seq1 = pF1KB5400.tfa, 1413 bp
seq2 = pF1KB5400/gi568815582r_69656538.tfa (gi568815582r:69656538_69857937), 201400 bp

>pF1KB5400 1413
>gi568815582r:69656538_69857937 (Chr16)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ==
82-1413  (100067-101400)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAGTAATAAAACTTTTAACTTGGAGAAGCAAAACCATACTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGAGTAATAAAACTTTTAACTTGGAGAAGCAAAACCATACTCCAAG

     50     .    :    .
     51 AAAGCATCATCAACAT
        ||||||||||||||||
 100051 AAAGCATCATCAACAT

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     82 CACCACCAGCAGCAACAGCAGCAGCCGCCACCACCGCCAATACCTGCAAA
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100067 CACCACCAGCAGCAACAGCTGCAGCCGCCACCACCGCCAATACCTGCAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    132 TGGGCAACAGGCCAGCAGCCAAAATGAAGGC TTGACTA TTGACCTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||| ||||||
 100117 TGGGCAACAGGCCAGCAGCCAAAATGAAGGCTTTGACTATTTGGCCTGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    180 GAATTTTAGAAAACCAGGAGAGAAGACCTTCACCCAACGAAGCCGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100167 GAATTTTAGAAAACCAGGAGAGAAGACCTTCACCCAACGAAGCCGTCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    230 TTGTGGGAAATCTTCCTCCCGACATCACTGAGGAAGAAATGAGGAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100217 TTGTGGGAAATCTTCCTCCCGACATCACTGAGGAAGAAATGAGGAAACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280 TTTGAGAAATATGGAAAGGCAGGCGAAGTCTTCATTCATAAGGATAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100267 TTTGAGAAATATGGAAAGGCAGGCGAAGTCTTCATTCATAAGGATTAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    330 ATTTGGCTTTATCCGCTTGGAAACCCGAACCCTAGCGGAGATTGCCAAAG
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
 100317 ATTTGGCTTTATCCGCTTGGAAACACGAACCCTAGCGGAGATTGCGAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    380 TGGAGCTGGACAATATGCCACTCCGTGGAAAGCAGCTGCGTGTGCGCTTT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100367 TGGAGCTGGACAATATGCCACTCTGTGGAAAGCAGCTGCGTGTGCGCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    430 GCCTGCCATAGTGCATCCCTTACAGTTCGAAACCTTCCTCAGTATGTGTC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100417 TCCTGCCATAGTGCATCCCTTACAGTTCGAAACCTTCCTCAGTATGTGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    480 CAACGAACTGCTGGAAGAAGCCTTTTCTGTGTTTGGCCAGGTAGAGAGGG
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100467 CAACGAAGTGCTGGAAGAAGCCTTTTCTGTGTTTGGCCAGGTAGAGAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    530 CTGTAGTCATTGTGGATGATCGAGGAAGGCCCTCAGGAAAAGGCATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100517 CTGTAGTCATTGTGGATGATCGAGGAAGGCCCTCAGGAAAAGGCATTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    580 GAGTTCTCAGGGAAGCCAGCTGCTCGGAAAGCTCTGGACAGATGCAGTGA
        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
 100567 GAGTTCTCAGGGAAGCCAGCTGCTGGGAAAGCTCTGGACAGACGCAGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    630 AGGCTCCTTCCTGCTAACCACATTTCCTCGTCCTGTGACTGTGGAGCCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100617 AGGCTCCTTCCTGCTAACCACATTTCCTCGTCCTGTGACTATGGAGCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    680 TGGACCAGTTAGATGATGAAGAGGGACTTCCAGAGAAGCTGGTTATAAAA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100667 TGGACCAGTTAGATGATGAAGGGGGACTTCCAGAGAAGCTGGTTATAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    730 AACCAGCAATTTCACAAGGAACGAGAGCAGCCACCCAGATTTGCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100717 AACCAGCAATTTCACAAGGAACGAGAGCAACCACCCAGATTTGCACAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    780 TGGCTCCTTTGAGTATGAATATGCCATGCGCTGGAAGGCACTCATTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100767 TGGCTCCTTTGAGTATGAATATGCCATGCGCTGGAAGGCACTCATTGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    830 TGGAGAAGCAGCAGCAGGACCAAGTGGACCGCAACATCAAGGAGGCTCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100817 TGGAGAAGCAGCAGCAGGACCAAGTGGACCGCAACATCAAAGAGGCTCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    880 GAGAAGCTGGAGATGGAGATGGAAGCTGCACGCCATGAGCACCAGGTCAT
        |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
 100867 GAGAAGCCAGAGATGGAGATGGAGGCTGCACGCCATAAGCACCAGGTCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    930 GCTAATGAGACAGGATTTGATGAGGCGCCAAGAAGAACTTCGGAGGATGG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100917 GCTAATGAGACAGAATTTGATGAGGCGCCAAGAAGAACTTCGGAGGATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    980 AAGAGCTGCACAACCAAGAGGTGCAAAAACGAAAGCAACTGGAGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100967 AAGAGCTGCACAACCAAGAGGTGCAAAAACGAAAGCAACTGGAGCTCAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1030 CAGGAGGAAGAGCGCAGGCGCCGTGAAGAAGAGATGCGGCGGCAGCAAGA
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 101017 CAGGAGGAAGAGCGCAGGCGCCCTGAAGAAGAGATGCGGCGGCAGCAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1080 AGAAATGATGCGGCGACAGCAGGAAGGATTCAAGGGAACCTTCCCTGATG
        ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101067 AGAAATGATGCAGCCACAGCAGGAAGGATTCAAGGGAACCTTCCCTGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1130 CGAGAGAGCAGGAGATTCGGATGGGTCAGATGGCTATGGGAGGTGCTATG
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101117 TGAGAGAGCAGGAGATTTGGATGGGTCAGATGGCTATGGGAGGTGCTATG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1180 GGCATAAACAACAGAGGTGCCATGCCCCCTGCTCCTGTGCCAGCTGGTAC
        |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
 101167 GGCATAAACAGCAGAGGTGCCTTGACCCCTGCTCCTGTGCCAGCTGGTAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1230 CCCAGCTCCTCCAGGACCTGCCACTATGATGCCGGATGGAACTTTGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101217 CCCAGCTCCTCCAGGACCTGCCACTATGATGCCGGATGGAACTTTGGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1280 TGACCCCACCAACAACTGAACGCTTTGGTCAGGCTGCTACAATGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101267 TGACCCCACCAACAACTGAACGCTTTGGTCAGGCTGCTACAATGGAAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1330 ATTGGGGCAATTGGTGGAACTCCTCCTGCATTCAACCGTGCAGCTCCTGG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
 101317 ATTGGGGCAATTGGTGAAACTCCTCCTGCATTCAACCATGCAGCTCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :
   1380 AGCTGAATTTGCCCCAAACAAACGTCGCCGATAC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||
 101367 AGCTGAATTTGCTCCAAACAAACGTCGCCGATAC