seq1 = pF1KB5767.tfa, 2436 bp
seq2 = pF1KB5767/gi568815587r_64689540.tfa (gi568815587r:64689540_64903149), 213610 bp

>pF1KB5767 2436
>gi568815587r:64689540_64903149 (Chr11)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-154  (100208-100265)   100% ->
155-245  (100497-100587)   100% ->
246-310  (100667-100731)   100% ->
311-366  (101029-101084)   100% ->
367-414  (101393-101440)   100% ->
415-457  (101529-101571)   100% ->
458-530  (101967-102039)   100% ->
531-662  (102119-102250)   100% ->
663-725  (102324-102386)   100% ->
726-807  (102758-102839)   100% ->
808-915  (102934-103041)   100% ->
916-994  (103467-103545)   100% ->
995-1053  (103671-103729)   100% ->
1054-1097  (104313-104356)   100% ->
1098-1136  (105486-105524)   100% ->
1137-1170  (105616-105649)   100% ->
1171-1276  (105770-105875)   100% ->
1277-1341  (105982-106046)   100% ->
1342-1383  (106127-106168)   100% ->
1384-1468  (106257-106341)   100% ->
1469-1548  (106437-106516)   100% ->
1549-1609  (106597-106657)   100% ->
1610-1727  (106760-106877)   100% ->
1728-1786  (110728-110786)   100% ->
1787-1890  (110875-110978)   99% ->
1891-2068  (111064-111241)   100% ->
2069-2137  (112688-112756)   100% ->
2138-2224  (112876-112962)   100% ->
2225-2295  (113191-113261)   100% ->
2296-2351  (113365-113420)   100% ->
2352-2436  (113526-113610)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTGCTGCGGGATGTGTCGCTGCAGGACCCGCGGGACCGCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTGCTGCGGGATGTGTCGCTGCAGGACCCGCGGGACCGCTTCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCAGCGCGTGGGGGCCGGGACCTATGGCGACGTCTACAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 GCTGCTGCAGCGCGTGGGGGCCGGGACCTATGGCGACGTCTACAAGGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GCCCGCGACACGGTCACGTCCGAACTGGCCGCCGTGAAGATAGTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGGCCCGCGACACGGTCACGTCCGAACTGGCCGCCGTGAAGATAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGCTAGACCCAG         GGGACGACATCAGCTCCCTCCAGCAGGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100253 AAGCTAGACCCAGGTG...CAGGGGACGACATCAGCTCCCTCCAGCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AATCACCATCCTGCGTGAGTGCCGCCACCCCAATGTGGTGGCCTACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100525 AATCACCATCCTGCGTGAGTGCCGCCACCCCAATGTGGTGGCCTACATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAGCTACCTCAG         GAATGACCGCTTGTGGATCTGCATGGAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100575 GCAGCTACCTCAGGTG...TAGGAATGACCGCTTGTGGATCTGCATGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTCTGCGGAGGGGGCTCCCTGCAGGAGATTTACCATG         CCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100695 TTCTGCGGAGGGGGCTCCCTGCAGGAGATTTACCATGGTG...CAGCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGGGCCCCTGGAGGAGCGGCAGATTGCCTACGTCTGCCGAGAGGCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101033 TGGGCCCCTGGAGGAGCGGCAGATTGCCTACGTCTGCCGAGAGGCACTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AG         GGGCTCCACCACCTGCATTCTCAGGGGAAGATCCACAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101083 AGGTA...CAGGGGCTCCACCACCTGCATTCTCAGGGGAAGATCCACAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GACATCAAG         GGAGCCAACCTTCTCCTCACTCTCCAGGGAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101432 GACATCAAGGTA...CAGGGAGCCAACCTTCTCCTCACTCTCCAGGGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TGTCAAACTGG         CTGACTTTGGGGTGTCAGGCGAGCTGACAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101561 TGTCAAACTGGGTC...CAGCTGACTTTGGGGTGTCAGGCGAGCTGACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 CGTCTGTGGCCAAGAGGAGGTCTTTCATTGGGACTCCCTACTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101997 CGTCTGTGGCCAAGAGGAGGTCTTTCATTGGGACTCCCTACTGGTG...T

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    531   GATGGCTCCCGAGGTGGCTGCTGTGGAGCGCAAAGGTGGCTACAATGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102117 AGGATGGCTCCCGAGGTGGCTGCTGTGGAGCGCAAAGGTGGCTACAATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 GCTATGTGACGTCTGGGCCCTGGGCATCACTGCCATTGAGCTGGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102167 GCTATGTGACGTCTGGGCCCTGGGCATCACTGCCATTGAGCTGGGCGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 TGCAGCCCCCTCTGTTCCACCTGCACCCCATGAG         GGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102217 TGCAGCCCCCTCTGTTCCACCTGCACCCCATGAGGTC...CAGGGCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670 ATGCTCATGTCGAAGAGCAGCTTCCAGCCGCCCAAACTGAGAGATAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102331 ATGCTCATGTCGAAGAGCAGCTTCCAGCCGCCCAAACTGAGAGATAAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 TCGCTG         GACCCAGAATTTCCACCACTTTCTCAAACTGGCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102381 TCGCTGGTA...TAGGACCCAGAATTTCCACCACTTTCTCAAACTGGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761 TGACCAAGAATCCTAAGAAGAGGCCGACAGCAGAGAAGCTCCTGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102793 TGACCAAGAATCCTAAGAAGAGGCCGACAGCAGAGAAGCTCCTGCAGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    808       CACCCGTTCACGACTCAGCAGCTCCCTCGGGCCCTCCTCACACA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102843 ...CAGCACCCGTTCACGACTCAGCAGCTCCCTCGGGCCCTCCTCACACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    852 GCTGCTGGACAAAGCCAGTGACCCTCATCTGGGGACCCCCTCCCCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102978 GCTGCTGGACAAAGCCAGTGACCCTCATCTGGGGACCCCCTCCCCTGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 ACTGTGAGCTGGAG         ACCTATGACATGTTTCCAGACACCATT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103028 ACTGTGAGCTGGAGGTA...TAGACCTATGACATGTTTCCAGACACCATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    943 CACTCCCGGGGGCAGCACGGCCCAGCCGAGAGGACCCCCTCGGAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103494 CACTCCCGGGGGCAGCACGGCCCAGCCGAGAGGACCCCCTCGGAGATCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    993 GT         TTCACCAGGTGAAATTTGGCGCCCCACGCAGGAAGGAAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103544 GTGTG...CAGTTCACCAGGTGAAATTTGGCGCCCCACGCAGGAAGGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1034 CTGACCCACTGAATGAGCCG         TGGGAGGAAGAGTGGACACTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103710 CTGACCCACTGAATGAGCCGGTG...CAGTGGGAGGAAGAGTGGACACTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075 CTGGGAAAGGAAGAGTTGAGTGG         GAGCCTGCTGCAGTCGGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104334 CTGGGAAAGGAAGAGTTGAGTGGGTA...CAGGAGCCTGCTGCAGTCGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1116 CCAGGAGGCCCTGGAGGAAAG         GAGTCTGACTATTCGGTCAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105504 CCAGGAGGCCCTGGAGGAAAGGTG...CAGGAGTCTGACTATTCGGTCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1157 CCTCAGAATTCCAG         GAGCTGGACTCCCCAGACGATACCATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105636 CCTCAGAATTCCAGGTG...CAGGAGCTGGACTCCCCAGACGATACCATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1198 GGAACCATCAAGCGGGCCCCGTTCCTAGGGCCACTCCCCACTGACCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105797 GGAACCATCAAGCGGGCCCCGTTCCTAGGGCCACTCCCCACTGACCCTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1248 AGCAGAGGAGCCTCTGTCCAGTCCCCCAG         GCCCCAACAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 105847 AGCAGAGGAGCCTCTGTCCAGTCCCCCAGGTG...CAGGCCCCAACAGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1289 CCCCACTGCTGCCCACGGCCTGGGCCACCATGAAGCAGCGGGAGGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105994 CCCCACTGCTGCCCACGGCCTGGGCCACCATGAAGCAGCGGGAGGATCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1339 GAG         AGGTCATCCTGCCACGGGCTCCCCCCAACTCCCAAGGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106044 GAGGTA...CAGAGGTCATCCTGCCACGGGCTCCCCCCAACTCCCAAGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1380 GCAT         ATGGGCGCCTGCTTCTCCAAGGTCTTCAATGGCTGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106165 GCATGTA...CAGATGGGCGCCTGCTTCTCCAAGGTCTTCAATGGCTGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1421 CCCTGCGGATCCACGCTGCTGTCACCTGGATTCACCCTGTTACTCGGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106294 CCCTGCGGATCCACGCTGCTGTCACCTGGATTCACCCTGTTACTCGGGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1469        ACCAGTTCCTGGTGGTAGGGGCCGAGGAAGGCATCTACACACT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106344 A...CAGACCAGTTCCTGGTGGTAGGGGCCGAGGAAGGCATCTACACACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1512 CAACCTGCATGAACTGCATGAGGATACGCTGGAGAAG         CTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 106480 CAACCTGCATGAACTGCATGAGGATACGCTGGAGAAGGTG...CAGCTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1553 TTTCACATCGCTGCTCCTGGCTCTACTGCGTGAACAACGTGCTGCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106601 TTTCACATCGCTGCTCCTGGCTCTACTGCGTGAACAACGTGCTGCTGTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1603 CTCTCAG         GGAAATCCACGCACATCTGGGCCCATGACCTCCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106651 CTCTCAGGTA...CAGGGAAATCCACGCACATCTGGGCCCATGACCTCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1644 AGGCCTGTTTGAGCAGCGGAGGCTACAGCAACAGGTTCCCCTCTCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106794 AGGCCTGTTTGAGCAGCGGAGGCTACAGCAACAGGTTCCCCTCTCCATCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1694 CCACCAACCGCCTCACCCAGCGCATCATCCCCAG         GCGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 106844 CCACCAACCGCCTCACCCAGCGCATCATCCCCAGGTC...CAGGCGCTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1735 GCTCTGTCCACCAAGATTCCTGACACCAAAGGCTGCTTGCAGTGTCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110735 GCTCTGTCCACCAAGATTCCTGACACCAAAGGCTGCTTGCAGTGTCGTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1785 GG         TGCGGAATCCCTACACGGGTGCCACCTTCCTGCTGGCCG
        ||>>>...>>>||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 110785 GGGTA...CAGTGCGGAACCCCTACACGGGTGCCACCTTCCTGCTGGCCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1826 CCCTGCCCACCAGCCTGCTCCTGCTGCAGTGGTATGAGCCGCTGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110914 CCCTGCCCACCAGCCTGCTCCTGCTGCAGTGGTATGAGCCGCTGCAGAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1876 TTTCTGCTGCTGAAG         AACTTCTCCAGCCCTCTGCCCAGCCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 110964 TTTCTGCTGCTGAAGGTG...TAGAACTTCTCCAGCCCTCTGCCCAGCCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1917 AGCTGGGATGCTGGAGCCGCTGGTGCTGGATGGGAAGGAGCTGCCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111090 AGCTGGGATGCTGGAGCCGCTGGTGCTGGATGGGAAGGAGCTGCCGCAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1967 TGTGTGTTGGGGCCGAGGGGCCTGAGGGGCCCGGCTGCCGCGTCCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111140 TGTGTGTTGGGGCCGAGGGGCCTGAGGGGCCCGGCTGCCGCGTCCTGTTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2017 CATGTCCTGCCCCTGGAGGCTGGCCTGACGCCCGACATCCTCATCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111190 CATGTCCTGCCCCTGGAGGCTGGCCTGACGCCCGACATCCTCATCCCACC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2067 TG         AGGGGATCCCAGGCTCGGCCCAGCAGGTGATCCAGGTGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111240 TGGTG...CAGAGGGGATCCCAGGCTCGGCCCAGCAGGTGATCCAGGTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2108 ACAGGGACACAATCCTAGTCAGCTTTGAAC         GCTGTGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112727 ACAGGGACACAATCCTAGTCAGCTTTGAACGTG...CAGGCTGTGTGAGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2149 ATTGTCAACATGCAGGGCGAGCCCACGGCCACACTGGCACCTGAGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112887 ATTGTCAACATGCAGGGCGAGCCCACGGCCACACTGGCACCTGAGCTGAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2199 CTTTGATTTCCCCATCGAGACTGTGG         TGTGCCTGCAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112937 CTTTGATTTCCCCATCGAGACTGTGGGTG...TAGTGTGCCTGCAGGACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2240 GTGTGCTGGCCTTCTGGAGCCATGGGATGCAAGGCCGAAGCCTGGATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113206 GTGTGCTGGCCTTCTGGAGCCATGGGATGCAAGGCCGAAGCCTGGATACC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2290 AATGAG         GTGACCCAGGAGATCACAGATGAAACAAGGATCTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113256 AATGAGGTG...CAGGTGACCCAGGAGATCACAGATGAAACAAGGATCTT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2331 CCGAGTGCTTGGGGCCCACAG         AGACATCATCCTGGAGAGCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113400 CCGAGTGCTTGGGGCCCACAGGTA...CAGAGACATCATCCTGGAGAGCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2372 TTCCCACTGACAACCCAGAGGCGCACAGCAACCTCTACATCCTCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113546 TTCCCACTGACAACCCAGAGGCGCACAGCAACCTCTACATCCTCACGGGC

   2700     .    :    .
   2422 CACCAGAGCACCTAC
        |||||||||||||||
 113596 CACCAGAGCACCTAC