seq1 = pF1KB5696.tfa, 735 bp
seq2 = pF1KB5696/gi568815590r_100820696.tfa (gi568815590r:100820696_101048889), 228194 bp

>pF1KB5696 735
>gi568815590r:100820696_101048889 (Chr8)

(complement)

1-294  (100001-100294)   100% ->
295-418  (123851-123974)   100% ->
419-582  (124592-124755)   100% ->
583-678  (124840-124935)   100% ->
679-735  (128138-128194)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATAAAAATGAGCTGGTTCAGAAGGCCAAACTGGCCGAGCAGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATAAAAATGAGCTGGTTCAGAAGGCCAAACTGGCCGAGCAGGCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGATATGATGACATGGCAGCCTGCATGAAGTCTGTAACTGAGCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGATATGATGACATGGCAGCCTGCATGAAGTCTGTAACTGAGCAAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAATTATCCAATGAGGAGAGGAATCTTCTCTCAGTTGCTTATAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAATTATCCAATGAGGAGAGGAATCTTCTCTCAGTTGCTTATAAAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTGTAGGAGCCCGTAGGTCATCTTGGAGGGTCGTCTCAAGTATTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTGTAGGAGCCCGTAGGTCATCTTGGAGGGTCGTCTCAAGTATTGAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAAGACGGAAGGTGCTGAGAAAAAACAGCAGATGGCTCGAGAATACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAAGACGGAAGGTGCTGAGAAAAAACAGCAGATGGCTCGAGAATACAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAAATTGAGACGGAGCTAAGAGATATCTGCAATGATGTACTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100251 AGAAAATTGAGACGGAGCTAAGAGATATCTGCAATGATGTACTGGTG...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295    TCTCTTTTGGAAAAGTTCTTGATCCCCAATGCTTCACAAGCAGAGAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123848 AAGTCTCTTTTGGAAAAGTTCTTGATCCCCAATGCTTCACAAGCAGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAAGTCTTCTATTTGAAAATGAAAGGAGATTACTACCGTTACTTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123898 CAAAGTCTTCTATTTGAAAATGAAAGGAGATTACTACCGTTACTTGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGTTGCCGCTGGTGATGACAAGAAAG         GGATTGTCGATCAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 123948 AGGTTGCCGCTGGTGATGACAAGAAAGGTA...CAGGGATTGTCGATCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCACAACAAGCATACCAAGAAGCTTTTGAAATCAGCAAAAAGGAAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124606 TCACAACAAGCATACCAAGAAGCTTTTGAAATCAGCAAAAAGGAAATGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACCAACACATCCTATCAGACTGGGTCTGGCCCTTAACTTCTCTGTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124656 ACCAACACATCCTATCAGACTGGGTCTGGCCCTTAACTTCTCTGTGTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATTATGAGATTCTGAACTCCCCAGAGAAAGCCTGCTCTCTTGCAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124706 ATTATGAGATTCTGAACTCCCCAGAGAAAGCCTGCTCTCTTGCAAAGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583          GCTTTTGATGAAGCCATTGCTGAACTTGATACATTAAGTGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124756 GTA...TAGGCTTTTGATGAAGCCATTGCTGAACTTGATACATTAAGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGAGTCATACAAAGACAGCACGCTAATAATGCAATTACTGAGAGACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124881 AGAGTCATACAAAGACAGCACGCTAATAATGCAATTACTGAGAGACAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGACA         TTGTGGACATCGGATACCCAAGGAGACGAAGCTGAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124931 TGACAGTA...CAGTTGTGGACATCGGATACCCAAGGAGACGAAGCTGAA

    750     .    :    .    :
    715 GCAGGAGAAGGAGGGGAAAAT
        |||||||||||||||||||||
 128174 GCAGGAGAAGGAGGGGAAAAT