seq1 = pF1KB5657.tfa, 3432 bp
seq2 = pF1KB5657/gi568815593f_109590418.tfa (gi568815593f:109590418_109966995), 376578 bp

>pF1KB5657 3432
>gi568815593f:109590418_109966995 (Chr5)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-390  (123103-123357)   100% ->
391-535  (125703-125847)   100% ->
536-707  (138925-139096)   100% ->
708-835  (164912-165039)   100% ->
836-1009  (177118-177291)   100% ->
1010-1196  (179938-180124)   100% ->
1197-1374  (184371-184548)   100% ->
1375-1577  (190979-191181)   100% ->
1578-1760  (194327-194509)   100% ->
1761-1875  (198517-198631)   100% ->
1876-1943  (199043-199110)   100% ->
1944-2109  (226856-227021)   100% ->
2110-2328  (229252-229470)   100% ->
2329-2451  (229803-229925)   100% ->
2452-2566  (233306-233420)   100% ->
2567-2700  (251911-252044)   100% ->
2701-2842  (255448-255589)   100% ->
2843-2976  (257240-257373)   100% ->
2977-3171  (264723-264917)   100% ->
3172-3282  (274619-274729)   100% ->
3283-3432  (276429-276578)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTTAAGCCGCCAGTTCACCGTGTTCGGCAGTGCGATCTTCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTTAAGCCGCCAGTTCACCGTGTTCGGCAGTGCGATCTTCTGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGATTTTCTCGCTCTACCTGATGCTGGACCGGGGTCACTTAGACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGATTTTCTCGCTCTACCTGATGCTGGACCGGGGTCACTTAGACTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGGAACCCGCGCCGCGAGGGCTCCTTCCCTCAG         GGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 CCAGGAACCCGCGCCGCGAGGGCTCCTTCCCTCAGGTA...TAGGGCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCTCAATGTTGCAAGAAAAAATAGACCATTTGGAGCGTTTGCTAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123109 CTCTCAATGTTGCAAGAAAAAATAGACCATTTGGAGCGTTTGCTAGCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAATAATGAGATCATCTCAAATATTAGAGACTCAGTCATCAATTTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123159 GAATAATGAGATCATCTCAAATATTAGAGACTCAGTCATCAATTTGAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTCTGTGGAGGATGGTCCGAAAAGTTCACAAAGCAATTTCAGCCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123209 AGTCTGTGGAGGATGGTCCGAAAAGTTCACAAAGCAATTTCAGCCAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGGCTCACATCTTCTGCCCTCACAATTATCCCTCTCAGTTGACACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123259 GCTGGCTCACATCTTCTGCCCTCACAATTATCCCTCTCAGTTGACACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGACTGTCTGTTTGCTTCACAAAGTGGAAGTCACAATTCAGATGTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 123309 AGACTGTCTGTTTGCTTCACAAAGTGGAAGTCACAATTCAGATGTGCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391         ATGTTGGATGTTTACAGTCTAATTTCTTTTGACAATCCAGAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123359 TA...TAGATGTTGGATGTTTACAGTCTAATTTCTTTTGACAATCCAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGTGGAGTTTGGAAGCAAGGATTTGACATTACTTATGAATCTAATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125745 GGTGGAGTTTGGAAGCAAGGATTTGACATTACTTATGAATCTAATGAATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGACACTGAACCCCTTCAAGTCTTTGTGGTGCCTCATTCCCATAACGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125795 GGACACTGAACCCCTTCAAGTCTTTGTGGTGCCTCATTCCCATAACGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CAG         GTTGGTTGAAGACTTTCAATGACTACTTTAGAGACAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125845 CAGGTA...TAGGTTGGTTGAAGACTTTCAATGACTACTTTAGAGACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTCAGTATATTTTTAATAACATGGTCCTAAAGCTGAAAGAAGACTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138963 ACTCAGTATATTTTTAATAACATGGTCCTAAAGCTGAAAGAAGACTCACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAGGAAGTTTATTTGGTCTGAGATCTCTTACCTTTCAAAGTGGTGGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139013 GAGGAAGTTTATTTGGTCTGAGATCTCTTACCTTTCAAAGTGGTGGGATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TTATAGATATTCAGAAGAAGGATGCTGTTAAAAG         TTTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 139063 TTATAGATATTCAGAAGAAGGATGCTGTTAAAAGGTT...TAGTTTAATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAAAATGGTCAGCTTGAAATTGTGACAGGTGGCTGGGTTATGCCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164919 GAAAATGGTCAGCTTGAAATTGTGACAGGTGGCTGGGTTATGCCTGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGCTACTCCACATTATTTTGCCTTAATTGATCAACTAATTGAAGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164969 AGCTACTCCACATTATTTTGCCTTAATTGATCAACTAATTGAAGGACATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGTGGCTGGAAAATAATATAG         GAGTGAAACCTCGGTCCGGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 165019 AGTGGCTGGAAAATAATATAGGTA...CAGGAGTGAAACCTCGGTCCGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TGGGCTATTGATCCCTTTGGACACTCACCAACAATGGCTTATCTTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177138 TGGGCTATTGATCCCTTTGGACACTCACCAACAATGGCTTATCTTCTAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCGTGCTGGACTTTCTCACATGCTTATCCAGAGAGTTCATTATGCAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177188 CCGTGCTGGACTTTCTCACATGCTTATCCAGAGAGTTCATTATGCAGTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AAAAACACTTTGCACTGCATAAAACATTGGAGTTTTTTTGGAGACAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177238 AAAAACACTTTGCACTGCATAAAACATTGGAGTTTTTTTGGAGACAGAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TGGG         ATCTGGGATCTGTCACAGATATTTTATGCCACATGAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177288 TGGGGTA...TAGATCTGGGATCTGTCACAGATATTTTATGCCACATGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCCCTTCTACAGCTATGACATCCCTCACACTTGTGGACCTGATCCTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179975 GCCCTTCTACAGCTATGACATCCCTCACACTTGTGGACCTGATCCTAAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TATGCTGCCAGTTTGATTTTAAACGTCTTCCTGGAGGCAGATTTGGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180025 TATGCTGCCAGTTTGATTTTAAACGTCTTCCTGGAGGCAGATTTGGTTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CCCTGGGGAGTCCCCCCAGAAACAATACATCCTGGAAATGTCCAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180075 CCCTGGGGAGTCCCCCCAGAAACAATACATCCTGGAAATGTCCAAAGCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197          GGCTCGGATGCTACTAGATCAGTACCGAAAGAAGTCAAAGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180125 GTA...TAGGGCTCGGATGCTACTAGATCAGTACCGAAAGAAGTCAAAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTTTTCGTACCAAAGTTCTCCTGGCTCCACTAGGAGATGATTTCCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184412 TTTTTCGTACCAAAGTTCTCCTGGCTCCACTAGGAGATGATTTCCGCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TGTGAATACACGGAATGGGATTTACAGTTTAAGAATTATCAGCAGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184462 TGTGAATACACGGAATGGGATTTACAGTTTAAGAATTATCAGCAGCTTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGATTATATGAATTCTCAGTCCAAGTTTAAAGTTAAG         ATAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 184512 TGATTATATGAATTCTCAGTCCAAGTTTAAAGTTAAGGTA...TAGATAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AGTTTGGAACTTTATCAGATTTTTTTGATGCGCTGGATAAAGCAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190983 AGTTTGGAACTTTATCAGATTTTTTTGATGCGCTGGATAAAGCAGATGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 ACTCAGAGAGACAAGGGCCAATCGATGTTCCCTGTTTTAAGTGGAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191033 ACTCAGAGAGACAAGGGCCAATCGATGTTCCCTGTTTTAAGTGGAGATTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TTTCACTTATGCCGATCGAGATGATCATTACTGGAGTGGCTATTTTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191083 TTTCACTTATGCCGATCGAGATGATCATTACTGGAGTGGCTATTTTACAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CCAGACCCTTTTACAAACGAATGGACAGAATCATGGAATCTCATTTAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 191133 CCAGACCCTTTTACAAACGAATGGACAGAATCATGGAATCTCATTTAAGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1578         GGCTGCTGAAATTCTTTACTATTTCGCCCTGAGACAAGCTCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191183 TA...TAGGGCTGCTGAAATTCTTTACTATTTCGCCCTGAGACAAGCTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CAAATACAAGATAAATAAATTTCTCTCATCATCACTTTACACGGCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194369 CAAATACAAGATAAATAAATTTCTCTCATCATCACTTTACACGGCACTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 CAGAAGCCAGAAGGAATTTGGGACTGTTTCAACATCATGATGCTATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194419 CAGAAGCCAGAAGGAATTTGGGACTGTTTCAACATCATGATGCTATCACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 GGAACTGCAAAAGACTGGGTGGTTGTGGATTATGGTACCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 194469 GGAACTGCAAAAGACTGGGTGGTTGTGGATTATGGTACCAGGTA...CAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 ACTTTTTCATTCGTTAATGGTTTTGGAGAAGATAATTGGAAATTCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198517 ACTTTTTCATTCGTTAATGGTTTTGGAGAAGATAATTGGAAATTCTGCAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TTCTTCTTATTTTGAAGGACAAACTCACATACGACTCTTACTCTCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198567 TTCTTCTTATTTTGAAGGACAAACTCACATACGACTCTTACTCTCCTGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 ACCTTCCTGGAGATG         GATTTGAAACAAAAATCACAAGATTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 198617 ACCTTCCTGGAGATGGTT...TAGGATTTGAAACAAAAATCACAAGATTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TCTGCCACAAAAAAATATAATAAGGCTGAGTGCGGAGCCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 199069 TCTGCCACAAAAAAATATAATAAGGCTGAGTGCGGAGCCAAGGTA...CA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1944  GTACCTTGTGGTCTATAATCCTTTAGAACAAGACCGAATCTCGTTGGTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226855 GGTACCTTGTGGTCTATAATCCTTTAGAACAAGACCGAATCTCGTTGGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 TCAGTCTATGTGAGTTCCCCGACAGTGCAAGTGTTCTCTGCTTCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226905 TCAGTCTATGTGAGTTCCCCGACAGTGCAAGTGTTCTCTGCTTCAGGAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 ACCTGTGGAAGTTCAAGTCAGCGCAGTTTGGGATACAGCAAATACTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226955 ACCTGTGGAAGTTCAAGTCAGCGCAGTTTGGGATACAGCAAATACTATTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 CAGAAACAGCCTATGAG         ATCTCTTTTCGAGCACATATACCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 227005 CAGAAACAGCCTATGAGGTA...AAGATCTCTTTTCGAGCACATATACCG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 CCATTGGGACTGAAAGTGTATAAGATTTTGGAATCAGCAAGTTCAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229276 CCATTGGGACTGAAAGTGTATAAGATTTTGGAATCAGCAAGTTCAAATTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 ACATTTAGCTGATTATGTCTTGTATAAGAATAAAGTAGAAGATAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229326 ACATTTAGCTGATTATGTCTTGTATAAGAATAAAGTAGAAGATAGCGGAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TTTTCACCATAAAGAATATGATAAATACTGAAGAAGGTATAACACTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229376 TTTTCACCATAAAGAATATGATAAATACTGAAGAAGGTATAACACTAGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 AACTCCTTTGTTTTACTTCGGTTTGATCAAACTGGACTTATGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 229426 AACTCCTTTGTTTTACTTCGGTTTGATCAAACTGGACTTATGAAGGTA..

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329     CAAATGATGACTAAAGAAGATGGTAAACACCATGAAGTAAATGTGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229476 .TAGCAAATGATGACTAAAGAAGATGGTAAACACCATGAAGTAAATGTGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 AATTTTCATGGTATGGAACCACAATTAAAAGAGACAAAAGTGGTGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229849 AATTTTCATGGTATGGAACCACAATTAAAAGAGACAAAAGTGGTGCCTAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 CTCTTCTTACCTGATGGTAATGCCAAG         CCTTATGTTTACAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 229899 CTCTTCTTACCTGATGGTAATGCCAAGGTA...CAGCCTTATGTTTACAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 AACACCGCCCTTTGTCAGAGTGACACATGGAAGGATTTATTCGGAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233320 AACACCGCCCTTTGTCAGAGTGACACATGGAAGGATTTATTCGGAAGTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 CTTGCTTTTTTGACCATGTTACTCATAGAGTCCGACTATACCACATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233370 CTTGCTTTTTTGACCATGTTACTCATAGAGTCCGACTATACCACATACAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 G         GAATAGAAGGACAGTCTGTGGAAGTTTCCAATATTGTGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233420 GGTA...TAGGAATAGAAGGACAGTCTGTGGAAGTTTCCAATATTGTGGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 CATCCGAAAAGTATATAACCGTGAGATTGCAATGAAAATTTCTTCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251951 CATCCGAAAAGTATATAACCGTGAGATTGCAATGAAAATTTCTTCTGATA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 TAAAAAGCCAAAATAGATTTTATACTGACCTAAATGGGTACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 252001 TAAAAAGCCAAAATAGATTTTATACTGACCTAAATGGGTACCAGGTA...

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2701    ATTCAACCTAGAATGACACTGAGCAAATTGCCTCTTCAAGCAAATGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255445 TAGATTCAACCTAGAATGACACTGAGCAAATTGCCTCTTCAAGCAAATGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 CTATCCCATGACCACAATGGCCTATATCCAGGATGCCAAACATCGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255495 CTATCCCATGACCACAATGGCCTATATCCAGGATGCCAAACATCGTTTGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 CACTGCTCTCTGCTCAGTCATTAGGGGTTTCGAGTTTGAATAGTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 255545 CACTGCTCTCTGCTCAGTCATTAGGGGTTTCGAGTTTGAATAGTGGTA..

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2843     GTCAGATTGAAGTTATCATGGATCGAAGACTCATGCAAGATGATAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255595 .TAGGTCAGATTGAAGTTATCATGGATCGAAGACTCATGCAAGATGATAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 TCGTGGCCTTGAGCAAGGTATCCAGGATAACAAGATTACAGCTAATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257286 TCGTGGCCTTGAGCAAGGTATCCAGGATAACAAGATTACAGCTAATCTAT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 TTCGAATACTACTAGAAAAAAGAAGTGCTGTTAATACG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 257336 TTCGAATACTACTAGAAAAAAGAAGTGCTGTTAATACGGTA...TAGGAA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 GAAGAAAAGAAGTCGGTCAGTTATCCTTCTCTCCTTAGCCACATAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264726 GAAGAAAAGAAGTCGGTCAGTTATCCTTCTCTCCTTAGCCACATAACTTC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 TTCTCTCATGAATCATCCAGTCATTCCAATGGCAAATAAGTTCTCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264776 TTCTCTCATGAATCATCCAGTCATTCCAATGGCAAATAAGTTCTCCTCAC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 CTACCCTTGAGCTGCAAGGTGAATTCTCTCCATTACAGTCATCTTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264826 CTACCCTTGAGCTGCAAGGTGAATTCTCTCCATTACAGTCATCTTTGCCT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3130 TGTGACATTCATCTGGTTAATTTGAGAACAATACAGTCAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 264876 TGTGACATTCATCTGGTTAATTTGAGAACAATACAGTCAAAGGTA...CA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3172  GTGGGCAATGGGCACTCCAATGAGGCAGCCTTGATCCTCCACAGAAAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 274618 GGTGGGCAATGGGCACTCCAATGAGGCAGCCTTGATCCTCCACAGAAAAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3221 GGTTTGATTGTCGGTTCTCTAGCAAAGGCACAGGGCTGTTTTGTTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 274668 GGTTTGATTGTCGGTTCTCTAGCAAAGGCACAGGGCTGTTTTGTTCTACT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3271 ACTCAGGGAAAG         ATATTGGTACAGAAACTTTTAAACAAGTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 274718 ACTCAGGGAAAGGTA...CAGATATTGGTACAGAAACTTTTAAACAAGTT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3312 TATTGTCGAAAGTCTCACACCTTCATCACTATCCTTGATGCATTCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276458 TATTGTCGAAAGTCTCACACCTTCATCACTATCCTTGATGCATTCACCTC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3362 CCGGCACTCAGAATATAAGTGAGATCAACTTGAGTCCAATGGAAATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276508 CCGGCACTCAGAATATAAGTGAGATCAACTTGAGTCCAATGGAAATCAGC

   3600     .    :    .    :
   3412 ACATTCCGAATCCAGTTGAGG
        |||||||||||||||||||||
 276558 ACATTCCGAATCCAGTTGAGG