTCACAGATGAGATTCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104946 GAAGCTCAACTTGGGAGCATTTGAGAAACTCACAGATGAGATTCCCTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAAGCTCACGTGACCCTGGCACCCACTTCAGCCTGATTCTCCGGAATCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 104996 GAAGCTCACGTGACCCTGGCACCCACTTCAGCCTGATTCTCCGGGATCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGATCAAGTTCAAG         GTAGAGACCTTGGAGTGTCGGGAAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105046 GAGATCAAGTTCAAGGTA...CAGGTAGAGACCTTGGAGTGTCGGGAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTGGAAAGGCTTCATCTTAACGGTGGTGGAG         CTCCGTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106702 GTGGAAAGGCTTCATCTTAACGGTGGTGGAGGTA...CAGCTCCGTGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CGACCGACTTGACCCTGCTTCCTGGGCACCTATACATGATGTCTGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108703 CGACCGACTTGACCCTGCTTCCTGGGCACCTATACATGATGTCTGAAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTGGCCAAAGAGGAGGCGCGCCGTGCACTGGAGACACCCTC         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 108753 TTGGCCAAAGAGGAGGCGCGCCGTGCACTGGAGACACCCTCGTG...CAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GTGCTTCCTGAAGGTGAGCCGGCTGGAGGCACAACTGCTCCTGGAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109945 GTGCTTCCTGAAGGTGAGCCGGCTGGAGGCACAACTGCTCCTGGAGCGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACCCCGAGTGCGGGAACCTGCTGCTGCGGCCCAGCGGGGACGGCGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109995 ACCCCGAGTGCGGGAACCTGCTGCTGCGGCCCAGCGGGGACGGCGCCGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGCGTGTCGGTCACCACGCGGCAGATGCACAACGG         GACGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110045 GGCGTGTCGGTCACCACGCGGCAGATGCACAACGGGTG...CAGGACGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CGTGGTCCGGCATTACAAGGTGAAGCGGGAGGGCCCCAAGTACGTGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111375 CGTGGTCCGGCATTACAAGGTGAAGCGGGAGGGCCCCAAGTACGTGATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATGTGGAACAGCCG         TTCTCTTGCACCTCCCTGGACGCCGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 111425 ATGTGGAACAGCCGGTG...CAGTTCTCTTGCACCTCCCTGGACGCCGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GTCAACTATTTCGTGTCGCATACCAAAAAGGCGCTGGTGCCATTCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111555 GTCAACTATTTCGTGTCGCATACCAAAAAGGCGCTGGTGCCATTCCTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGACGAGGACTACGAGAAGGTGCTAG         GCTACGTGGAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 111605 AGACGAGGACTACGAGAAGGTGCTAGGTG...CAGGCTACGTGGAAGCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATAAGGAGAATGGCGAGAATGTGTGGGTGGCGCCCTCCGCTCCGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111762 ATAAGGAGAATGGCGAGAATGTGTGGGTGGCGCCCTCCGCTCCGGGCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 G         GTCCTGCACCCTGCACAGGTGGCCCCAAGCCGCTGTCACC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111812 GGTG...CAGGTCCTGCACCCTGCACAGGTGGCCCCAAGCCGCTGTCACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TGCGTCTAGCCAGGACAAGCTGCCCCCACTGCCCCCACTACCGAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113249 TGCGTCTAGCCAGGACAAGCTGCCCCCACTGCCCCCACTACCGAACCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AAGAGAACTACGTGACCCCCATTGGAGATGGCCCAGCTGTTGACTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113299 AAGAGAACTACGTGACCCCCATTGGAGATGGCCCAGCTGTTGACTATGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AACCAAGATG         TGGCTTCCTCTAGTTGGCCAGTCATCCTGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 113349 AACCAAGATGGTG...CAGTGGCTTCCTCTAGTTGGCCAGTCATCCTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GCCAAAGAAGTTGCCAAAGCCTCCTGCCAAGCTTCCAAAGCCACCCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113477 GCCAAAGAAGTTGCCAAAGCCTCCTGCCAAGCTTCCAAAGCCACCCGTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GACCCAAGCCAG         AGCCCAAAGTCTTTAATGGTGGCTTGGGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113527 GACCCAAGCCAGGTT...CAGAGCCCAAAGTCTTTAATGGTGGCTTGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AGGAAGCTGCCAGTCAGTTCAGCCCAGCCTCTCTTCCCCACAGCCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 114254 AGGAAGCTGCCAGTCAGTTCAGCCCAGCCTCTCTTCCCCACAGCCGGTA.

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1148      GGCTGGCAGACATGACGGCAGAGCTACAGAAGAAGCTGGAGAAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114304 ..CAGGGCTGGCAGACATGACGGCAGAGCTACAGAAGAAGCTGGAGAAGA

   1300     .    :    .
   1193 GGCGGGCACTGGAGCAC
        |||||||||||||||||
 114602 GGCGGGCACTGGAGCAC