seq1 = pF1KB5776.tfa, 2298 bp
seq2 = pF1KB5776/gi568815591r_140634600.tfa (gi568815591r:140634600_141024703), 390104 bp

>pF1KB5776 2298
>gi568815591r:140634600_141024703 (Chr7)

(complement)

1-138  (100001-100138)   100% ->
139-240  (174492-174593)   100% ->
241-504  (189832-190095)   100% ->
505-608  (215709-215812)   100% ->
609-711  (216642-216744)   100% ->
712-860  (223144-223292)   100% ->
861-980  (224223-224342)   100% ->
981-1140  (230237-230396)   100% ->
1141-1177  (237120-237156)   100% ->
1178-1314  (241547-241683)   100% ->
1315-1432  (243011-243128)   100% ->
1433-1517  (246629-246713)   100% ->
1518-1694  (247616-247792)   100% ->
1695-1741  (270471-270517)   100% ->
1742-1860  (271311-271429)   100% ->
1861-1992  (275286-275417)   100% ->
1993-2127  (284758-284892)   100% ->
2128-2298  (289934-290104)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCTGAGCGGTGGCGGTGGTGGCGGCGCGGAGCCGGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGCTGAGCGGTGGCGGTGGTGGCGGCGCGGAGCCGGGCCAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGTTCAACGGGGACATGGAGCCCGAGGCCGGCGCCGGCGCCGGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGTTCAACGGGGACATGGAGCCCGAGGCCGGCGCCGGCGCCGGCGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCTGCCATTCCGGAGGAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100101 CGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCTGCCATTCCGGAGGAGGTG...TAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGAATATCAAACAAATGATTAAGTTGACACAGGAACATATAGAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174495 TGGAATATCAAACAAATGATTAAGTTGACACAGGAACATATAGAGGCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTGGACAAATTTGGTGGGGAGCATAATCCACCATCAATATATCTGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 174545 ATTGGACAAATTTGGTGGGGAGCATAATCCACCATCAATATATCTGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241         GCCTATGAAGAATACACCAGCAAGCTAGATGCACTCCAACAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174595 TA...TAGGCCTATGAAGAATACACCAGCAAGCTAGATGCACTCCAACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGAGAACAACAGTTATTGGAATCTCTGGGGAACGGAACTGATTTTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189874 AGAGAACAACAGTTATTGGAATCTCTGGGGAACGGAACTGATTTTTCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCTAGCTCTGCATCAATGGATACCGTTACATCTTCTTCCTCTTCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189924 TTCTAGCTCTGCATCAATGGATACCGTTACATCTTCTTCCTCTTCTAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTTCAGTGCTACCTTCATCTCTTTCAGTTTTTCAAAATCCCACAGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189974 TTTCAGTGCTACCTTCATCTCTTTCAGTTTTTCAAAATCCCACAGATGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCACGGAGCAACCCCAAGTCACCACAAAAACCTATCGTTAGAGTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190024 GCACGGAGCAACCCCAAGTCACCACAAAAACCTATCGTTAGAGTCTTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCCCAACAAACAGAGGACAGTG         GTACCTGCAAGGTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 190074 GCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTG...TAGGTACCTGCAAGGTGTGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTACAGTCCGAGACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215728 TTACAGTCCGAGACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTAATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCAGAGTGCTGTGCTGTTTACAGAATTCAGGATGG         AGAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 215778 CCAGAGTGCTGTGCTGTTTACAGAATTCAGGATGGGTA...CAGAGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAACCAATTGGTTGGGACACTGATATTTCCTGGCTTACTGGAGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216648 GAAACCAATTGGTTGGGACACTGATATTTCCTGGCTTACTGGAGAAGAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCATGTGGAAGTGTTGGAGAATGTTCCACTTACAACACACAACTTT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 216698 TGCATGTGGAAGTGTTGGAGAATGTTCCACTTACAACACACAACTTTGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    712       GTACGAAAAACGTTTTTCACCTTAGCATTTTGTGACTTTTGTCG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216748 ...CAGGTACGAAAAACGTTTTTCACCTTAGCATTTTGTGACTTTTGTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AAAGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGCTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223188 AAAGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGCTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACCAGCGTTGTAGTACAGAAGTTCCACTGATGTGTGTTAATTATGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223238 ACCAGCGTTGTAGTACAGAAGTTCCACTGATGTGTGTTAATTATGACCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTTGA         TTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGAACACCACCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223288 CTTGAGTA...CAGTTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGAACACCACCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AATACCACAGGAAGAGGCGTCCTTAGCAGAGACTGCCCTAACATCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224259 AATACCACAGGAAGAGGCGTCCTTAGCAGAGACTGCCCTAACATCTGGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CATCCCCTTCCGCACCCGCCTCGGACTCTATTGG         GCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 224309 CATCCCCTTCCGCACCCGCCTCGGACTCTATTGGGTA...CAGGCCCCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATTCTCACCAGTCCGTCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230244 ATTCTCACCAGTCCGTCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCGACCAGCAGATGAAGATCATCGAAATCAATTTGGGCAACGAGACCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230294 CCGACCAGCAGATGAAGATCATCGAAATCAATTTGGGCAACGAGACCGAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCTCATCAGCTCCCAATGTGCATATAAACACAATAGAACCTGTCAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230344 CCTCATCAGCTCCCAATGTGCATATAAACACAATAGAACCTGTCAATATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAT         GACTTGATTAGAGACCAAGGATTTCGTGGTGATGGAG 
        |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 230394 GATGTA...TAGGACTTGATTAGAGACCAAGGATTTCGTGGTGATGGAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1178         GATCAACCACAGGTTTGTCTGCTACCCCCCCTGCCTCATTAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237158 TA...TAGGATCAACCACAGGTTTGTCTGCTACCCCCCCTGCCTCATTAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CTGGCTCACTAACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTCCAGGACCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241589 CTGGCTCACTAACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTCCAGGACCTCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CGAGAAAGGAAGTCATCTTCATCCTCAGAAGACAGGAATCGAATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 241639 CGAGAAAGGAAGTCATCTTCATCCTCAGAAGACAGGAATCGAATGGTA..

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315     AAAACACTTGGTAGACGGGACTCGAGTGATGATTGGGAGATTCCTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241689 .AAGAAAACACTTGGTAGACGGGACTCGAGTGATGATTGGGAGATTCCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATGGGCAGATTACAGTGGGACAAAGAATTGGATCTGGATCATTTGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243057 ATGGGCAGATTACAGTGGGACAAAGAATTGGATCTGGATCATTTGGAACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTCTACAAGGGAAAGTGGCATG         GTGATGTGGCAGTGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 243107 GTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTA...TAGGTGATGTGGCAGTGAAAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GTTGAATGTGACAGCACCTACACCTCAGCAGTTACAAGCCTTCAAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246648 GTTGAATGTGACAGCACCTACACCTCAGCAGTTACAAGCCTTCAAAAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AAGTAGGAGTACTCAG         GAAAACACGACATGTGAATATCCTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 246698 AAGTAGGAGTACTCAGGTG...CAGGAAAACACGACATGTGAATATCCTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CTCTTCATGGGCTATTCCACAAAGCCACAACTGGCTATTGTTACCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247641 CTCTTCATGGGCTATTCCACAAAGCCACAACTGGCTATTGTTACCCAGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GTGTGAGGGCTCCAGCTTGTATCACCATCTCCATATCATTGAGACCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247691 GTGTGAGGGCTCCAGCTTGTATCACCATCTCCATATCATTGAGACCAAAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TTGAGATGATCAAACTTATAGATATTGCACGACAGACTGCACAGGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247741 TTGAGATGATCAAACTTATAGATATTGCACGACAGACTGCACAGGGCATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GA         TTACTTACACGCCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247791 GAGTA...CAGTTACTTACACGCCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GAGTAATA         ATATATTTCTTCATGAAGACCTCACAGTAAAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 270510 GAGTAATAGTA...CAGATATATTTCTTCATGAAGACCTCACAGTAAAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TAGGTGATTTTGGTCTAGCTACAGTGAAATCTCGATGGAGTGGGTCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271344 TAGGTGATTTTGGTCTAGCTACAGTGAAATCTCGATGGAGTGGGTCCCAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CAGTTTGAACAGTTGTCTGGATCCATTTTGTGGATG         GCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 271394 CAGTTTGAACAGTTGTCTGGATCCATTTTGTGGATGGTA...CAGGCACC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 AGAAGTCATCAGAATGCAAGATAAAAATCCATACAGCTTTCAGTCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275291 AGAAGTCATCAGAATGCAAGATAAAAATCCATACAGCTTTCAGTCAGATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TATATGCATTTGGAATTGTTCTGTATGAATTGATGACTGGACAGTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275341 TATATGCATTTGGAATTGTTCTGTATGAATTGATGACTGGACAGTTACCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 TATTCAAACATCAACAACAGGGACCAG         ATAATTTTTATGGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 275391 TATTCAAACATCAACAACAGGGACCAGGTA...CAGATAATTTTTATGGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 GGGACGAGGATACCTGTCTCCAGATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284772 GGGACGAGGATACCTGTCTCCAGATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CAAAAGCCATGAAGAGATTAATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284822 CAAAAGCCATGAAGAGATTAATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGAGAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GAGAGACCACTCTTTCCCCAA         ATTCTCGCCTCTATTGAGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 284872 GAGAGACCACTCTTTCCCCAAGTA...TAGATTCTCGCCTCTATTGAGCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 GCTGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCGCAGTGCATCAGAACCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289954 GCTGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCGCAGTGCATCAGAACCCTCCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TGAATCGGGCTGGTTTCCAAACAGAGGATTTTAGTCTATATGCTTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 290004 TGAATCGGGCTGGTTTCCAAACAGAGGATTTTAGTCTATATGCTTGTGCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TCTCCAAAAACACCCATCCAGGCAGGGGGATATGGTGCGTTTCCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 290054 TCTCCAAAAACACCCATCCAGGCAGGGGGATATGGTGCGTTTCCTGTCCA

   2450 
   2298 C
        |
 290104 C