seq1 = pF1KB5208.tfa, 1107 bp
seq2 = pF1KB5208/gi568815581f_73069320.tfa (gi568815581f:73069320_73270426), 201107 bp

>pF1KB5208 1107
>gi568815581f:73069320_73270426 (Chr17)

1-1107  (100001-101107)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACATGGCGGATGAGCCACTCAATGGAAGCCACACATGGCTATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACATGGCGGATGAGCCACTCAATGGAAGCCACACATGGCTATCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCATTTGACCTCAATGGCTCTGTGGTGTCAACCAACACCTCAAACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCATTTGACCTCAATGGCTCTGTGGTGTCAACCAACACCTCAAACCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGAGCCGTACTATGACCTGACAAGCAATGCAGTCCTCACATTCATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGAGCCGTACTATGACCTGACAAGCAATGCAGTCCTCACATTCATCTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGTGGTCTGCATCATTGGGTTGTGTGGCAACACACTTGTCATTTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGTGGTCTGCATCATTGGGTTGTGTGGCAACACACTTGTCATTTATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATCCTCCGCTATGCCAAGATGAAGACCATCACCAACATTTACATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATCCTCCGCTATGCCAAGATGAAGACCATCACCAACATTTACATCCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGGCCATCGCAGATGAGCTCTTCATGCTGGGTCTGCCTTTCTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTGGCCATCGCAGATGAGCTCTTCATGCTGGGTCTGCCTTTCTTGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGCAGGTGGCTCTGGTCCACTGGCCCTTTGGCAAGGCCATTTGCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGCAGGTGGCTCTGGTCCACTGGCCCTTTGGCAAGGCCATTTGCCGGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTCATGACTGTGGATGGCATCAATCAGTTCACCAGCATCTTCTGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTCATGACTGTGGATGGCATCAATCAGTTCACCAGCATCTTCTGCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGTCATGAGCATCGACCGATACCTGGCTGTGGTCCACCCCATCAAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGTCATGAGCATCGACCGATACCTGGCTGTGGTCCACCCCATCAAGTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCAAGTGGAGGAGACCCCGGACGGCCAAGATGATCACCATGGCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCAAGTGGAGGAGACCCCGGACGGCCAAGATGATCACCATGGCTGTGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGAGTCTCTCTGCTGGTCATCTTGCCCATCATGATATATGCTGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGAGTCTCTCTGCTGGTCATCTTGCCCATCATGATATATGCTGGGCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGAGCAACCAGTGGGGGAGAAGCAGCTGCACCATCAACTGGCCAGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGAGCAACCAGTGGGGGAGAAGCAGCTGCACCATCAACTGGCCAGGTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTGGGGCTTGGTACACAGGGTTCATCATCTACACTTTCATTCTGGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTGGGGCTTGGTACACAGGGTTCATCATCTACACTTTCATTCTGGGGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTGGTACCCCTCACCATCATCTGTCTTTGCTACCTGTTCATTATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTGGTACCCCTCACCATCATCTGTCTTTGCTACCTGTTCATTATCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGTGAAGTCCTCTGGAATCCGAGTGGGCTCCTCTAAGAGGAAGAAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGTGAAGTCCTCTGGAATCCGAGTGGGCTCCTCTAAGAGGAAGAAGTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGAAGAAGGTCACCCGAATGGTGTCCATCGTGGTGGCTGTCTTCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGAAGAAGGTCACCCGAATGGTGTCCATCGTGGTGGCTGTCTTCATCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTGCTGGCTTCCCTTCTACATATTCAACGTTTCTTCCGTCTCCATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTGCTGGCTTCCCTTCTACATATTCAACGTTTCTTCCGTCTCCATGGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAGCCCCACCCCAGCCCTTAAAGGCATGTTTGACTTTGTGGTGGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAGCCCCACCCCAGCCCTTAAAGGCATGTTTGACTTTGTGGTGGTCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCTATGCTAACAGCTGTGCCAACCCTATCCTATATGCCTTCTTGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCTATGCTAACAGCTGTGCCAACCCTATCCTATATGCCTTCTTGTCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAACTTCAAGAAGAGCTTCCAGAATGTCCTCTGCTTGGTCAAGGTGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAACTTCAAGAAGAGCTTCCAGAATGTCCTCTGCTTGGTCAAGGTGAGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCACAGATGATGGGGAGCGGAGTGACAGTAAGCAGGACAAATCCCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCACAGATGATGGGGAGCGGAGTGACAGTAAGCAGGACAAATCCCGGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AATGAGACCACGGAGACCCAGAGGACCCTCCTCAATGGAGACCTCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AATGAGACCACGGAGACCCAGAGGACCCTCCTCAATGGAGACCTCCAAAC

   1100     .
   1101 CAGTATC
        |||||||
 101101 CAGTATC