seq1 = pF1KB5772.tfa, 2286 bp
seq2 = pF1KB5772/gi568815594r_80989711.tfa (gi568815594r:80989711_81305047), 315337 bp

>pF1KB5772 2286
>gi568815594r:80989711_81305047 (Chr4)

(complement)

1-461  (100001-100461)   100% ->
462-628  (130089-130255)   100% ->
629-742  (133244-133357)   100% ->
743-848  (135280-135385)   100% ->
849-912  (137824-137887)   100% ->
913-990  (151327-151404)   100% ->
991-1085  (152994-153088)   100% ->
1086-1154  (156096-156164)   100% ->
1155-1253  (160718-160816)   100% ->
1254-1407  (162101-162254)   100% ->
1408-1544  (164379-164515)   100% ->
1545-1634  (167566-167655)   100% ->
1635-1776  (169752-169893)   100% ->
1777-1940  (194437-194600)   100% ->
1941-2063  (199113-199235)   100% ->
2064-2126  (200616-200678)   100% ->
2127-2193  (212596-212662)   100% ->
2194-2286  (215245-215337)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAATGGTTCAGTGAAACCTAAACATTCTAAGCACCCAGATGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAATGGTTCAGTGAAACCTAAACATTCTAAGCACCCAGATGGACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTGGGAACCTCACCACTGATGCTCTGCGGAACAAGGTGACAGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTGGGAACCTCACCACTGATGCTCTGCGGAACAAGGTGACAGAGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGAGAGTTGAGGAGGAAGGATGCTGAGATCCAGGAGCGGGAGTACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAGAGAGTTGAGGAGGAAGGATGCTGAGATCCAGGAGCGGGAGTACCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGAAGGAGCTGCGGGAGCAGCTGTCGAAGCAGACTGTGGCCATTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGAAGGAGCTGCGGGAGCAGCTGTCGAAGCAGACTGTGGCCATTGCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTCACAGAGGAGCTCCAGAACAAGTGCATCCAGCTGAACAAGCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTCACAGAGGAGCTCCAGAACAAGTGCATCCAGCTGAACAAGCTGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGTGGTGCATATGCAGGGAGGAAGCCCGCTTCAGGCCTCTCCAGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGTGGTGCATATGCAGGGAGGAAGCCCGCTTCAGGCCTCTCCAGATAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCCTCTTGAGGTCCACCGGAAGACCTCTGGATTGGTCTCTCTCCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCCTCTTGAGGTCCACCGGAAGACCTCTGGATTGGTCTCTCTCCATAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGGAGGGGAGCAAAGGCTGGCGTGTCTGCTGAGCCAACAACCCGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGGAGGGGAGCAAAGGCTGGCGTGTCTGCTGAGCCAACAACCCGGACCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGACCTGAACAAACCCCCTGAATTTTCCTTTGAGAAAGCAAGAGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGACCTGAACAAACCCCCTGAATTTTCCTTTGAGAAAGCAAGAGTCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAAGACTCCAG         TGAGAAGAAGCTCATTACAGATGCCCTTAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAAGACTCCAGGTA...CAGTGAGAAGAAGCTCATTACAGATGCCCTTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TAAAAATCAGTTTCTGAAAAGACTGGATCCTCAGCAGATCAAAGACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130119 TAAAAATCAGTTTCTGAAAAGACTGGATCCTCAGCAGATCAAAGACATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGGAATGCATGTATGGGAGAAACTATCAGCAAGGGAGTTACATTATTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130169 TGGAATGCATGTATGGGAGAAACTATCAGCAAGGGAGTTACATTATTAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAAGGAGAACCAGGAAACCATATCTTTGTGCTGGCAG         AGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 130219 CAAGGAGAACCAGGAAACCATATCTTTGTGCTGGCAGGTG...TAGAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCGACTAGAGGTGTTCCAAGGGGAGAAATTGCTGTCCTCCATCCCTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133248 TCGACTAGAGGTGTTCCAAGGGGAGAAATTGCTGTCCTCCATCCCTATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GGACCACATTTGGGGAGCTTGCCATTTTATACAATTGTACAAGGACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133298 GGACCACATTTGGGGAGCTTGCCATTTTATACAATTGTACAAGGACTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCTGTGAAAG         CTATTACCAATGTTAAAACATGGGCACTAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 133348 TCTGTGAAAGGTA...AAGCTATTACCAATGTTAAAACATGGGCACTAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCGAGAGGTATTCCAGAATATAATGAGGAGGACAGCCCAAGCTAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135311 TCGAGAGGTATTCCAGAATATAATGAGGAGGACAGCCCAAGCTAGAGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AACAATACAGAAACTTCCTCAGAAG         TGTATCCTTGCTGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 135361 AACAATACAGAAACTTCCTCAGAAGGTA...AAGTGTATCCTTGCTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AATTTACCTGAAGATAAATTAACCAAGATCATTGACTGCTTGGAAGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 137840 AATTTACCTGAAGATAAATTAACCAAGATCATTGACTGCTTGGAAGTGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    913        GAATACTATGACAAAGGAGATTACATCATTAGAGAGGGCGAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137890 A...CAGGAATACTATGACAAAGGAGATTACATCATTAGAGAGGGCGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AAGGAAGTACCTTTTTCATTTTGGCAAAAGGAAAG         GTAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 151370 AAGGAAGTACCTTTTTCATTTTGGCAAAAGGAAAGGTA...TAGGTAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTAACACAGAGCACAGAAGGCCATGATCAACCACAGCTGATAAAAACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153000 GTAACACAGAGCACAGAAGGCCATGATCAACCACAGCTGATAAAAACACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCAGAAAGGAGAATACTTTGGAGAAAAAGCTCTTATCAG         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 153050 GCAGAAAGGAGAATACTTTGGAGAAAAAGCTCTTATCAGGTG...CAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGATGTCAGGTCAGCTAACATTATTGCTGAAGAAAATGATGTTGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156098 ATGATGTCAGGTCAGCTAACATTATTGCTGAAGAAAATGATGTTGCATGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTGGTTATAGATCGAGA         AACATTCAACCAAACTGTCGGTAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 156148 CTGGTTATAGATCGAGAGTG...TAGAACATTCAACCAAACTGTCGGTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ATTTGAAGAGCTGCAAAAATACCTTGAAGGATATGTGGCAAACCTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160742 ATTTGAAGAGCTGCAAAAATACCTTGAAGGATATGTGGCAAACCTGAACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTGATGATGAAAAAAGACATGCGAA         GCGGTCCATGTCTAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 160792 GTGATGATGAAAAAAGACATGCGAAGTA...CAGGCGGTCCATGTCTAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TGGAAGCTGTCCAAAGCACTCTCTCTGGAAATGATTCAGCTGAAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162117 TGGAAGCTGTCCAAAGCACTCTCTCTGGAAATGATTCAGCTGAAGGAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGTGGCCAGATTTTCCTCATCATCCCCATTCCAGAACCTTGAGATTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162167 GGTGGCCAGATTTTCCTCATCATCCCCATTCCAGAACCTTGAGATTATTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CAACACTGGGCGTTGGTGGGTTCGGAAGAGTTGAGCTT         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 162217 CAACACTGGGCGTTGGTGGGTTCGGAAGAGTTGAGCTTGTA...TAGGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AAAGTAAAAAATGAGAATGTTGCTTTTGCTATGAAGTGTATAAGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164382 AAAGTAAAAAATGAGAATGTTGCTTTTGCTATGAAGTGTATAAGGAAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GCACATAGTTGACACCAAGCAGCAGGAGCATGTCTACTCAGAGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164432 GCACATAGTTGACACCAAGCAGCAGGAGCATGTCTACTCAGAGAAGAGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TCCTAGAGGAGCTGTGCTCTCCATTCATTGTGAA         ATTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 164482 TCCTAGAGGAGCTGTGCTCTCCATTCATTGTGAAGTA...CAGATTATAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CGTACTTTCAAGGACAATAAGTATGTATACATGCTTCTGGAGGCCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167573 CGTACTTTCAAGGACAATAAGTATGTATACATGCTTCTGGAGGCCTGCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AGGTGGGGAGCTCTGGAGTATATTAAGGGACAG         AGGCAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 167623 AGGTGGGGAGCTCTGGAGTATATTAAGGGACAGGTA...CAGAGGCAGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TTGATGAACCCACCTCCAAATTCTGCGTTGCTTGTGTGACAGAAGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169760 TTGATGAACCCACCTCCAAATTCTGCGTTGCTTGTGTGACAGAAGCATTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GATTACCTGCATCGACTAGGTATTATCTACAGAGACTTGAAACCAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169810 GATTACCTGCATCGACTAGGTATTATCTACAGAGACTTGAAACCAGAAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CTTAATTCTAGATGCTGAGGGTTACCTTAAATTG         GTTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 169860 CTTAATTCTAGATGCTGAGGGTTACCTTAAATTGGTA...CAGGTTGACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TTGGATTTGCGAAGAAAATAGGGTCTGGACAGAAAACATGGACATTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194444 TTGGATTTGCGAAGAAAATAGGGTCTGGACAGAAAACATGGACATTCTGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GGGACTCCAGAATATGTAGCTCCTGAAGTCATTCTCAACAAGGGACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194494 GGGACTCCAGAATATGTAGCTCCTGAAGTCATTCTCAACAAGGGACATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CTTCAGTGTGGATTTCTGGTCACTGGGAATTCTAGTGTATGAGCTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194544 CTTCAGTGTGGATTTCTGGTCACTGGGAATTCTAGTGTATGAGCTCCTAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CGGGCAA         CCCACCCTTTTCTGGGGTTGACCAAATGATGACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194594 CGGGCAAGTA...TAGCCCACCCTTTTCTGGGGTTGACCAAATGATGACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TACAATTTGATTCTCAAAGGAATTGAAAAAATGGATTTTCCCAGGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199147 TACAATTTGATTCTCAAAGGAATTGAAAAAATGGATTTTCCCAGGAAGAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 AACACGACGACCTGAGGATTTGATTCGGAGGCTTTGCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 199197 AACACGACGACCTGAGGATTTGATTCGGAGGCTTTGCAGGTG...TAGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AAAATCCAACAGAAAGGCTGGGAAATCTGAAGAATGGAATAAATGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200618 AAAATCCAACAGAAAGGCTGGGAAATCTGAAGAATGGAATAAATGACATT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AAGAAACACAG         GTGGTTAAATGGTTTTAATTGGGAGGGACT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 200668 AAGAAACACAGGTA...CAGGTGGTTAAATGGTTTTAATTGGGAGGGACT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 GAAAGCACGGAGCCTTCCATCACCTTTGCAAAGAGAG         CTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 212626 GAAAGCACGGAGCCTTCCATCACCTTTGCAAAGAGAGGTA...TAGCTCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 AGGGACCCATAGATCACAGCTACTTTGACAAATATCCTCCTGAAAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215249 AGGGACCCATAGATCACAGCTACTTTGACAAATATCCTCCTGAAAAGGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .
   2248 ATGCCTCCAGATGAGCTATCAGGCTGGGATAAAGACTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215299 ATGCCTCCAGATGAGCTATCAGGCTGGGATAAAGACTTC