seq1 = pF1KB5705.tfa, 2232 bp
seq2 = pF1KB5705/gi568815587r_6349031.tfa (gi568815587r:6349031_6565695), 216665 bp

>pF1KB5705 2232
>gi568815587r:6349031_6565695 (Chr11)

(complement)

1-131  (100001-100131)   100% ->
132-363  (107400-107631)   100% ->
364-515  (107849-108000)   100% ->
516-696  (108220-108400)   100% ->
697-1429  (108667-109399)   100% ->
1430-1533  (109521-109624)   100% ->
1534-1701  (114258-114425)   100% ->
1702-1870  (114636-114804)   100% ->
1871-1941  (115075-115145)   100% ->
1942-2082  (116250-116390)   100% ->
2083-2232  (116516-116665)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAAGAGGGAGGACAGCCCTGGCCCAGAGGTCCAGCCAATGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAAGAGGGAGGACAGCCCTGGCCCAGAGGTCCAGCCAATGGACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGTTCCTGGTATGCAGCATCTGCCTGGATCGGTACCAGTGCCCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGTTCCTGGTATGCAGCATCTGCCTGGATCGGTACCAGTGCCCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCTTCCTTGCCTGCACACCTTCTGTGAGAG         ATGTCTCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 TTCTTCCTTGCCTGCACACCTTCTGTGAGAGGTG...CAGATGTCTCCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACTATATCCCTGCCCAGAGCCTGACGCTATCCTGTCCAGTATGCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107410 AACTATATCCCTGCCCAGAGCCTGACGCTATCCTGTCCAGTATGCCGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACGTCCATCCTCCCAGAGCAGGGCGTCTCGGCACTGCAGAACAACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107460 GACGTCCATCCTCCCAGAGCAGGGCGTCTCGGCACTGCAGAACAACTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCATCAGCAGCCTCATGGAGGCAATGCAGCAGGCACCTGATGGGGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107510 TCATCAGCAGCCTCATGGAGGCAATGCAGCAGGCACCTGATGGGGCCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCCGGAGGACCCCCACCCCCTCAGTGTAGTGGCTGGCCGCCCTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107560 GACCCGGAGGACCCCCACCCCCTCAGTGTAGTGGCTGGCCGCCCTCTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGCCCCAACCATGAAGGCAAG         ACGATGGAGTTTTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 107610 CTGCCCCAACCATGAAGGCAAGGTG...CAGACGATGGAGTTTTACTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGCCTGTGAGACGGCCATGTGTGGTGAGTGCCGCGCCGGGGAGCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107868 AGGCCTGTGAGACGGCCATGTGTGGTGAGTGCCGCGCCGGGGAGCATCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGCATGGCACAGTGCTGCTGAGGGATGTGGTGGAGCAGCACAAGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107918 GAGCATGGCACAGTGCTGCTGAGGGATGTGGTGGAGCAGCACAAGGCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGCAGCGCCAGCTCGAGGCTGTGCGTGGCCG         ATTGCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107968 CCTGCAGCGCCAGCTCGAGGCTGTGCGTGGCCGGTA...CAGATTGCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGCTGTCCGCAGCAATTGCCTTAGTCGGGGGCATCAGCCAGCAGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108228 AGCTGTCCGCAGCAATTGCCTTAGTCGGGGGCATCAGCCAGCAGCTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGCGCAAGGCAGAGGCCCTGGCCCAGATCAGTGCAGCGTTCGAGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108278 GAGCGCAAGGCAGAGGCCCTGGCCCAGATCAGTGCAGCGTTCGAGGACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAGCAAGCACTGCAGCAGCGCAAGCAGGCTCTGGTCAGCGACCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108328 GGAGCAAGCACTGCAGCAGCGCAAGCAGGCTCTGGTCAGCGACCTGGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCATTTGTGGGGCCAAACAGAAG         GTGTTGCAAAGCCAGCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108378 CCATTTGTGGGGCCAAACAGAAGGTG...CAGGTGTTGCAAAGCCAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACACACTGCGCCAGGGTCAGGAACACATCGGCAGTAGCTGCAGCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108685 GACACACTGCGCCAGGGTCAGGAACACATCGGCAGTAGCTGCAGCTTTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAGCAGGCACTGCGCCTGGGCTCGGCCCCGGAGGTGTTGCTGGTGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108735 AGAGCAGGCACTGCGCCTGGGCTCGGCCCCGGAGGTGTTGCTGGTGCGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGCACATGCGAGAGCGGCTGGCTGCATTGGCGGCACAGGCCTTCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108785 AGCACATGCGAGAGCGGCTGGCTGCATTGGCGGCACAGGCCTTCCCGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CGGCCACATGAGAATGCACAGCTGGAACTGGTCCTTGAGGTGGACGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108835 CGGCCACATGAGAATGCACAGCTGGAACTGGTCCTTGAGGTGGACGGTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GCGGCGATCGGTGCTCAATCTGGGCGCACTGCTCACCACGAGCGCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108885 GCGGCGATCGGTGCTCAATCTGGGCGCACTGCTCACCACGAGCGCCACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CACACGAAACGGTGGCCACGGGAGAGGGCCTGCGCCAGGCGCTAGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108935 CACACGAAACGGTGGCCACGGGAGAGGGCCTGCGCCAGGCGCTAGTGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CAGCCTGCCTCGCTCACTGTCACTACCAAAGACAAGGACGGGCGGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108985 CAGCCTGCCTCGCTCACTGTCACTACCAAAGACAAGGACGGGCGGTTGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GCGCACAGGCAGCGCTGAGCTGCGTGCAGAGATCACCGGCCCGGACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109035 GCGCACAGGCAGCGCTGAGCTGCGTGCAGAGATCACCGGCCCGGACGGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CGCGCCTTCCGGTGCCAGTGGTGGACCACAAGAATGGCACATATGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109085 CGCGCCTTCCGGTGCCAGTGGTGGACCACAAGAATGGCACATATGAGCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GTGTACACAGCGCGCACGGAAGGCGAGCTGCTCCTCTCGGTGCTGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109135 GTGTACACAGCGCGCACGGAAGGCGAGCTGCTCCTCTCGGTGCTGCTCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CGGACAGCCAGTGCGCGGCAGCCCCTTCCGCGTGCGTGCCCTGCGTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109185 CGGACAGCCAGTGCGCGGCAGCCCCTTCCGCGTGCGTGCCCTGCGTCCGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GGGACCTGCCACCTTCCCCGGACGATGTGAAGCGCCGTGTCAAGTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109235 GGGACCTGCCACCTTCCCCGGACGATGTGAAGCGCCGTGTCAAGTCCCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGCGGCCCCGGCAGCCATGTGCGCCAGAAGGCAGTGCGTAGGCCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109285 GGCGGCCCCGGCAGCCATGTGCGCCAGAAGGCAGTGCGTAGGCCCAGCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CATGTACAGCACAGGCGGCAAACGAAAGGACAACCCAATTGAGGATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109335 CATGTACAGCACAGGCGGCAAACGAAAGGACAACCCAATTGAGGATGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 TCGTCTTCCGTGTTG         GCAGTCGTGGAAGGGAGAAAGGTGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109385 TCGTCTTCCGTGTTGGTA...CAGGCAGTCGTGGAAGGGAGAAAGGTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TTCACCAATTTACAAGGTGTGTCCGCAGCCAGCAGCGGCCGCATCGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109547 TTCACCAATTTACAAGGTGTGTCCGCAGCCAGCAGCGGCCGCATCGTGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 AGCAGACAGCAACAACCAGTGTATTCAG         GTTTTCTCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 109597 AGCAGACAGCAACAACCAGTGTATTCAGGTA...CAGGTTTTCTCCAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 AGGGCCAGTTCAAGTTCCGTTTTGGGGTCCGAGGACGCTCACCTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114271 AGGGCCAGTTCAAGTTCCGTTTTGGGGTCCGAGGACGCTCACCTGGGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CTGCAGCGCCCCACAGGTGTGGCAGTGGACACCAATGGAGACATAATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114321 CTGCAGCGCCCCACAGGTGTGGCAGTGGACACCAATGGAGACATAATTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GGCAGACTATGACAACCGTTGGGTCAGCATCTTCTCCCCTGAGGGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114371 GGCAGACTATGACAACCGTTGGGTCAGCATCTTCTCCCCTGAGGGCAAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 TCAAG         ACCAAGATTGGAGCTGGCCGCCTCATGGGCCCCAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114421 TCAAGGTG...CAGACCAAGATTGGAGCTGGCCGCCTCATGGGCCCCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GGAGTGGCCGTAGACCGGAATGGACATATCATTGTGGTCGACAACAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114672 GGAGTGGCCGTAGACCGGAATGGACATATCATTGTGGTCGACAACAAGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TTGCTGCGTCTTTACCTTCCAGCCCAATGGCAAACTGGTTGGCCGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114722 TTGCTGCGTCTTTACCTTCCAGCCCAATGGCAAACTGGTTGGCCGTTTTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 GGGGCCGTGGGGCCACTGACCGCCACTTTGCAG         GGCCCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 114772 GGGGCCGTGGGGCCACTGACCGCCACTTTGCAGGTA...CAGGGCCCCAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 TTTGTGGCTGTGAACAACAAGAATGAAATTGTAGTAACGGACTTCCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115083 TTTGTGGCTGTGAACAACAAGAATGAAATTGTAGTAACGGACTTCCATAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 CCATTCAGTGAAG         GTGTACAGTGCCGATGGAGAGTTCCTCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 115133 CCATTCAGTGAAGGTC...CAGGTGTACAGTGCCGATGGAGAGTTCCTCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 TCAAGTTTGGCTCCCATGGCGAGGGCAATGGGCAGTTCAATGCCCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116278 TCAAGTTTGGCTCCCATGGCGAGGGCAATGGGCAGTTCAATGCCCCCACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 GGAGTAGCTGTGGACTCCAATGGAAACATCATTGTGGCTGACTGGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116328 GGAGTAGCTGTGGACTCCAATGGAAACATCATTGTGGCTGACTGGGGCAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 CAGCCGCATCCAG         GTATTCGACAGCTCTGGCTCCTTCCTGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 116378 CAGCCGCATCCAGGTG...CAGGTATTCGACAGCTCTGGCTCCTTCCTGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 CCTATATCAACACATCTGCAGAACCACTGTATGGTCCACAGGGCCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116544 CCTATATCAACACATCTGCAGAACCACTGTATGGTCCACAGGGCCTGGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 CTGACCTCGGATGGCCATGTGGTGGTGGCTGATGCTGGCAACCACTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116594 CTGACCTCGGATGGCCATGTGGTGGTGGCTGATGCTGGCAACCACTGCTT

   2300     .    :    .    :
   2211 TAAAGCCTATCGCTACCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||
 116644 TAAAGCCTATCGCTACCTCCAG