seq1 = pF1KB5716.tfa, 2163 bp
seq2 = pF1KB5716/gi568815583r_43097305.tfa (gi568815583r:43097305_43320825), 223521 bp

>pF1KB5716 2163
>gi568815583r:43097305_43320825 (Chr15)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-286  (104373-104558)   100% ->
287-520  (105498-105731)   100% ->
521-639  (109292-109410)   100% ->
640-744  (110387-110491)   100% ->
745-922  (111375-111552)   100% ->
923-1061  (112051-112189)   100% ->
1062-1165  (112493-112596)   100% ->
1166-1408  (113385-113627)   100% ->
1409-1708  (114197-114496)   100% ->
1709-1869  (117551-117711)   100% ->
1870-2003  (118849-118982)   100% ->
2004-2163  (123362-123521)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACAGGGTGAGCCAAGCCAGCGCTCGACAGGGCTTGCTGGACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGACAGGGTGAGCCAAGCCAGCGCTCGACAGGGCTTGCTGGACTGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCAGCCCCCGCAGCATCACCTGTTTTCATTAAAGGAAGTGGGATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCAGCCCCCGCAGCATCACCTGTTTTCATTAAAGGAAGTGGGATGGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          CCCTGGGTATCAAGAGCTGTGACTTTCAGGCAGCAAGAAAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTA...CAGCCCTGGGTATCAAGAGCTGTGACTTTCAGGCAGCAAGAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATGAGGAGCACCACACCAAGGCCCTCAGCTCCCGGCGCCTCTTTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104414 AATGAGGAGCACCACACCAAGGCCCTCAGCTCCCGGCGCCTCTTTGTGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGGGGGCAGCCCTTCACCATCATCCTGTACTTCCGCGCTCCAGTCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104464 GAGGGGGCAGCCCTTCACCATCATCCTGTACTTCCGCGCTCCAGTCCGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATTTCTGCCTGCCCTGAAGAAGGTGGCCCTCACTGCACAAACTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104514 CATTTCTGCCTGCCCTGAAGAAGGTGGCCCTCACTGCACAAACTGGTT..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     GAGAGCAGCCTTCCAAGATCAACAGGACCCAAGCCACATTCCCAAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104564 .CAGGAGAGCAGCCTTCCAAGATCAACAGGACCCAAGCCACATTCCCAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCCAGTCTGGGGGACCGAAAGTGGTGGAGTGCAGTGGTGGAGGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105544 TTCCAGTCTGGGGGACCGAAAGTGGTGGAGTGCAGTGGTGGAGGAGAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGCCCAGTCCTGGACCATCTCTGTGACCACACCTGCGGACGCTGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105594 ATGCCCAGTCCTGGACCATCTCTGTGACCACACCTGCGGACGCTGTCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCCACTACTCGCTTCTGCTGCAGGTCTCAGGCAGGAAGCAACTCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105644 GGCCACTACTCGCTTCTGCTGCAGGTCTCAGGCAGGAAGCAACTCCTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGGTCAGTTCACACTGCTTTTTAACCCCTGGAATAGAG         AGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105694 GGGTCAGTTCACACTGCTTTTTAACCCCTGGAATAGAGGTA...CAGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGCTGTGTTCCTGAAGAATGAGGCTCAGCGCATGGAGTACTTGTTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109295 ATGCTGTGTTCCTGAAGAATGAGGCTCAGCGCATGGAGTACTTGTTGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGAATGGTCTCATCTACCTGGGTACAGCTGACTGCATCCAGGCAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109345 CAGAATGGTCTCATCTACCTGGGTACAGCTGACTGCATCCAGGCAGAGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGGGACTTTGGCCAG         TTCGAGGGGGATGTCATTGACCTCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 109395 CTGGGACTTTGGCCAGGTA...CAGTTCGAGGGGGATGTCATTGACCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCCTGCGCTTGCTGAGCAAGGACAAGCAGGTAGAGAAGTGGAGCCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110412 GCCTGCGCTTGCTGAGCAAGGACAAGCAGGTAGAGAAGTGGAGCCAGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTGCACGTGGCCCGTGTGTTGGGTGCCTTG         CTGCATTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 110462 GTGCACGTGGCCCGTGTGTTGGGTGCCTTGGTA...CAGCTGCATTTTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAGGAGCAGAGGGTCCTGCCCACCCCGCAGACCCAGGCCACCCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111386 CAAGGAGCAGAGGGTCCTGCCCACCCCGCAGACCCAGGCCACCCAGGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGGCCTTGCTGAACAAGCGCCGGGGCAGCGTGCCCATCCTGCGGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111436 GGGCCTTGCTGAACAAGCGCCGGGGCAGCGTGCCCATCCTGCGGCAGTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTCACCGGCCGAGGCCGACCTGTGTATGATGGCCAGGCCTGGGTGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111486 CTCACCGGCCGAGGCCGACCTGTGTATGATGGCCAGGCCTGGGTGTTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGCTGTTGCTTGCACAG         TGCTGCGATGCCTGGGAATCCCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111536 TGCTGTTGCTTGCACAGGTT...CAGTGCTGCGATGCCTGGGAATCCCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCCGCGTGGTGACCACGTTTGCCTCAGCACAGGGCACCGGTGGGCGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112075 CCCGCGTGGTGACCACGTTTGCCTCAGCACAGGGCACCGGTGGGCGTCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTCATAGATGAATACTATAATGAGGAGGGACTTCAGAACGGAGAAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112125 CTCATAGATGAATACTATAATGAGGAGGGACTTCAGAACGGAGAAGGCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GAGAGGCAGAATCTG         GATCTTCCAGACTTCCACAGAGTGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 112175 GAGAGGCAGAATCTGGTG...CAGGATCTTCCAGACTTCCACAGAGTGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGATGACGCGGCCTGCCTTGCCCCAGGGTTATGATGGATGGCAGATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112519 GGATGACGCGGCCTGCCTTGCCCCAGGGTTATGATGGATGGCAGATTCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CACCCAAGTGCTCCTAATGGAGGTGGAG         TCCTGGGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 112569 CACCCAAGTGCTCCTAATGGAGGTGGAGGTA...CAGTCCTGGGGTCCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGATCTGGTGCCGGTCAGAGCAGTCAAGGAGGGGACGCTGGGGCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113398 TGATCTGGTGCCGGTCAGAGCAGTCAAGGAGGGGACGCTGGGGCTGACCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CAGCAGTGTCAGACCTTTTTGCTGCCATAAATGCCTCATGTGTGGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113448 CAGCAGTGTCAGACCTTTTTGCTGCCATAAATGCCTCATGTGTGGTCTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AAGTGCTGTGAGGATGGGACACTGGAGTTGACTGACTCCAACACAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113498 AAGTGCTGTGAGGATGGGACACTGGAGTTGACTGACTCCAACACAAAGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGTTGGCAACAACATCAGCACCAAGGGTGTGGGCAGTGACCGCTGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113548 TGTTGGCAACAACATCAGCACCAAGGGTGTGGGCAGTGACCGCTGCGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACATCACTCAGAACTACAAGTATCCTGAAG         GGTCTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 113598 ACATCACTCAGAACTACAAGTATCCTGAAGGTA...CAGGGTCTCTTCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAAAAAGAGGTGCTGGAGAGAGTCGAGAAAGAGAAAATGGAACGTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114208 GAAAAAGAGGTGCTGGAGAGAGTCGAGAAAGAGAAAATGGAACGTGAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 AGACAACGGCATCCGTCCTCCCAGTCTCGAGACTGCCAGTCCTCTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114258 AGACAACGGCATCCGTCCTCCCAGTCTCGAGACTGCCAGTCCTCTGTACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGCTCTTGAAAGCACCCAGCTCCCTACCCCTGAGAGGGGATGCCCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114308 TGCTCTTGAAAGCACCCAGCTCCCTACCCCTGAGAGGGGATGCCCAGATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TCAGTGACGCTGGTTAATCACAGTGAGCAGGAGAAGGCAGTGCAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114358 TCAGTGACGCTGGTTAATCACAGTGAGCAGGAGAAGGCAGTGCAGCTGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AATTGGGGTCCAGGCTGTACACTACAACGGTGTCCTTGCTGCCAAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114408 AATTGGGGTCCAGGCTGTACACTACAACGGTGTCCTTGCTGCCAAGCTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 GGAGGAAGAAGCTGCACCTCACGCTCAGTGCCAACCTGG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 114458 GGAGGAAGAAGCTGCACCTCACGCTCAGTGCCAACCTGGGTA...CAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 AAGATAATAACCATCGGCCTGTTCTTCTCCAATTTTGAGCGAAACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117553 AAGATAATAACCATCGGCCTGTTCTTCTCCAATTTTGAGCGAAACCCACC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CGAGAACACCTTCCTTAGACTCACCGCCATGGCAACACACTCTGAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117603 CGAGAACACCTTCCTTAGACTCACCGCCATGGCAACACACTCTGAATCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 ACCTTAGCTGCTTTGCTCAGGAAGACATTGCCATTTGTAGACCACACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117653 ACCTTAGCTGCTTTGCTCAGGAAGACATTGCCATTTGTAGACCACACCTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 GCCATCAAG         ATGCCAGAGAAAGCAGAGCAGTATCAACCCCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 117703 GCCATCAAGGTA...CAGATGCCAGAGAAAGCAGAGCAGTATCAACCCCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CACAGCCTCAGTCAGCCTCCAGAACTCCCTAGATGCCCCCATGGAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118881 CACAGCCTCAGTCAGCCTCCAGAACTCCCTAGATGCCCCCATGGAGGACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 GTGTGATCTCCATCCTGGGAAGGGGGCTCATTCACAGAGAGAGGAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118931 GTGTGATCTCCATCCTGGGAAGGGGGCTCATTCACAGAGAGAGGAGCTAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 AG         ATTCCGTTCAGTGTGGCCTGAAAACACCATGTGTGCCAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118981 AGGTA...CAGATTCCGTTCAGTGTGGCCTGAAAACACCATGTGTGCCAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GTTCCAGTTCACGCCAACACATGTGGGGCTCCAGAGACTCACTGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123401 GTTCCAGTTCACGCCAACACATGTGGGGCTCCAGAGACTCACTGTGGAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TGGACTGCAACATGTTCCAGAACCTAACCAACTATAAAAGCGTCACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123451 TGGACTGCAACATGTTCCAGAACCTAACCAACTATAAAAGCGTCACCGTG

   2250     .    :    .    :
   2143 GTAGCCCCTGAACTATCAGCT
        |||||||||||||||||||||
 123501 GTAGCCCCTGAACTATCAGCT