seq1 = pF1KB5817.tfa, 636 bp
seq2 = pF1KB5817/gi568815584r_102248560.tfa (gi568815584r:102248560_102459589), 211030 bp

>pF1KB5817 636
>gi568815584r:102248560_102459589 (Chr14)

(complement)

1-176  (99998-100171)   98% ->
177-306  (103693-103822)   100% ->
307-436  (109542-109671)   100% ->
437-636  (110831-111030)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCAAAGACTCTTGGAACTGTAACGCCCAGAAAACCTGTCTTATC
        || -|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 ATC A GCAAAGACTCTTGGAACTGTAACGCCCAGAAAACCTGTCTTATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCAGTGCAAGAAAAATTAAGGACAATGCGGCTGATTGGCACAATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100046 TGTCAGTGCAAGAAAAATTAAGGACAATGCGGCTGATTGGCACAATTTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTGAAGTGGGAAACCCTCAATGATGCAGGTTTTACCACTGCAAATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100096 TCCTGAAGTGGGAAACCCTCAATGATGCAGGTTTTACCACTGCAAATAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGCCAACTTGAAAATCAGTTTATT         GAATAAAGACAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100146 ATTGCCAACTTGAAAATCAGTTTATTGTA...TAGGAATAAAGACAAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAACTAGACAGCAGCAGCCCAGCCTCGAAGGAAAATGAAGAAAAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103708 AGAACTAGACAGCAGCAGCCCAGCCTCGAAGGAAAATGAAGAAAAGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTCTGGAATATAACGAGGAACTGGAGAAGCTGTGTGAGGAACTGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103758 GTCTGGAATATAACGAGGAACTGGAGAAGCTGTGTGAGGAACTGCAGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCTTGGATGGGTTG         ACCAAAATACAGGTGAAAATGGAAAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103808 ACCTTGGATGGGTTGGTA...CAGACCAAAATACAGGTGAAAATGGAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTGTCTTCAACTACCAAGGGAATTTGTGAACTAGAAAACTACCATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109568 GCTGTCTTCAACTACCAAGGGAATTTGTGAACTAGAAAACTACCATTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGAGGAGAGTAAACGACCCCCTCTGTTCCACACGTGGCCTACAACCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109618 GGGAGGAGAGTAAACGACCCCCTCTGTTCCACACGTGGCCTACAACCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTCT         ATGAGGTTTCGCATAAGCTCTTGGAGATGTACAGGAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109668 TTCTGTA...CAGATGAGGTTTCGCATAAGCTCTTGGAGATGTACAGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAGCTGCTCCTGAAGCGCACGGTGGCCAAGGAGCTTGCCCACACCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110868 GGAGCTGCTCCTGAAGCGCACGGTGGCCAAGGAGCTTGCCCACACCGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCCCGACCTCACCCTGAGCTACCTGTCCATGTGGCTGCACCAGCCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110918 ATCCCGACCTCACCCTGAGCTACCTGTCCATGTGGCTGCACCAGCCCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTGGAGAGCGACAGCAGGCTGCATCTGGAGAGCATGCTGCTGGAGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110968 GTGGAGAGCGACAGCAGGCTGCATCTGGAGAGCATGCTGCTGGAGACAGG

    650     .    :
    624 CCACCGAGCTCTC
        |||||||||||||
 111018 CCACCGAGCTCTC