seq1 = pF1KB5486.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KB5486/gi568815596f_10319758.tfa (gi568815596f:10319758_10526818), 207061 bp

>pF1KB5486 579
>gi568815596f:10319758_10526818 (Chr2)

1-378  (100001-100378)   100% ->
379-484  (103226-103331)   100% ->
485-579  (106967-107061)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAAACAGAACAGCAAGCTGCGGCCCGAGGTGCTGCAGGACCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAAACAGAACAGCAAGCTGCGGCCCGAGGTGCTGCAGGACCTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGAACACGGAGTTCACCGACCACGAGCTGCAGGAGTGGTACAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGAACACGGAGTTCACCGACCACGAGCTGCAGGAGTGGTACAAGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTCAAGGACTGCCCCACCGGCCACCTGACCGTGGACGAGTTCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTCAAGGACTGCCCCACCGGCCACCTGACCGTGGACGAGTTCAAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTACGCCAACTTCTTCCCCTACGGCGACGCTTCCAAGTTCGCCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCTACGCCAACTTCTTCCCCTACGGCGACGCTTCCAAGTTCGCCGAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTCTTCCGCACCTTCGACACCAACGGCGACGGCACCATCGACTTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTCTTCCGCACCTTCGACACCAACGGCGACGGCACCATCGACTTCCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTTCATCATTGCGCTGAGCGTGACCTCGCGGGGCAAGCTGGAGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTTCATCATTGCGCTGAGCGTGACCTCGCGGGGCAAGCTGGAGCAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCAAGTGGGCCTTCAGCATGTACGACCTGGACGGCAACGGCTACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCAAGTGGGCCTTCAGCATGTACGACCTGGACGGCAACGGCTACATCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGCAGCGAGATGCTGGAGATCGTGCAG         GCCATCTACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100351 CCGCAGCGAGATGCTGGAGATCGTGCAGGTA...CAGGCCATCTACAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGTGTCGTCTGTGATGAAGATGCCGGAGGATGAGTCCACCCCGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103239 TGGTGTCGTCTGTGATGAAGATGCCGGAGGATGAGTCCACCCCGGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGCACAGACAAGATCTTCAGGCAGATGGACACCAACAATGACG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103289 CGCACAGACAAGATCTTCAGGCAGATGGACACCAACAATGACGGTA...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    485   GCAAACTGTCCTTGGAAGAATTCATCAGAGGTGCCAAGAGCGACCCCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106965 AGGCAAACTGTCCTTGGAAGAATTCATCAGAGGTGCCAAGAGCGACCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    533 CCATCGTCCGCCTGCTGCAGTGCGACCCCAGCAGTGCCAGTCAGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107015 CCATCGTCCGCCTGCTGCAGTGCGACCCCAGCAGTGCCAGTCAGTTC