seq1 = pF1KB5633.tfa, 1566 bp
seq2 = pF1KB5633/gi568815587r_36389841.tfa (gi568815587r:36389841_36601515), 211675 bp

>pF1KB5633 1566
>gi568815587r:36389841_36601515 (Chr11)

(complement)

1-296  (100001-100296)   100% ->
297-447  (102876-103026)   100% ->
448-606  (104250-104408)   100% ->
607-678  (106469-106540)   100% ->
679-756  (108888-108965)   100% ->
757-1566  (110866-111675)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCTGCTAAACTGTGAAAACAGCTGTGGATCCAGCCAGTCTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCTGCTAAACTGTGAAAACAGCTGTGGATCCAGCCAGTCTGAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACTGCTGTGTGGCCATGGCCAGCTCCTGTAGCGCTGTAACAAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGACTGCTGTGTGGCCATGGCCAGCTCCTGTAGCGCTGTAACAAAAGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATAGTGTGGGTGGAACTGCCAGCACGGGGAACCTCTCCAGCTCATTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATAGTGTGGGTGGAACTGCCAGCACGGGGAACCTCTCCAGCTCATTTATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAGATCCAGGGATATGATGTAGAGTTTGACCCACCCCTGGAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGAGATCCAGGGATATGATGTAGAGTTTGACCCACCCCTGGAAAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTATGAATGCCCCATCTGCTTGATGGCATTACGAGAAGCAGTGCAAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTATGAATGCCCCATCTGCTTGATGGCATTACGAGAAGCAGTGCAAACGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CATGCGGCCATAGGTTCTGCAAAGCCTGCATCATAAAATCAATAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100251 CATGCGGCCATAGGTTCTGCAAAGCCTGCATCATAAAATCAATAAGGTA.

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    297      GGATGCAGGTCACAAATGTCCAGTTGACAATGAAATACTGCTGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ..TAGGGATGCAGGTCACAAATGTCCAGTTGACAATGAAATACTGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAATCAACTATTTCCAGACAATTTTGCAAAACGTGAGATTCTTTCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102921 AAATCAACTATTTCCAGACAATTTTGCAAAACGTGAGATTCTTTCTCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGTGAAATGTCCAAATGAAGGTTGTTTGCACAAGATGGAACTGAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102971 TGGTGAAATGTCCAAATGAAGGTTGTTTGCACAAGATGGAACTGAGACAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTTGAG         GATCATCAAGCACATTGTGAGTTTGCTCTTATGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103021 CTTGAGGTA...TAGGATCATCAAGCACATTGTGAGTTTGCTCTTATGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTGTCCCCAATGCCAGCGTCCCTTCCAAAAATTCCATATTAATATTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104285 TTGTCCCCAATGCCAGCGTCCCTTCCAAAAATTCCATATTAATATTCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTCTGAAGGATTGTCCAAGGAGACAGGTTTCTTGTGACAACTGTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104335 TTCTGAAGGATTGTCCAAGGAGACAGGTTTCTTGTGACAACTGTGCTGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCAATGGCATTTGAAGATAAAGAG         ATCCATGACCAGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104385 TCAATGGCATTTGAAGATAAAGAGGCA...CAGATCCATGACCAGAACTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCCTTTGGCAAATGTCATCTGTGAATACTGCAATACTATACTCATCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106486 TCCTTTGGCAAATGTCATCTGTGAATACTGCAATACTATACTCATCAGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AACAG         ATGCCTAATCATTATGATCTAGACTGCCCTACAGCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106536 AACAGGTA...CAGATGCCTAATCATTATGATCTAGACTGCCCTACAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCAATTCCATGCACATTCAGTACTTTTGGTTGCCATGAAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 108924 CCAATTCCATGCACATTCAGTACTTTTGGTTGCCATGAAAAGGTA...TA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    757  ATGCAGAGGAATCACTTGGCACGCCACCTACAAGAGAACACCCAGTCAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110865 GATGCAGAGGAATCACTTGGCACGCCACCTACAAGAGAACACCCAGTCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACATGAGAATGTTGGCCCAGGCTGTTCATAGTTTGAGCGTTATACCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110915 ACATGAGAATGTTGGCCCAGGCTGTTCATAGTTTGAGCGTTATACCCGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TCTGGGTATATCTCAGAGGTCCGGAATTTCCAGGAAACTATTCACCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110965 TCTGGGTATATCTCAGAGGTCCGGAATTTCCAGGAAACTATTCACCAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGAGGGTCGCCTTGTAAGACAAGACCATCAAATCCGGGAGCTGACTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111015 AGAGGGTCGCCTTGTAAGACAAGACCATCAAATCCGGGAGCTGACTGCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AAATGGAAACTCAGAGTATGTATGTAAGTGAGCTCAAACGAACCATTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111065 AAATGGAAACTCAGAGTATGTATGTAAGTGAGCTCAAACGAACCATTCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACCCTTGAGGACAAAGTTGCTGAAATCGAAGCACAGCAGTGCAATGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111115 ACCCTTGAGGACAAAGTTGCTGAAATCGAAGCACAGCAGTGCAATGGAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TTATATTTGGAAGATTGGCAACTTTGGAATGCATTTGAAATGTCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111165 TTATATTTGGAAGATTGGCAACTTTGGAATGCATTTGAAATGTCAAGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGGAGAAACCTGTTGTGATTCATAGCCCTGGATTCTACACTGGCAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111215 AGGAGAAACCTGTTGTGATTCATAGCCCTGGATTCTACACTGGCAAACCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GGGTACAAACTGTGCATGCGCTTGCACCTTCAGTTACCGACTGCTCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111265 GGGTACAAACTGTGCATGCGCTTGCACCTTCAGTTACCGACTGCTCAGCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CTGTGCAAACTATATATCCCTTTTTGTCCACACAATGCAAGGAGAATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111315 CTGTGCAAACTATATATCCCTTTTTGTCCACACAATGCAAGGAGAATATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ACAGCCACCTCCCTTGGCCCTTCCAGGGTACAATACGCCTTACAATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111365 ACAGCCACCTCCCTTGGCCCTTCCAGGGTACAATACGCCTTACAATTCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GATCAGTCTGAAGCACCTGTAAGGCAAAACCACGAAGAGATAATGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111415 GATCAGTCTGAAGCACCTGTAAGGCAAAACCACGAAGAGATAATGGATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CAAACCAGAGCTGCTTGCTTTCCAGCGACCCACAATCCCACGGAACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111465 CAAACCAGAGCTGCTTGCTTTCCAGCGACCCACAATCCCACGGAACCCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AAGGTTTTGGCTATGTAACTTTTATGCATCTGGAAGCCCTAAGACAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111515 AAGGTTTTGGCTATGTAACTTTTATGCATCTGGAAGCCCTAAGACAAAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 ACTTTCATTAAGGATGACACATTATTAGTGCGCTGTGAGGTCTCCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111565 ACTTTCATTAAGGATGACACATTATTAGTGCGCTGTGAGGTCTCCACCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CTTTGACATGGGTAGCCTTCGGAGGGAGGGTTTTCAGCCACGAAGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111615 CTTTGACATGGGTAGCCTTCGGAGGGAGGGTTTTCAGCCACGAAGTACTG

   1600     .    :
   1556 ATGCAGGGGTA
        |||||||||||
 111665 ATGCAGGGGTA