seq1 = pF1KB5363.tfa, 462 bp
seq2 = pF1KB5363/gi568815597f_51136757.tfa (gi568815597f:51136757_51371319), 234563 bp

>pF1KB5363 462
>gi568815597f:51136757_51371319 (Chr1)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-293  (133200-133369)   100% ->
294-462  (134395-134563)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAACTGCCTCAAATCCCCCACCTCGGATGACATCTCCCTGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAACTGCCTCAAATCCCCCACCTCGGATGACATCTCCCTGCTTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGTCTCAGTCCGACCGGGCTAGCTTTGGCGAGGGGACGGAGCCGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGTCTCAGTCCGACCGGGCTAGCTTTGGCGAGGGGACGGAGCCGGATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGCCGCCGCCGCCATATCAG         GAACAAGTTCCAGTTCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 AGGAGCCGCCGCCGCCATATCAGGTA...TAGGAACAAGTTCCAGTTCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCTACCACCCAACACCTAGCCAGACTCGGCTAGCAACTCAGCTGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133218 GTCTACCACCCAACACCTAGCCAGACTCGGCTAGCAACTCAGCTGACTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAGGAACAAATTAGGATAGCTCAAAGAATAGGTCTTATACAACATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133268 AGAGGAACAAATTAGGATAGCTCAAAGAATAGGTCTTATACAACATCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTAAAGGAGTTTATGACCCTGGAAGAGATGGATCAGAAAAAAAGATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133318 CTAAAGGAGTTTATGACCCTGGAAGAGATGGATCAGAAAAAAAGATCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GA         GTGTGTGATCTGTATGATGGACTTTGTTTATGGGGACCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133368 GAGTA...CAGGTGTGTGATCTGTATGATGGACTTTGTTTATGGGGACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AATTCGATTTCTGCCGTGCATGCACATCTATCACCTGGACTGTATAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134434 AATTCGATTTCTGCCGTGCATGCACATCTATCACCTGGACTGTATAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTGGTTGATGAGATCCTTCACGTGCCCCTCCTGCATGGAGCCAGTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134484 ACTGGTTGATGAGATCCTTCACGTGCCCCTCCTGCATGGAGCCAGTTGAT

    450     .    :    .    :    .    :
    433 GCAGCACTGCTTTCATCCTATGAGACTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 134534 GCAGCACTGCTTTCATCCTATGAGACTAAT