seq1 = pF1KB5822.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KB5822/gi568815592r_41584602.tfa (gi568815592r:41584602_41791329), 206728 bp

>pF1KB5822 1629
>gi568815592r:41584602_41791329 (Chr6)

(complement)

1-414  (99916-100329)   100% ->
415-669  (100413-100667)   100% ->
670-750  (101519-101599)   100% ->
751-871  (103302-103422)   100% ->
872-928  (103521-103577)   100% ->
929-1004  (104161-104236)   100% ->
1005-1152  (105093-105240)   100% ->
1153-1629  (106252-106728)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCAGCTGTCACCCGCTTGCTCAGTGACCTTGGGCAAATCTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99916 ATGTCTCAGCTGTCACCCGCTTGCTCAGTGACCTTGGGCAAATCTCTTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTCAGGGCTCGGTGTCTTCTCCTCTAAAATGGATGCGGTCCCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99966 CCTCTCAGGGCTCGGTGTCTTCTCCTCTAAAATGGATGCGGTCCCAGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCTGGCCTCCCCCTGCCAGCCCCTGTGCTTTGAGGAGGACACGTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 TTCTGGCCTCCCCCTGCCAGCCCCTGTGCTTTGAGGAGGACACGTGCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATATACCTGCTGCCCCTTCTCATCCACAGGGAGCCAGCGCCGGCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100066 ATATACCTGCTGCCCCTTCTCATCCACAGGGAGCCAGCGCCGGCAGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGGCGTCACGCATAGGGTTGCGCATGCAGCTCATGCGGGAGCAGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100116 CATGGCGTCACGCATAGGGTTGCGCATGCAGCTCATGCGGGAGCAGGCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAGGAGGAGCAGCGGGAGCGCATGCAGCAACAGGCTGTCATGCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100166 AGCAGGAGGAGCAGCGGGAGCGCATGCAGCAACAGGCTGTCATGCATTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCTCGGAGGGCCGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100216 ATGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCTCGGAGGGCCGCCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCGGCCATCAATACCCCCGTCCACTTCCAGTCGCCACCACCTGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100266 CCCGGCCATCAATACCCCCGTCCACTTCCAGTCGCCACCACCTGTGCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGAGGTGTTGAAG         GTGCAGTCCTACCTGGAGAATCCCACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100316 GGGAGGTGTTGAAGGTA...CAGGTGCAGTCCTACCTGGAGAATCCCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCCTACCATCTGCAGCAGTCGCAGCATCAGAAGGTGCGGGAGTACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100440 TCCTACCATCTGCAGCAGTCGCAGCATCAGAAGGTGCGGGAGTACCTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGAGACCTATGGGAACAAGTTTGCTGCCCACATCAGCCCAGCCCAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100490 CGAGACCTATGGGAACAAGTTTGCTGCCCACATCAGCCCAGCCCAGGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTCCGAAACCCCCACCAGCCGCCTCCCCAGGGGTGCGAGCTGGACACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100540 CTCCGAAACCCCCACCAGCCGCCTCCCCAGGGGTGCGAGCTGGACACGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTGTCCTCCTCCGCTGGCAACAGTGCTCCCAATAGCCCCATGGCCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100590 CTGTCCTCCTCCGCTGGCAACAGTGCTCCCAATAGCCCCATGGCCATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCACATTGGCTCCAACCCTGAGAGGGAG         TTGGATGATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100640 GCACATTGGCTCCAACCCTGAGAGGGAGGTG...CAGTTGGATGATGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTGACAACATTATGCGTCTGGACGATGTCCTTGGCTACATCAATCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101532 TTGACAACATTATGCGTCTGGACGATGTCCTTGGCTACATCAATCCTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATGCAGATGCCCAACACG         CTACCCCTGTCCAGCAGCCACCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101582 ATGCAGATGCCCAACACGGTA...CAGCTACCCCTGTCCAGCAGCCACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAATGTGTACAGCAGCGACCCCCAGGTCACAGCCTCCCTGGTGGGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103325 GAATGTGTACAGCAGCGACCCCCAGGTCACAGCCTCCCTGGTGGGCGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCAGCAGCTCCTGCCCTGCGGACCTGACCCAGAAGCGAGAGCTCACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103375 CCAGCAGCTCCTGCCCTGCGGACCTGACCCAGAAGCGAGAGCTCACAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    872        ATGCTGAGAGCAGGGCCCTGGCCAAGGAGCGGCAGAAGAAAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103425 A...CAGATGCTGAGAGCAGGGCCCTGGCCAAGGAGCGGCAGAAGAAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAATCACAACTTAA         TTGAAAGGAGACGAAGGTTCAACATCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103564 CAATCACAACTTAAGTG...TAGTTGAAAGGAGACGAAGGTTCAACATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATGACCGCATCAAGGAGTTGGGAATGCTGATCCCCAAGGCCAATGACCT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104188 ATGACCGCATCAAGGAGTTGGGAATGCTGATCCCCAAGGCCAATGACCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1005         GGACGTGCGCTGGAACAAGGGCACCATCCTCAAGGCCTCTGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104238 TG...CAGGGACGTGCGCTGGAACAAGGGCACCATCCTCAAGGCCTCTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGATTACATCCGGAGGATGCAGAAGGACCTGCAAAAGTCCAGGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105135 GGATTACATCCGGAGGATGCAGAAGGACCTGCAAAAGTCCAGGGAGCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AGAACCACTCTCGCCGCCTGGAGATGACCAACAAGCAGCTCTGGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105185 AGAACCACTCTCGCCGCCTGGAGATGACCAACAAGCAGCTCTGGCTCCGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATCCAG         GAGCTGGAGATGCAGGCTCGAGTGCACGGCCTCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105235 ATCCAGGTC...CAGGAGCTGGAGATGCAGGCTCGAGTGCACGGCCTCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TACCACCTCCCCGTCCGGCATGAACATGGCTGAGCTGGCCCAGCAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106287 TACCACCTCCCCGTCCGGCATGAACATGGCTGAGCTGGCCCAGCAGGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGAAGCAGGAGCTGCCTAGCGAAGAGGGCCCAGGGGAGGCCCTGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106337 TGAAGCAGGAGCTGCCTAGCGAAGAGGGCCCAGGGGAGGCCCTGATGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GGGGCTGAGGTCCCTGACCCTGAGCCACTGCCAGCTCTGCCCCCGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106387 GGGGCTGAGGTCCCTGACCCTGAGCCACTGCCAGCTCTGCCCCCGCAAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CCCGCTGCCCCTGCCCACCCAGCCACCGTCCCCATTCCATCACCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 106437 CCCGCTGCCCCTGCCCACCCAGCCACCATCCCCATTCCATCACCTGGACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TCAGCCACAGCCTGAGCTTTGGGGGCAGGGAGGACGAGGGTCCCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106487 TCAGCCACAGCCTGAGCTTTGGGGGCAGGGAGGACGAGGGTCCCCCGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TACCCCGAACCCCTGGCACCGGGGCATGGCTCCCCATTCCCCAGCCTGTC
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 106537 TACCCCGAACCCCTGGCGCCGGGGCATGGCTCCCCATTCCCCAGCCTGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CAAGAAGGATCTGGACCTCATGCTCCTGGACGACTCACTGCTACCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106587 CAAGAAGGATCTGGACCTCATGCTCCTGGACGACTCACTGCTACCGCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCTCTGATCCACTTCTGTCCACCATGTCCCCCGAGGCCTCCAAGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106637 CCTCTGATCCACTTCTGTCCACCATGTCCCCCGAGGCCTCCAAGGCCAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 AGCCGCCGGAGCAGCTTCAGCATGGAGGAGGGCGATGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106687 AGCCGCCGGAGCAGCTTCAGCATGGAGGAGGGCGATGTGCTG