seq1 = pF1KB5292.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KB5292/gi568815587r_1653506.tfa (gi568815587r:1653506_1863859), 210354 bp

>pF1KB5292 1236
>gi568815587r:1653506_1863859 (Chr11)

(complement)

1-68  (100001-100068)   100% ->
69-228  (102392-102551)   100% ->
229-352  (104221-104344)   100% ->
353-471  (104773-104891)   100% ->
472-704  (106304-106536)   100% ->
705-827  (108832-108954)   100% ->
828-972  (109722-109866)   100% ->
973-1071  (109959-110057)   100% ->
1072-1236  (110190-110354)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCCCTCCAGCCTTCTGCCGCTCGCCCTCTGCCTGCTGGCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCCCTCCAGCCTTCTGCCGCTCGCCCTCTGCCTGCTGGCTGCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCTCCGCGCTCGTCAG         GATCCCGCTGCACAAGTTCACGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCTCCGCGCTCGTCAGGTG...CAGGATCCCGCTGCACAAGTTCACGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATCCGCCGGACCATGTCGGAGGTTGGGGGCTCTGTGGAGGACCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102415 CCATCCGCCGGACCATGTCGGAGGTTGGGGGCTCTGTGGAGGACCTGATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCAAAGGCCCCGTCTCAAAGTACTCCCAGGCGGTGCCAGCCGTGACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102465 GCCAAAGGCCCCGTCTCAAAGTACTCCCAGGCGGTGCCAGCCGTGACCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGGCCCATTCCCGAGGTGCTCAAGAACTACATGGAC         GCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102515 GGGGCCCATTCCCGAGGTGCTCAAGAACTACATGGACGTG...CAGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTACTACGGGGAGATTGGCATCGGGACGCCCCCCCAGTGCTTCACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104225 AGTACTACGGGGAGATTGGCATCGGGACGCCCCCCCAGTGCTTCACAGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCTTCGACACGGGCTCCTCCAACCTGTGGGTCCCCTCCATCCACTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104275 GTCTTCGACACGGGCTCCTCCAACCTGTGGGTCCCCTCCATCCACTGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTGCTGGACATCGCTTGCT         GGATCCACCACAAGTACAACA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104325 ACTGCTGGACATCGCTTGCTGTG...CAGGGATCCACCACAAGTACAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCGACAAGTCCAGCACCTACGTGAAGAATGGTACCTCGTTTGACATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104794 GCGACAAGTCCAGCACCTACGTGAAGAATGGTACCTCGTTTGACATCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATGGCTCGGGCAGCCTCTCCGGGTACCTGAGCCAGGACACTGTGTCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 104844 TATGGCTCGGGCAGCCTCTCCGGGTACCTGAGCCAGGACACTGTGTCGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472        GTGCCCTGCCAGTCAGCGTCGTCAGCCTCTGCCCTGGGCGGTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104894 G...CAGGTGCCCTGCCAGTCAGCGTCGTCAGCCTCTGCCCTGGGCGGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCAAAGTGGAGAGGCAGGTCTTTGGGGAGGCCACCAAGCAGCCAGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106347 TCAAAGTGGAGAGGCAGGTCTTTGGGGAGGCCACCAAGCAGCCAGGCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACCTTCATCGCAGCCAAGTTCGATGGCATCCTGGGCATGGCCTACCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106397 ACCTTCATCGCAGCCAAGTTCGATGGCATCCTGGGCATGGCCTACCCCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATCTCCGTCAACAACGTGCTGCCCGTCTTCGACAACCTGATGCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106447 CATCTCCGTCAACAACGTGCTGCCCGTCTTCGACAACCTGATGCAGCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCTGGTGGACCAGAACATCTTCTCCTTCTACCTGAGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106497 AGCTGGTGGACCAGAACATCTTCTCCTTCTACCTGAGCAGGTG...TAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GACCCAGATGCGCAGCCTGGGGGTGAGCTGATGCTGGGTGGCACAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108833 GACCCAGATGCGCAGCCTGGGGGTGAGCTGATGCTGGGTGGCACAGACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAGTATTACAAGGGTTCTCTGTCCTACCTGAATGTCACCCGCAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108883 CAAGTATTACAAGGGTTCTCTGTCCTACCTGAATGTCACCCGCAAGGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACTGGCAGGTCCACCTGGACCA         GGTGGAGGTGGCCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108933 ACTGGCAGGTCCACCTGGACCAGTG...CAGGGTGGAGGTGGCCAGCGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTGACCCTGTGCAAGGAGGGCTGTGAGGCCATTGTGGACACAGGCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109741 CTGACCCTGTGCAAGGAGGGCTGTGAGGCCATTGTGGACACAGGCACTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCTCATGGTGGGCCCGGTGGATGAGGTGCGCGAGCTGCAGAAGGCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109791 CCTCATGGTGGGCCCGGTGGATGAGGTGCGCGAGCTGCAGAAGGCCATCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GGGCCGTGCCGCTGATTCAGGGCGAG         TACATGATCCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 109841 GGGCCGTGCCGCTGATTCAGGGCGAGGTG...TAGTACATGATCCCCTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGAAGGTGTCCACCCTGCCCGCGATCACACTGAAGCTGGGAGGCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109974 GAGAAGGTGTCCACCCTGCCCGCGATCACACTGAAGCTGGGAGGCAAAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTACAAGCTGTCCCCAGAGGACTACACGCTCAAG         GTGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 110024 CTACAAGCTGTCCCCAGAGGACTACACGCTCAAGGTG...CAGGTGTCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGGCCGGGAAGACCCTCTGCCTGAGCGGCTTCATGGGCATGGACATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110197 AGGCCGGGAAGACCCTCTGCCTGAGCGGCTTCATGGGCATGGACATCCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCACCCAGCGGGCCACTCTGGATCCTGGGCGACGTCTTCATCGGCCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110247 CCACCCAGCGGGCCACTCTGGATCCTGGGCGACGTCTTCATCGGCCGCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CTACACTGTGTTTGACCGTGACAACAACAGGGTGGGCTTCGCCGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110297 CTACACTGTGTTTGACCGTGACAACAACAGGGTGGGCTTCGCCGAGGCTG

   1300     .
   1229 CCCGCCTC
        ||||||||
 110347 CCCGCCTC