seq1 = pF1KB5317.tfa, 1176 bp
seq2 = pF1KB5317/gi568815587r_125348502.tfa (gi568815587r:125348502_125589777), 241276 bp

>pF1KB5317 1176
>gi568815587r:125348502_125589777 (Chr11)

(complement)

1-311  (100001-100311)   100% ->
312-411  (108145-108244)   100% ->
412-498  (126208-126294)   100% ->
499-667  (129112-129280)   100% ->
668-939  (133672-133943)   100% ->
940-1020  (135568-135648)   100% ->
1021-1096  (137369-137444)   100% ->
1097-1162  (141211-141276)   100% ->
1163-1176  (143667-143680)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCCCACTGGTGAGTCTGGATGAAGAGTTTGAGGACCTTCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCCCACTGGTGAGTCTGGATGAAGAGTTTGAGGACCTTCGACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCTGCTCGGAGGACCCGGAGGAGAAGCCCCAGTGTTTCTATGGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCTGCTCGGAGGACCCGGAGGAGAAGCCCCAGTGTTTCTATGGTTCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCCCCACCATCTCGAGGACCCCTCCCTCTCCGAGCTTGAGAATTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCCCCACCATCTCGAGGACCCCTCCCTCTCCGAGCTTGAGAATTTTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCGAAATAATCAGCTTCAAGTCCATGGAGGACCTCGTAAATGAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCGAAATAATCAGCTTCAAGTCCATGGAGGACCTCGTAAATGAATTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGAAGCTCAATGTCTGCTTTCGGAACTACAACGCCAAGACCGAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGAAGCTCAATGTCTGCTTTCGGAACTACAACGCCAAGACCGAGAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGCTCCCGTGAAGAACCAGTTACAGATCCAAGAGGAGGAGGAGACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAGCTCCCGTGAAGAACCAGTTACAGATCCAAGAGGAGGAGGAGACCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGACGAGGA         GGTTTGGGATGCTCTGACAGACAATTACAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGACGAGGAGTA...CAGGGTTTGGGATGCTCTGACAGACAATTACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCTTCACTCTCAGAAGACTGGAGGGATCCAAACATCGAGGCTCTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108175 CCCTTCACTCTCAGAAGACTGGAGGGATCCAAACATCGAGGCTCTGAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCAACTGCTCTGACACTGAG         ATCCATGAGAAAGAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 108225 GCAACTGCTCTGACACTGAGGTA...CAGATCCATGAGAAAGAAGAGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGTTCAATGAGAAGAGTGAAAATGATTCCGGTATCAACGAGGAGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126229 GAGTTCAATGAGAAGAGTGAAAATGATTCCGGTATCAACGAGGAGCCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCTCACAGCAGATCAG         GTAATTGAGGAGATTGAGGAAATGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 126279 GCTCACAGCAGATCAGGTA...CAGGTAATTGAGGAGATTGAGGAAATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCAGAACTCCCCAGACCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTTCTGGAAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129137 TGCAGAACTCCCCAGACCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTTCTGGAAGAAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GATGGAGGAGAAACTTCCTCCCAGGCAGACTCGGTCCTCCTGCAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129187 GATGGAGGAGAAACTTCCTCCCAGGCAGACTCGGTCCTCCTGCAGGAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCAGGCATTGACACAGACCTTCAACAACAACTGGTCCTATGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 129237 GCAGGCATTGACACAGACCTTCAACAACAACTGGTCCTATGAAGGTG...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    668    GGCTGAGGCACATGTCTGGGTCTGAGCTGACCGAGCTGCTGGACCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133669 CAGGGCTGAGGCACATGTCTGGGTCTGAGCTGACCGAGCTGCTGGACCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTGGAGGGTGCCATCCGTGACTTCTCGGAGGAGCTGGTGCAGCAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133719 GTGGAGGGTGCCATCCGTGACTTCTCGGAGGAGCTGGTGCAGCAGCTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCGCCGGGACGAGCTGGAGTTTGAGAAGGAAGTGAAGAACTCCTTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133769 CCGCCGGGACGAGCTGGAGTTTGAGAAGGAAGTGAAGAACTCCTTTATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CGGTGCTTATTGAGGTTCAGAACAAGCAGAAGGAGCAGCGAGAACTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133819 CGGTGCTTATTGAGGTTCAGAACAAGCAGAAGGAGCAGCGAGAACTGATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAAAAGAGGCGGAAAGAGAAAGGGCTGAGCCTGCAGAGCAGCCGGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133869 AAAAAGAGGCGGAAAGAGAAAGGGCTGAGCCTGCAGAGCAGCCGGATAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GAAGGGAAACCAGATGCCTCTCAAG         CGCTTCAGCATGGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 133919 GAAGGGAAACCAGATGCCTCTCAAGGTA...CAGCGCTTCAGCATGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCATCTCCAACATTCTGCAGAGTGGCATCCGCCAGACCTTTGGCTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135584 GCATCTCCAACATTCTGCAGAGTGGCATCCGCCAGACCTTTGGCTCCTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GGAACTGACAAACAG         TATCTGAACACAGTCATTCCTTACGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 135634 GGAACTGACAAACAGGTA...CAGTATCTGAACACAGTCATTCCTTACGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GAAGAAAGCCTCTCCTCCCTCAGTGGAAGACCTGCAGATGCTGACAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137395 GAAGAAAGCCTCTCCTCCCTCAGTGGAAGACCTGCAGATGCTGACAAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097          TTCTCTTTGCCATGAAGGAGGATAATGAGAAGGTGCCTACT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137445 GTG...TAGTTCTCTTTGCCATGAAGGAGGATAATGAGAAGGTGCCTACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1138 TTGCTAACGGACTACATTTTAAAAG         TGCTCTGCCCTACC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 141252 TTGCTAACGGACTACATTTTAAAAGGTA...CAGTGCTCTGCCCTACC