seq1 = pF1KB5529.tfa, 900 bp
seq2 = pF1KB5529/gi568815576r_37731946.tfa (gi568815576r:37731946_37944238), 212293 bp

>pF1KB5529 900
>gi568815576r:37731946_37944238 (Chr22)

(complement)

1-328  (100001-100328)   100% ->
329-376  (104005-104052)   100% ->
377-475  (105641-105739)   100% ->
476-547  (110484-110555)   100% ->
548-595  (111033-111080)   100% ->
596-720  (111157-111281)   100% ->
721-828  (111495-111602)   100% ->
829-900  (112222-112293)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCGCCGCCGGGGACGCGGACGACGAGCCGCGCTCAGGCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCGCCGCCGGGGACGCGGACGACGAGCCGCGCTCAGGCCACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCTCGGAGGGCGAGTGCGCGGTGGCGCCGGAGCCGCTGACTGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCTCGGAGGGCGAGTGCGCGGTGGCGCCGGAGCCGCTGACTGACGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGCCTCTTCTCCTTCGCTGACTTCGGGTCTGCGCTGGGCGGCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGCCTCTTCTCCTTCGCTGACTTCGGGTCTGCGCTGGGCGGCGGCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGGCCTCTCGGGCCGGGCGTCCGGCGGGGCCCAGTCGCCGCTGCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGGGCCTCTCGGGCCGGGCGTCCGGCGGGGCCCAGTCGCCGCTGCGCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTGCACGTCCTGTGGCAGCAGGATGCGGAGCCGCGCGACGAGCTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTGCACGTCCTGTGGCAGCAGGATGCGGAGCCGCGCGACGAGCTGCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAAGATACCCGCTGGCCGGCTGAGGCGCGCTGCCAGGCCCCACCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAAGATACCCGCTGGCCGGCTGAGGCGCGCTGCCAGGCCCCACCGGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCGGGCCCACGGGCAAGGAGGTGCACG         CTCTGAAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100301 CTCGGGCCCACGGGCAAGGAGGTGCACGGTG...CAGCTCTGAAGAGACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAGGGACTCGGCCAATGCCAATGATGTGGAAACAG         TGCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104018 GAGGGACTCGGCCAATGCCAATGATGTGGAAACAGGTG...CAGTGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCTGCTGGAAGATGGCGCGGATCCCTGTGCAGCTGATGACAAGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105647 AGCTGCTGGAAGATGGCGCGGATCCCTGTGCAGCTGATGACAAGGGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACAGCTCTACACTTTGCCTCATGCAATGGCAATGACCAGATTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105697 ACAGCTCTACACTTTGCCTCATGCAATGGCAATGACCAGATTGGTG...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    476   TGCAGCTGCTCCTGGACCATGGTGCTGATCCTAACCAGCGAGATGGGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110482 AGTGCAGCTGCTCCTGGACCATGGTGCTGATCCTAACCAGCGAGATGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGGGAACACGCCACTGCACCTGG         CGGCCTGCACCAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 110532 TGGGGAACACGCCACTGCACCTGGGTA...CAGCGGCCTGCACCAACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTTCCTGTCATCACCACACTGCTACGAGGAG         GGGCCCGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 111050 GTTCCTGTCATCACCACACTGCTACGAGGAGGTA...CAGGGGCCCGTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGATGCCCTGGACCGAGCTGGTCGCACACCCCTGCACCTGGCCAAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111167 AGATGCCCTGGACCGAGCTGGTCGCACACCCCTGCACCTGGCCAAGTCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCTGAATATCCTGCAGGAGGGCCATGCCCAGTGCCTAGAGGCTGTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111217 AGCTGAATATCCTGCAGGAGGGCCATGCCCAGTGCCTAGAGGCTGTGCGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGGAGGTGAAGCAG         ATCATCCATATGCTGAGGGAGTATCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 111267 CTGGAGGTGAAGCAGGTG...CAGATCATCCATATGCTGAGGGAGTATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGAGCGCCTAGGGCAACATGAGCAGCGAGAACGCCTGGATGACCTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111521 GGAGCGCCTAGGGCAACATGAGCAGCGAGAACGCCTGGATGACCTCTGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCCGCCTGCAGATGACCAGTACCAAAGAGCAG         GTGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 111571 CCCGCCTGCAGATGACCAGTACCAAAGAGCAGGTG...CAGGTGGATGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTGACTGACCTCCTGGCCAGCTTCACCTCCCTCAGTCTGCAGATGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112231 GTGACTGACCTCCTGGCCAGCTTCACCTCCCTCAGTCTGCAGATGCAGAG

    950     .    :
    888 CATGGAGAAGAGG
        |||||||||||||
 112281 CATGGAGAAGAGG