seq1 = pF1KB5282.tfa, 675 bp
seq2 = pF1KB5282/gi568815588r_24749847.tfa (gi568815588r:24749847_25052575), 302729 bp

>pF1KB5282 675
>gi568815588r:24749847_25052575 (Chr10)

(complement)

1-48  (100001-100048)   100% ->
49-155  (110140-110246)   99% ->
156-339  (115209-115392)   100% ->
340-405  (180513-180578)   100% ->
406-423  (194167-194184)   100% ->
424-506  (195581-195663)   100% ->
507-553  (197212-197258)   100% ->
554-630  (201112-201188)   100% ->
631-675  (202685-202729)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGGAGCAGCGAGGAGGCGCCAGACTACGGGCGAGGCGTCGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100001 ATGGCCGGGAGCAGCGAGGAGGCGCCAGACTACGGGCGAGGCGTCGTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     49        ATTATGGATGATTGGCCAGGGTATGACTTGAATTTATTCACGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 A...CAGATTATGGATGATTGGCCAGGGTATGACTTGAATTTATTCACGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCCACAGCACTATTATGGAGACTGGGAGTATGTCCTCATCCCTCATGGT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 110183 ACCCACAGCACTATTATGGAGACTTGGAGTATGTCCTCATCCCTCATGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCATTGTGGACAG         AATTGAGCGGCTGGCCAAGGATATTAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110233 ATCATTGTGGACAGGTG...CAGAATTGAGCGGCTGGCCAAGGATATTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAAGACATAGGATATAGTGACATCATGGTCCTGTGTGTGCTTAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115236 GAAAGACATAGGATATAGTGACATCATGGTCCTGTGTGTGCTTAAAGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTTACAAATTCTGTGCTGATCTCGTAGAACACCTTAAGAACATCAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115286 GTTACAAATTCTGTGCTGATCTCGTAGAACACCTTAAGAACATCAGCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATTCAGATCGATTTGTCTCAATGAAGGTTGATTTCATCAGACTAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115336 AATTCAGATCGATTTGTCTCAATGAAGGTTGATTTCATCAGACTAAAAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTACAGG         AATGACCAGTCCATGGGTGAGATGCAGATAATCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115386 TTACAGGGTA...CAGAATGACCAGTCCATGGGTGAGATGCAGATAATCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGGCGATGATCTTTCAACGCTGGCTGGAAAG         AATGTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 180547 GAGGCGATGATCTTTCAACGCTGGCTGGAAAGGTT...CAGAATGTTCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATTGTTGAG         GATGTTGTCGGAACTGGGAGGACCATGAAAGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 194176 ATTGTTGAGGTA...AAGGATGTTGTCGGAACTGGGAGGACCATGAAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 ACTACTCAGCAATATAGAGAAATACAAGCCCAACATGATTAAGGTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195613 ACTACTCAGCAATATAGAGAAATACAAGCCCAACATGATTAAGGTAGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 G         TTTGTTGGTGAAGAGAACATCCAGAAGTGACGGCTTTAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195663 GGTG...TAGTTTGTTGGTGAAGAGAACATCCAGAAGTGACGGCTTTAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CCTGACT         ATGCTGGATTTGAGATTCCAAACTTATTTGTGGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197252 CCTGACTGTA...AAGATGCTGGATTTGAGATTCCAAACTTATTTGTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GGGATATGCCTTAGATTACAATGAATACTTCAGAGATCTGAAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 201146 GGGATATGCCTTAGATTACAATGAATACTTCAGAGATCTGAATGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    631   CACATATGCGTCATCAATGAGCACGGTAAAGAAAAATATCGAGTC
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202683 AGCACATATGCGTCATCAATGAGCACGGTAAAGAAAAATATCGAGTC