seq1 = pF1KB5752.tfa, 2241 bp
seq2 = pF1KB5752/gi568815588f_67784722.tfa (gi568815588f:67784722_68016590), 231869 bp

>pF1KB5752 2241
>gi568815588f:67784722_68016590 (Chr10)

1-430  (100001-100430)   100% ->
431-547  (102696-102812)   100% ->
548-789  (104161-104402)   100% ->
790-942  (106681-106833)   100% ->
943-1090  (122069-122216)   100% ->
1091-1170  (123325-123404)   100% ->
1171-1357  (124535-124721)   100% ->
1358-1915  (127753-128310)   100% ->
1916-2241  (131544-131869)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGAGGCGGCCCTCGCCCTTCAGCCCGGCGGCTCCCCCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACGAGGCGGCCCTCGCCCTTCAGCCCGGCGGCTCCCCCTCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGGGGCCGACAGGGAGGCCGCGTCGTCCCCCGCCGGGGAGCCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGGGGCCGACAGGGAGGCCGCGTCGTCCCCCGCCGGGGAGCCGCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAGAGGCCGCGGAGAGATGGTCCCGGCCTCGAGCGGAGCCCGGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAGAGGCCGCGGAGAGATGGTCCCGGCCTCGAGCGGAGCCCGGGCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGGTGGGGCGGCCCCAGAGCGTGAGGTGCCGGCGGCGGCCAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGGTGGGGCGGCCCCAGAGCGTGAGGTGCCGGCGGCGGCCAGGGGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGGGTGCGGCGGCGGCGGCGCTGTGGCGGGAGGCGGAGGCAGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCGGGTGCGGCGGCGGCGGCGCTGTGGCGGGAGGCGGAGGCAGAGGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGCGGCAGGCGGGGAGCAAGAGGCCCAGGCGACTGCGGCGGCTGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGCGGCAGGCGGGGAGCAAGAGGCCCAGGCGACTGCGGCGGCTGGGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGAGACAATGGGCCGGGCCTGCAGGGCCCATCTCGGGAGCCACCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGAGACAATGGGCCGGGCCTGCAGGGCCCATCTCGGGAGCCACCGCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGACAACTTGTACGACGAAGACGACGACGACGAGGGCGAGGAGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGACAACTTGTACGACGAAGACGACGACGACGAGGGCGAGGAGGAGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGCGGCGGCGGCGGCGATTGGGTACCGAG         ATAACCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100401 AGGCGGCGGCGGCGGCGATTGGGTACCGAGGTG...CAGATAACCTTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTCGGTGATGAAATTATCACTAATGGTTTTCATTCCTGTGAAAGTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102707 TTCGGTGATGAAATTATCACTAATGGTTTTCATTCCTGTGAAAGTGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGAGGATAGAGCCTCACATGCAAGCTCTAGTGACTGGACTCCAAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102757 GGAGGATAGAGCCTCACATGCAAGCTCTAGTGACTGGACTCCAAGGCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGATAG         GTCCATATACTTTTGTTCAGCAACATCTTATGATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102807 GGATAGGTA...TAGGTCCATATACTTTTGTTCAGCAACATCTTATGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGCACAGATCCTCGAACAATTCTTAAAGATTTATTGCCGGAAACAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104196 GGCACAGATCCTCGAACAATTCTTAAAGATTTATTGCCGGAAACAATACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCCACCTGAGTTGGATGATATGACACTGTGGCAGATTGTTATTAATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104246 TCCACCTGAGTTGGATGATATGACACTGTGGCAGATTGTTATTAATATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTTCAGAACCACCAAAAAGGAAAAAAAGAAAAGATATTAATACAATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104296 TTTCAGAACCACCAAAAAGGAAAAAAAGAAAAGATATTAATACAATTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GATGCTGTGAAATTACTGCAAGAGTGCAAAAAAATTATAGTTCTAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104346 GATGCTGTGAAATTACTGCAAGAGTGCAAAAAAATTATAGTTCTAACTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGCTGGG         GTGTCTGTTTCATGTGGAATACCTGACTTCAGGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104396 AGCTGGGGTA...TAGGTGTCTGTTTCATGTGGAATACCTGACTTCAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CAAGGGATGGTATTTATGCTCGCCTTGCTGTAGACTTCCCAGATCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106715 CAAGGGATGGTATTTATGCTCGCCTTGCTGTAGACTTCCCAGATCTTCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GATCCTCAAGCGATGTTTGATATTGAATATTTCAGAAAAGATCCAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106765 GATCCTCAAGCGATGTTTGATATTGAATATTTCAGAAAAGATCCAAGACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ATTCTTCAAGTTTGCAAAG         GAAATATATCCTGGACAATTCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 106815 ATTCTTCAAGTTTGCAAAGGTA...CAGGAAATATATCCTGGACAATTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGCCATCTCTCTGTCACAAATTCATAGCCTTGTCAGATAAGGAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122091 AGCCATCTCTCTGTCACAAATTCATAGCCTTGTCAGATAAGGAAGGAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CTACTTCGCAACTATACCCAGAACATAGACACGCTGGAACAGGTTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122141 CTACTTCGCAACTATACCCAGAACATAGACACGCTGGAACAGGTTGCGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AATCCAAAGGATAATTCAGTGTCATG         GTTCCTTTGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122191 AATCCAAAGGATAATTCAGTGTCATGGTT...TAGGTTCCTTTGCAACAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CATCTTGCCTGATTTGTAAATACAAAGTTGACTGTGAAGCTGTACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123340 CATCTTGCCTGATTTGTAAATACAAAGTTGACTGTGAAGCTGTACGAGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GATATTTTTAATCAG         GTAGTTCCTCGATGTCCTAGGTGCCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123390 GATATTTTTAATCAGGTA...TAGGTAGTTCCTCGATGTCCTAGGTGCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AGCTGATGAACCGCTTGCTATCATGAAACCAGAGATTGTGTTTTTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124561 AGCTGATGAACCGCTTGCTATCATGAAACCAGAGATTGTGTTTTTTGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AAAATTTACCAGAACAGTTTCATAGAGCCATGAAGTATGACAAAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124611 AAAATTTACCAGAACAGTTTCATAGAGCCATGAAGTATGACAAAGATGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GTTGACCTCCTCATTGTTATTGGGTCTTCCCTCAAAGTAAGACCAGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124661 GTTGACCTCCTCATTGTTATTGGGTCTTCCCTCAAAGTAAGACCAGTAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 ACTAATTCCAA         GTTCCATACCCCATGAAGTGCCTCAGATAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 124711 ACTAATTCCAAGTA...TAGGTTCCATACCCCATGAAGTGCCTCAGATAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TAATTAATAGAGAACCTTTGCCTCATCTGCATTTTGATGTAGAGCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127783 TAATTAATAGAGAACCTTTGCCTCATCTGCATTTTGATGTAGAGCTTCTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GGAGACTGTGATGTCATAATTAATGAATTGTGTCATAGGTTAGGTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127833 GGAGACTGTGATGTCATAATTAATGAATTGTGTCATAGGTTAGGTGGTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 ATATGCCAAACTTTGCTGTAACCCTGTAAAGCTTTCAGAAATTACTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127883 ATATGCCAAACTTTGCTGTAACCCTGTAAAGCTTTCAGAAATTACTGAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 AACCTCCACGAACACAAAAAGAATTGGCTTATTTGTCAGAGTTGCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127933 AACCTCCACGAACACAAAAAGAATTGGCTTATTTGTCAGAGTTGCCACCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 ACACCTCTTCATGTTTCAGAAGACTCAAGTTCACCAGAAAGAACTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127983 ACACCTCTTCATGTTTCAGAAGACTCAAGTTCACCAGAAAGAACTTCACC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 ACCAGATTCTTCAGTGATTGTCACACTTTTAGACCAAGCAGCTAAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128033 ACCAGATTCTTCAGTGATTGTCACACTTTTAGACCAAGCAGCTAAGAGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 ATGATGATTTAGATGTGTCTGAATCAAAAGGTTGTATGGAAGAAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128083 ATGATGATTTAGATGTGTCTGAATCAAAAGGTTGTATGGAAGAAAAACCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CAGGAAGTACAAACTTCTAGGAATGTTGAAAGTATTGCTGAACAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128133 CAGGAAGTACAAACTTCTAGGAATGTTGAAAGTATTGCTGAACAGATGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 AAATCCGGATTTGAAGAATGTTGGTTCTAGTACTGGGGAGAAAAATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128183 AAATCCGGATTTGAAGAATGTTGGTTCTAGTACTGGGGAGAAAAATGAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 GAACTTCAGTGGCTGGAACAGTGAGAAAATGCTGGCCTAATAGAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128233 GAACTTCAGTGGCTGGAACAGTGAGAAAATGCTGGCCTAATAGAGTGGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AAGGAGCAGATTAGTAGGCGGCTTGATG         GTAATCAGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 128283 AAGGAGCAGATTAGTAGGCGGCTTGATGGTA...CAGGTAATCAGTATCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 GTTTTTGCCACCAAATCGTTACATTTTCCATGGCGCTGAGGTATATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131557 GTTTTTGCCACCAAATCGTTACATTTTCCATGGCGCTGAGGTATATTCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 ACTCTGAAGATGACGTCTTATCCTCTAGTTCTTGTGGCAGTAACAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131607 ACTCTGAAGATGACGTCTTATCCTCTAGTTCTTGTGGCAGTAACAGTGAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 AGTGGGACATGCCAGAGTCCAAGTTTAGAAGAACCCATGGAGGATGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131657 AGTGGGACATGCCAGAGTCCAAGTTTAGAAGAACCCATGGAGGATGAAAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 TGAAATTGAAGAATTCTACAATGGCTTAGAAGATGAGCCTGATGTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131707 TGAAATTGAAGAATTCTACAATGGCTTAGAAGATGAGCCTGATGTTCCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 AGAGAGCTGGAGGAGCTGGATTTGGGACTGATGGAGATGATCAAGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131757 AGAGAGCTGGAGGAGCTGGATTTGGGACTGATGGAGATGATCAAGAGGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 ATTAATGAAGCTATATCTGTGAAACAGGAAGTAACAGACATGAACTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131807 ATTAATGAAGCTATATCTGTGAAACAGGAAGTAACAGACATGAACTATCC

   2300     .    :
   2229 ATCAAACAAATCA
        |||||||||||||
 131857 ATCAAACAAATCA