seq1 = pF1KB5419.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KB5419/gi568815597r_111399953.tfa (gi568815597r:111399953_111603354), 203402 bp

>pF1KB5419 954
>gi568815597r:111399953_111603354 (Chr1)

(complement)

1-350  (100001-100350)   100% ->
351-954  (102799-103402)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCAACAACAGCACTGCTCTGTCATTGGCCAATGTTACCTACATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCAACAACAGCACTGCTCTGTCATTGGCCAATGTTACCTACATCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGGAAATTTTCATTGGACTCTGCGCCATAGTGGGCAACGTGCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGGAAATTTTCATTGGACTCTGCGCCATAGTGGGCAACGTGCTGGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTGCGTGGTCAAGCTGAACCCCAGCCTGCAGACCACCACCTTCTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTGCGTGGTCAAGCTGAACCCCAGCCTGCAGACCACCACCTTCTATTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGTCTCTCTAGCCCTGGCTGACATTGCTGTTGGGGTGCTGGTCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGTCTCTCTAGCCCTGGCTGACATTGCTGTTGGGGTGCTGGTCATGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTGGCCATTGTTGTCAGCCTGGGCATCACAATCCACTTCTACAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTGGCCATTGTTGTCAGCCTGGGCATCACAATCCACTTCTACAGCTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTTTATGACTTGCCTACTGCTTATCTTTACCCACGCCTCCATCATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTTTATGACTTGCCTACTGCTTATCTTTACCCACGCCTCCATCATGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGCTGGCCATCGCTGTGGACCGATACTTGCGGGTCAAGCTTACCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGCTGGCCATCGCTGTGGACCGATACTTGCGGGTCAAGCTTACCGTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351          ATACAAGAGGGTCACCACTCACAGAAGAATATGGCTGGCCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTA...CAGATACAAGAGGGTCACCACTCACAGAAGAATATGGCTGGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGGCCTTTGCTGGCTGGTGTCATTCCTGGTGGGATTGACCCCCATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102840 TGGGCCTTTGCTGGCTGGTGTCATTCCTGGTGGGATTGACCCCCATGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGCTGGAACATGAAACTGACCTCAGAGTACCACAGAAATGTCACCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102890 GGCTGGAACATGAAACTGACCTCAGAGTACCACAGAAATGTCACCTTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTCATGCCAATTTGTTTCCGTCATGAGAATGGACTACATGGTATACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102940 TTCATGCCAATTTGTTTCCGTCATGAGAATGGACTACATGGTATACTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCTTCCTCACCTGGATTTTCATCCCCCTGGTTGTCATGTGCGCCATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102990 GCTTCCTCACCTGGATTTTCATCCCCCTGGTTGTCATGTGCGCCATCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTTGACATCTTTTACATCATTCGGAACAAACTCAGTCTGAACTTATCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103040 CTTGACATCTTTTACATCATTCGGAACAAACTCAGTCTGAACTTATCTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTCCAAAGAGACAGGTGCATTTTATGGACGGGAGTTCAAGACGGCTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103090 CTCCAAAGAGACAGGTGCATTTTATGGACGGGAGTTCAAGACGGCTAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCTTGTTTCTGGTTCTTTTCTTGTTTGCTCTGTCATGGCTGCCTTTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103140 CCTTGTTTCTGGTTCTTTTCTTGTTTGCTCTGTCATGGCTGCCTTTATCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATCATCAACTGCATCATCTACTTTAATGGTGAGGTACCACAGCTTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103190 ATCATCAACTGCATCATCTACTTTAATGGTGAGGTACCACAGCTTGTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GTACATGGGCATCCTGCTGTCCCATGCCAACTCCATGATGAACCCTATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103240 GTACATGGGCATCCTGCTGTCCCATGCCAACTCCATGATGAACCCTATCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCTATGCCTATAAAATAAAGAAGTTCAAGGAAACCTACCTTTTGATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103290 TCTATGCCTATAAAATAAAGAAGTTCAAGGAAACCTACCTTTTGATCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAAGCCTGTGTGGTCTGCCATCCCTCTGATTCTTTGGACACAAGCATTGA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103340 AAAGCTTGTGTGGTCTGCCATCCCTCTGATTCTTTGGACACAAGCATTGA

    950     .    :
    942 GAAGAATTCTGAG
        |||||||||||||
 103390 GAAGAATTCTGAG